62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3120 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3120  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  462  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1397  hypothetical protein  78.04 
 
 		 239 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2303  Uvs039  78.04 
 
 		 239 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0514  hypothetical protein  78.04 
 
 		 261 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0134  hypothetical protein  78.04 
 
 		 261 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1072  hypothetical protein  78.04 
 
 		 261 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0989  hypothetical protein  78.04 
 
 		 261 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.856623  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1479  hypothetical protein  78.04 
 
 		 261 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1692  hypothetical protein  77 
 
 		 239 aa  333  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3402  hypothetical protein  76.61 
 
 		 227 aa  332  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278918 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3056  hypothetical protein  75.23 
 
 		 227 aa  325  5e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3638  flavin-nucleotide-binding protein  56.54 
 
 		 216 aa  248  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3889  flavin-nucleotide-binding protein  56.54 
 
 		 216 aa  248  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2201  flavin-nucleotide-binding protein  56.8 
 
 		 216 aa  236  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.697368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4477  flavin-nucleotide-binding protein  61.29 
 
 		 189 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1909  hypothetical protein  55.22 
 
 		 214 aa  209  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1934  hypothetical protein  52.29 
 
 		 223 aa  208  7e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2299  hypothetical protein  50.24 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13866  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3493  hypothetical protein  53.89 
 
 		 220 aa  202  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693999  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2785  hypothetical protein  49.3 
 
 		 217 aa  198  7e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4532  hypothetical protein  51.18 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000555  predicted flavin-nucleotide-binding protein  45.54 
 
 		 218 aa  191  9e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05333  hypothetical protein  46.96 
 
 		 218 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1926  hypothetical protein  45.5 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1605  hypothetical protein  51.65 
 
 		 217 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3754  hypothetical protein  47.45 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7671  hypothetical protein  48.72 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6495  hypothetical protein  41.94 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1550  hypothetical protein  44.2 
 
 		 227 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0342013 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0558  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  44.22 
 
 		 208 aa  165  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0086  hypothetical protein  42.86 
 
 		 216 aa  163  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1387  hypothetical protein  41.63 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4187  hypothetical protein  46.67 
 
 		 212 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.877149  normal  0.040626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6845  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  45.11 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1567  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  47.25 
 
 		 292 aa  158  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.612765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1256  hypothetical protein  50.56 
 
 		 179 aa  156  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5990  hypothetical protein  47.15 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49040  hypothetical protein  42.29 
 
 		 223 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4542  hypothetical protein  48.63 
 
 		 219 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3004  hypothetical protein  46.97 
 
 		 234 aa  151  8.999999999999999e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2952  hypothetical protein  40.21 
 
 		 199 aa  149  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0647  flavin-nucleotide-binding protein  44.86 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5541  hypothetical protein  38.28 
 
 		 220 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.418646 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1192  hypothetical protein  37.5 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0972272  normal  0.237635 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3467  hypothetical protein  45.5 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0244411  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4367  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  44.2 
 
 		 220 aa  131  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1309  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN- binding  41.98 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.306682  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2142  hypothetical protein  42.92 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5579  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.5 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5287  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.5 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5199  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  37.5 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0082  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  40.82 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01781  conserved hypothetical protein  28.75 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2966  flavin-nucleotide-binding protein-like  38.76 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  26.54 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3858  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  27.14 
 
 		 184 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788225  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0041  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  23.68 
 
 		 152 aa  50.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1107  putative nitroimidazole resistance protein  29.37 
 
 		 154 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3154  putative nitroimidazole resistance protein  28.67 
 
 		 154 aa  46.2  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1549  antibiotic resistance protein  26.23 
 
 		 177 aa  42.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00340  hypothetical protein  27.75 
 
 		 277 aa  42.4  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2731  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  27.74 
 
 		 205 aa  42  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.560885  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>