78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1605 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1605  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  426  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7671  hypothetical protein  68.25 
 
 
214 aa  288  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1256  hypothetical protein  72.78 
 
 
179 aa  248  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0647  flavin-nucleotide-binding protein  62.5 
 
 
229 aa  245  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5990  hypothetical protein  58.22 
 
 
215 aa  230  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4542  hypothetical protein  61.03 
 
 
219 aa  228  5e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1934  hypothetical protein  50.24 
 
 
223 aa  218  7e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135128  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5541  hypothetical protein  51.64 
 
 
220 aa  210  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.418646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2785  hypothetical protein  51.64 
 
 
217 aa  210  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2142  hypothetical protein  61.24 
 
 
226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4532  hypothetical protein  52 
 
 
220 aa  199  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427588  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1567  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  52.5 
 
 
292 aa  197  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.612765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4187  hypothetical protein  49.49 
 
 
212 aa  191  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.877149  normal  0.040626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0558  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  49.48 
 
 
208 aa  187  9e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1387  hypothetical protein  44.5 
 
 
219 aa  186  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61444  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3493  hypothetical protein  45.59 
 
 
220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693999  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1692  hypothetical protein  54.64 
 
 
239 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1397  hypothetical protein  51.56 
 
 
239 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000555  predicted flavin-nucleotide-binding protein  43.2 
 
 
218 aa  180  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2303  Uvs039  51.56 
 
 
239 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1479  hypothetical protein  51.56 
 
 
261 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0989  hypothetical protein  51.56 
 
 
261 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.856623  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1072  hypothetical protein  51.56 
 
 
261 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0134  hypothetical protein  51.56 
 
 
261 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0514  hypothetical protein  51.56 
 
 
261 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3889  flavin-nucleotide-binding protein  48.44 
 
 
216 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282164  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3638  flavin-nucleotide-binding protein  48.44 
 
 
216 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220848  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49040  hypothetical protein  44.12 
 
 
223 aa  178  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1926  hypothetical protein  47.69 
 
 
219 aa  177  8e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6495  hypothetical protein  44.12 
 
 
240 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3056  hypothetical protein  53.04 
 
 
227 aa  175  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0086  hypothetical protein  40.1 
 
 
216 aa  175  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3120  hypothetical protein  51.65 
 
 
227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3754  hypothetical protein  43.78 
 
 
214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3402  hypothetical protein  51.93 
 
 
227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.278918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1550  hypothetical protein  49.07 
 
 
227 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0342013 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05333  hypothetical protein  41.26 
 
 
218 aa  171  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3467  hypothetical protein  51.74 
 
 
228 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0244411  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2201  flavin-nucleotide-binding protein  47.15 
 
 
216 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.697368  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1909  hypothetical protein  48.69 
 
 
214 aa  168  6e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3004  hypothetical protein  49.01 
 
 
234 aa  168  7e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4477  flavin-nucleotide-binding protein  48.82 
 
 
189 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6845  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  42.16 
 
 
241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2299  hypothetical protein  43.01 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13866  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1192  hypothetical protein  37.3 
 
 
209 aa  145  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0972272  normal  0.237635 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2952  hypothetical protein  37.7 
 
 
199 aa  143  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1309  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN- binding  45.74 
 
 
216 aa  142  4e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.306682  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4367  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  42.16 
 
 
220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0082  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  44.79 
 
 
210 aa  124  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5199  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  42.41 
 
 
211 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5287  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  42.41 
 
 
211 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119354  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5579  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  42.41 
 
 
211 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272111  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2966  flavin-nucleotide-binding protein-like  40.71 
 
 
222 aa  109  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.840561 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01781  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
266 aa  94.4  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0345274 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3154  putative nitroimidazole resistance protein  35.17 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1107  putative nitroimidazole resistance protein  34.48 
 
 
154 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  27.33 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1739  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.86 
 
 
163 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044515  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2615  putative nitroimidazole resistance protein  28.47 
 
 
152 aa  57.8  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1135  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25.83 
 
 
152 aa  53.5  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.551955  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2731  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  31.82 
 
 
205 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.560885  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0820  hypothetical protein  26.28 
 
 
167 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.11136 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.03 
 
 
182 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000305005  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0759  putative 5-nitroimidazole antibiotic resistance  26.28 
 
 
161 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.279608  normal  0.302454 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0746  putative cytoplasmic protein  26.28 
 
 
161 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000242866  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0856  putative cytoplasmic protein  26.28 
 
 
167 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.141086  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2417  nitroimidazole resistance protein, putative  25.53 
 
 
158 aa  45.1  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608683  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0807  hypothetical protein  25.55 
 
 
167 aa  45.1  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0262203  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1549  antibiotic resistance protein  26.67 
 
 
177 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3858  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  26.35 
 
 
184 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788225  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0041  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  22.37 
 
 
152 aa  43.5  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295446  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0078  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.59 
 
 
158 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0350  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  21.19 
 
 
170 aa  43.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.123938  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0166  flavin-nucleotide-binding protein  21.05 
 
 
157 aa  42.4  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1948  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25.81 
 
 
157 aa  42.4  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0449472  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2326  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.85 
 
 
156 aa  42  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1961  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  22.82 
 
 
157 aa  41.6  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988174  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1104  nitroimidazole resistance protein, putative  27.15 
 
 
156 aa  41.6  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>