70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2952 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2952  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000555  predicted flavin-nucleotide-binding protein  40.44 
 
 
218 aa  164  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1934  hypothetical protein  41.57 
 
 
223 aa  164  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135128  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05333  hypothetical protein  37.7 
 
 
218 aa  154  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2785  hypothetical protein  38.76 
 
 
217 aa  153  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4532  hypothetical protein  39.66 
 
 
220 aa  149  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427588  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3056  hypothetical protein  37.36 
 
 
227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3120  hypothetical protein  40.74 
 
 
227 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1605  hypothetical protein  37.7 
 
 
217 aa  143  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3402  hypothetical protein  38.07 
 
 
227 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.278918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7671  hypothetical protein  37.7 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4187  hypothetical protein  38.38 
 
 
212 aa  139  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.877149  normal  0.040626 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3638  flavin-nucleotide-binding protein  36.07 
 
 
216 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220848  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3889  flavin-nucleotide-binding protein  36.07 
 
 
216 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282164  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0647  flavin-nucleotide-binding protein  37.43 
 
 
229 aa  136  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0086  hypothetical protein  35.11 
 
 
216 aa  135  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3493  hypothetical protein  35.45 
 
 
220 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693999  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1909  hypothetical protein  37.43 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2299  hypothetical protein  37.57 
 
 
210 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13866  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2303  Uvs039  35.87 
 
 
239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1692  hypothetical protein  34.76 
 
 
239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1397  hypothetical protein  35.87 
 
 
239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1479  hypothetical protein  35.87 
 
 
261 aa  131  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0558  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  37.08 
 
 
208 aa  131  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0989  hypothetical protein  35.87 
 
 
261 aa  131  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.856623  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0514  hypothetical protein  35.87 
 
 
261 aa  131  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0134  hypothetical protein  35.87 
 
 
261 aa  131  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1072  hypothetical protein  35.87 
 
 
261 aa  131  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2201  flavin-nucleotide-binding protein  33.88 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.697368  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1926  hypothetical protein  35.14 
 
 
219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1387  hypothetical protein  35.39 
 
 
219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1567  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  36.31 
 
 
292 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.612765 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5990  hypothetical protein  34.39 
 
 
215 aa  123  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4542  hypothetical protein  36.02 
 
 
219 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5541  hypothetical protein  33.68 
 
 
220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.418646 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4477  flavin-nucleotide-binding protein  34.38 
 
 
189 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49040  hypothetical protein  34.83 
 
 
223 aa  118  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6495  hypothetical protein  33.92 
 
 
240 aa  118  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3467  hypothetical protein  36.13 
 
 
228 aa  118  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0244411  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1256  hypothetical protein  38.41 
 
 
179 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1192  hypothetical protein  32.37 
 
 
209 aa  115  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0972272  normal  0.237635 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6845  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.97 
 
 
241 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3754  hypothetical protein  30.34 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3004  hypothetical protein  32.84 
 
 
234 aa  105  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1550  hypothetical protein  31.22 
 
 
227 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0342013 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1309  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN- binding  33.54 
 
 
216 aa  91.7  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.306682  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2142  hypothetical protein  33.72 
 
 
226 aa  91.3  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2966  flavin-nucleotide-binding protein-like  32.56 
 
 
222 aa  88.2  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0082  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  27.66 
 
 
210 aa  85.9  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5579  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.14 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272111  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5287  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.14 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119354  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5199  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  33.14 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01781  conserved hypothetical protein  28.78 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0345274 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4367  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  28.19 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1107  putative nitroimidazole resistance protein  27.59 
 
 
154 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3154  putative nitroimidazole resistance protein  27.54 
 
 
154 aa  57  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  27.84 
 
 
176 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1549  antibiotic resistance protein  22.07 
 
 
177 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1156  nitroimidazole resistance protein, putative  26.92 
 
 
164 aa  50.1  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1961  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25 
 
 
157 aa  48.1  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988174  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3740  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  24.51 
 
 
150 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2731  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  26.54 
 
 
205 aa  46.6  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.560885  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2998  nitroimidazole resistance protein, putative  27.78 
 
 
180 aa  46.2  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06490  predicted flavin-nucleotide-binding protein  25.22 
 
 
165 aa  46.2  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  normal  0.449333 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1135  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  21.32 
 
 
152 aa  45.4  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.551955  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3004  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  25.78 
 
 
153 aa  44.7  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  22.88 
 
 
182 aa  45.1  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000305005  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1385  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  23.77 
 
 
153 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1948  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  24.34 
 
 
157 aa  42.4  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0449472  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1739  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  23.49 
 
 
163 aa  42  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>