68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05333 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05333  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  457  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000555  predicted flavin-nucleotide-binding protein  94.04 
 
 		 218 aa  434  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2785  hypothetical protein  42.45 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3056  hypothetical protein  49.72 
 
 		 227 aa  188  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3402  hypothetical protein  49.72 
 
 		 227 aa  187  8e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278918 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1692  hypothetical protein  45.12 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1397  hypothetical protein  43.26 
 
 		 239 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2303  Uvs039  43.26 
 
 		 239 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1479  hypothetical protein  42.86 
 
 		 261 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0989  hypothetical protein  42.86 
 
 		 261 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.856623  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1072  hypothetical protein  42.86 
 
 		 261 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0134  hypothetical protein  42.86 
 
 		 261 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0514  hypothetical protein  42.86 
 
 		 261 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3120  hypothetical protein  46.96 
 
 		 227 aa  177  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3889  flavin-nucleotide-binding protein  42.06 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3638  flavin-nucleotide-binding protein  42.06 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1934  hypothetical protein  42.11 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2201  flavin-nucleotide-binding protein  43.6 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.697368  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1605  hypothetical protein  41.26 
 
 		 217 aa  171  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4532  hypothetical protein  43.56 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1909  hypothetical protein  41.67 
 
 		 214 aa  169  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4477  flavin-nucleotide-binding protein  42.71 
 
 		 189 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2299  hypothetical protein  44.21 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13866  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1550  hypothetical protein  43.24 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0342013 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3493  hypothetical protein  40.39 
 
 		 220 aa  160  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693999  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0647  flavin-nucleotide-binding protein  42.11 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1926  hypothetical protein  38.65 
 
 		 219 aa  157  8e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6495  hypothetical protein  38.54 
 
 		 240 aa  157  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4542  hypothetical protein  42.11 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5990  hypothetical protein  40.38 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2952  hypothetical protein  37.7 
 
 		 199 aa  154  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7671  hypothetical protein  40 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1567  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  37.8 
 
 		 292 aa  148  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.612765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0558  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  38.71 
 
 		 208 aa  145  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0086  hypothetical protein  38.38 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3004  hypothetical protein  38.19 
 
 		 234 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3467  hypothetical protein  39.09 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0244411  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6845  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.67 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4187  hypothetical protein  37.37 
 
 		 212 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.877149  normal  0.040626 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1387  hypothetical protein  34.16 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61444  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1309  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN- binding  36.45 
 
 		 216 aa  126  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.306682  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3754  hypothetical protein  37.7 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49040  hypothetical protein  33.88 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5541  hypothetical protein  32.38 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.418646 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1256  hypothetical protein  37.91 
 
 		 179 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4367  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.33 
 
 		 220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1192  hypothetical protein  29.44 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0972272  normal  0.237635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5199  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  33.91 
 
 		 211 aa  104  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5287  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.91 
 
 		 211 aa  104  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5579  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.33 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2142  hypothetical protein  34.26 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2966  flavin-nucleotide-binding protein-like  36.13 
 
 		 222 aa  98.2  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.840561 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01781  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 		 266 aa  93.6  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345274 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0082  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  31.55 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  23.68 
 
 		 182 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000305005  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  24.84 
 
 		 176 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2339  hypothetical protein  24.68 
 
 		 168 aa  52  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1107  putative nitroimidazole resistance protein  25.44 
 
 		 154 aa  49.3  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2615  putative nitroimidazole resistance protein  21.85 
 
 		 152 aa  48.5  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3154  putative nitroimidazole resistance protein  25.68 
 
 		 154 aa  48.5  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0166  flavin-nucleotide-binding protein  24.83 
 
 		 157 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2063  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.06 
 
 		 155 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20286 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0219  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  21.85 
 
 		 157 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0759  putative 5-nitroimidazole antibiotic resistance  22.38 
 
 		 161 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.279608  normal  0.302454 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0746  putative cytoplasmic protein  22.38 
 
 		 161 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000242866  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0856  putative cytoplasmic protein  22.38 
 
 		 167 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.141086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0041  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  20.53 
 
 		 152 aa  43.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1296  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  22.07 
 
 		 157 aa  41.6  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.474408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>