62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1309 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1309  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN- binding  100 
 
 
216 aa  417  1e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.306682  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4367  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  51.71 
 
 
220 aa  176  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1550  hypothetical protein  46.19 
 
 
227 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0342013 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1605  hypothetical protein  45.32 
 
 
217 aa  151  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5990  hypothetical protein  42.23 
 
 
215 aa  144  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2785  hypothetical protein  40.38 
 
 
217 aa  144  9e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3004  hypothetical protein  46.24 
 
 
234 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4532  hypothetical protein  44.16 
 
 
220 aa  143  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427588  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4542  hypothetical protein  43.14 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3056  hypothetical protein  41.48 
 
 
227 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1934  hypothetical protein  38.14 
 
 
223 aa  139  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135128  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000555  predicted flavin-nucleotide-binding protein  37 
 
 
218 aa  137  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3120  hypothetical protein  41.81 
 
 
227 aa  136  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3402  hypothetical protein  40.34 
 
 
227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.278918 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3467  hypothetical protein  43.13 
 
 
228 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0244411  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7671  hypothetical protein  41.75 
 
 
214 aa  135  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3638  flavin-nucleotide-binding protein  40.29 
 
 
216 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220848  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3889  flavin-nucleotide-binding protein  40.29 
 
 
216 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282164  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2303  Uvs039  40.98 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1397  hypothetical protein  40.98 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1479  hypothetical protein  40.98 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0989  hypothetical protein  40.98 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.856623  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0514  hypothetical protein  40.98 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0134  hypothetical protein  40.98 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1072  hypothetical protein  40.98 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0082  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  42.23 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1692  hypothetical protein  40.98 
 
 
239 aa  132  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0558  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  43.26 
 
 
208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1567  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  40.5 
 
 
292 aa  132  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.612765 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2299  hypothetical protein  39.11 
 
 
210 aa  131  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13866  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1926  hypothetical protein  39.91 
 
 
219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1256  hypothetical protein  45.2 
 
 
179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0647  flavin-nucleotide-binding protein  40.1 
 
 
229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05333  hypothetical protein  36.45 
 
 
218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4477  flavin-nucleotide-binding protein  40.74 
 
 
189 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5541  hypothetical protein  34.48 
 
 
220 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.418646 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2201  flavin-nucleotide-binding protein  37.86 
 
 
216 aa  124  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.697368  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5579  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  40.49 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272111  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5199  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  40 
 
 
211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5287  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  40 
 
 
211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119354  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6495  hypothetical protein  35.86 
 
 
240 aa  111  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3493  hypothetical protein  36.19 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693999  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6845  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.87 
 
 
241 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4187  hypothetical protein  37.63 
 
 
212 aa  108  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.877149  normal  0.040626 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1192  hypothetical protein  33.51 
 
 
209 aa  108  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0972272  normal  0.237635 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1387  hypothetical protein  31.96 
 
 
219 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61444  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0086  hypothetical protein  34.21 
 
 
216 aa  97.8  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2952  hypothetical protein  33.15 
 
 
199 aa  97.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49040  hypothetical protein  31.61 
 
 
223 aa  95.1  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2142  hypothetical protein  37.25 
 
 
226 aa  93.6  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3754  hypothetical protein  33.89 
 
 
214 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1909  hypothetical protein  37.08 
 
 
214 aa  87  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2966  flavin-nucleotide-binding protein-like  36.15 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.840561 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01781  conserved hypothetical protein  27.47 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0345274 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  27.73 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0041  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.61 
 
 
152 aa  50.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295446  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2615  putative nitroimidazole resistance protein  23.61 
 
 
152 aa  46.2  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0078  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  23.13 
 
 
158 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00340  hypothetical protein  27.64 
 
 
277 aa  44.7  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1549  antibiotic resistance protein  24 
 
 
177 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1135  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25.23 
 
 
152 aa  42.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.551955  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3858  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  25.53 
 
 
184 aa  41.6  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>