76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5990 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5990  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0647  flavin-nucleotide-binding protein  62.86 
 
 		 229 aa  261  6.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4542  hypothetical protein  64.15 
 
 		 219 aa  248  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7671  hypothetical protein  58.49 
 
 		 214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5541  hypothetical protein  55.66 
 
 		 220 aa  231  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.418646 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1605  hypothetical protein  58.22 
 
 		 217 aa  230  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1256  hypothetical protein  63.58 
 
 		 179 aa  206  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1934  hypothetical protein  48.37 
 
 		 223 aa  203  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2785  hypothetical protein  47.85 
 
 		 217 aa  195  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2142  hypothetical protein  52.86 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4532  hypothetical protein  48.06 
 
 		 220 aa  184  8e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1567  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  49.05 
 
 		 292 aa  180  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.612765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0558  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  46.88 
 
 		 208 aa  178  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1550  hypothetical protein  45.41 
 
 		 227 aa  175  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0342013 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3004  hypothetical protein  54.12 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1926  hypothetical protein  47.4 
 
 		 219 aa  168  7e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4187  hypothetical protein  43.72 
 
 		 212 aa  164  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.877149  normal  0.040626 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3638  flavin-nucleotide-binding protein  44.85 
 
 		 216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3889  flavin-nucleotide-binding protein  44.85 
 
 		 216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000555  predicted flavin-nucleotide-binding protein  42.31 
 
 		 218 aa  161  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1192  hypothetical protein  38.92 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0972272  normal  0.237635 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3467  hypothetical protein  50.98 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0244411  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05333  hypothetical protein  40.38 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3493  hypothetical protein  41.31 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693999  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0086  hypothetical protein  39 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2201  flavin-nucleotide-binding protein  44.21 
 
 		 216 aa  154  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.697368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2299  hypothetical protein  43.23 
 
 		 210 aa  154  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13866  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3120  hypothetical protein  47.15 
 
 		 227 aa  151  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1387  hypothetical protein  39.9 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61444  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1909  hypothetical protein  43.68 
 
 		 214 aa  148  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3056  hypothetical protein  47.78 
 
 		 227 aa  148  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4477  flavin-nucleotide-binding protein  45.93 
 
 		 189 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6845  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  39.79 
 
 		 241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1692  hypothetical protein  47.28 
 
 		 239 aa  145  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2303  Uvs039  46.74 
 
 		 239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1397  hypothetical protein  46.74 
 
 		 239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0514  hypothetical protein  45.55 
 
 		 261 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0134  hypothetical protein  45.55 
 
 		 261 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1479  hypothetical protein  45.55 
 
 		 261 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0989  hypothetical protein  45.55 
 
 		 261 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.856623  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1072  hypothetical protein  45.55 
 
 		 261 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49040  hypothetical protein  38.83 
 
 		 223 aa  144  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3402  hypothetical protein  46.11 
 
 		 227 aa  144  9e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3754  hypothetical protein  40 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4367  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  44.93 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1309  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN- binding  43.68 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.306682  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6495  hypothetical protein  37.88 
 
 		 240 aa  134  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2952  hypothetical protein  34.39 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0082  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  42.37 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5199  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  41.12 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5287  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  41.12 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5579  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  40.1 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2966  flavin-nucleotide-binding protein-like  45.8 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.840561 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01781  conserved hypothetical protein  32.86 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345274 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  29.66 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1107  putative nitroimidazole resistance protein  34.06 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3154  putative nitroimidazole resistance protein  34.31 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2731  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  33.33 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.560885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2615  putative nitroimidazole resistance protein  26.03 
 
 		 152 aa  61.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0289  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  28.8 
 
 		 157 aa  57  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0041  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  23.73 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2339  hypothetical protein  26.19 
 
 		 168 aa  54.3  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0166  flavin-nucleotide-binding protein  20.61 
 
 		 157 aa  52.4  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0219  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  24.59 
 
 		 157 aa  52  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1135  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  21.31 
 
 		 152 aa  49.7  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.551955  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0759  putative 5-nitroimidazole antibiotic resistance  24.31 
 
 		 161 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.279608  normal  0.302454 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1986  putative nitroimidazole resistance protein  22.49 
 
 		 171 aa  45.8  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0856  putative cytoplasmic protein  23.61 
 
 		 167 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.141086  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1407  nitroimidazole resistance protein, putative  27.5 
 
 		 178 aa  45.8  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.460048 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2417  nitroimidazole resistance protein, putative  23.97 
 
 		 158 aa  45.4  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608683  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0807  hypothetical protein  22.92 
 
 		 167 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0262203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0746  putative cytoplasmic protein  22.92 
 
 		 161 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000242866  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0820  hypothetical protein  22.92 
 
 		 167 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.11136 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00340  hypothetical protein  26.8 
 
 		 277 aa  43.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1007  hypothetical protein  27.37 
 
 		 154 aa  42  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.596538 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1104  nitroimidazole resistance protein, putative  22.78 
 
 		 156 aa  41.6  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>