117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2615 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2615  putative nitroimidazole resistance protein  100 
 
 
152 aa  313  8e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  57.24 
 
 
176 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0041  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  36.84 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295446  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0166  flavin-nucleotide-binding protein  34.23 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3154  putative nitroimidazole resistance protein  34.75 
 
 
154 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0289  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  37.01 
 
 
157 aa  100  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1135  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.53 
 
 
152 aa  97.1  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.551955  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1107  putative nitroimidazole resistance protein  33.09 
 
 
154 aa  97.1  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0219  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  31.17 
 
 
157 aa  94.4  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2417  nitroimidazole resistance protein, putative  31.37 
 
 
158 aa  90.1  9e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608683  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1953  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  25.97 
 
 
163 aa  85.5  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.406915  normal  0.0305712 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0856  putative cytoplasmic protein  30.32 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.141086  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0759  putative 5-nitroimidazole antibiotic resistance  30.32 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.279608  normal  0.302454 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0746  putative cytoplasmic protein  30.32 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000242866  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0820  hypothetical protein  29.68 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.11136 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0078  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  30.16 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0807  hypothetical protein  29.68 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0262203  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.11 
 
 
158 aa  80.9  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2998  nitroimidazole resistance protein, putative  32.26 
 
 
180 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1549  antibiotic resistance protein  27.74 
 
 
177 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000305005  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1296  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.81 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.474408  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1620  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.14 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2339  hypothetical protein  33.12 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0526  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2326  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.71 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1163  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.5 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00783233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1739  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.1 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044515  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1948  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.23 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0449472  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6845  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.15 
 
 
241 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2063  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25.66 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.20286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2299  hypothetical protein  29.73 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13866  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1385  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  36.94 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1227  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.07 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0424349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6495  hypothetical protein  26.49 
 
 
240 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0350  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  26.45 
 
 
170 aa  62.8  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.123938  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2785  hypothetical protein  28.57 
 
 
217 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5990  hypothetical protein  26.03 
 
 
215 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1104  nitroimidazole resistance protein, putative  28.03 
 
 
156 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1926  hypothetical protein  30.32 
 
 
219 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3754  hypothetical protein  30.77 
 
 
214 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1106  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.29 
 
 
216 aa  59.3  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1961  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.15 
 
 
157 aa  58.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988174  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49040  hypothetical protein  27.97 
 
 
223 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1605  hypothetical protein  28.47 
 
 
217 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0087  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.76 
 
 
154 aa  57.4  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3517  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  30.72 
 
 
154 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0426327  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1387  hypothetical protein  28.67 
 
 
219 aa  56.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61444  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3191  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  35.62 
 
 
77 aa  57  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4187  hypothetical protein  26.58 
 
 
212 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.877149  normal  0.040626 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0247  LexA DNA-binding domain protein  26.14 
 
 
233 aa  55.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1550  hypothetical protein  26.75 
 
 
227 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0342013 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20760  predicted flavin-nucleotide-binding protein  26.8 
 
 
167 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06490  predicted flavin-nucleotide-binding protein  25.16 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  normal  0.449333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1934  hypothetical protein  26.55 
 
 
223 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135128  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000555  predicted flavin-nucleotide-binding protein  22.52 
 
 
218 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7671  hypothetical protein  25.64 
 
 
214 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4532  hypothetical protein  23.84 
 
 
220 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427588  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3868  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  24.52 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1007  hypothetical protein  25.2 
 
 
154 aa  53.9  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.596538 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0471  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.74 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0514663  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4542  hypothetical protein  25.81 
 
 
219 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3858  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  25.6 
 
 
184 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788225  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2966  flavin-nucleotide-binding protein-like  26.71 
 
 
222 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3004  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  27.42 
 
 
153 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0322  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  27.64 
 
 
159 aa  51.6  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346639  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1201  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  27.14 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2086  hypothetical protein  27.1 
 
 
158 aa  51.2  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.58745 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1397  hypothetical protein  26.57 
 
 
239 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2303  Uvs039  26.57 
 
 
239 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4477  flavin-nucleotide-binding protein  26.72 
 
 
189 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3889  flavin-nucleotide-binding protein  26.09 
 
 
216 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282164  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0514  hypothetical protein  26.57 
 
 
261 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0134  hypothetical protein  26.57 
 
 
261 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1072  hypothetical protein  26.57 
 
 
261 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0989  hypothetical protein  26.57 
 
 
261 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.856623  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1479  hypothetical protein  26.57 
 
 
261 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3638  flavin-nucleotide-binding protein  26.09 
 
 
216 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220848  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3056  hypothetical protein  27.74 
 
 
227 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3493  hypothetical protein  23.84 
 
 
220 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693999  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05333  hypothetical protein  21.85 
 
 
218 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1362  flavin-nucleotide-binding protein  28.57 
 
 
199 aa  48.9  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1192  hypothetical protein  26.27 
 
 
209 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0972272  normal  0.237635 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1692  hypothetical protein  27.03 
 
 
239 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1437  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.5 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3402  hypothetical protein  26.28 
 
 
227 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.278918 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0823  putative nitroimidazole resistance protein  26.38 
 
 
172 aa  47  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0109955  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3548  hypothetical protein  35.62 
 
 
142 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0035  hypothetical protein  29.7 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2995  hypothetical protein  31.68 
 
 
165 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0647  flavin-nucleotide-binding protein  22.7 
 
 
229 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0558  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  22.52 
 
 
208 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5541  hypothetical protein  21.3 
 
 
220 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.418646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4880  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  26 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.746169 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1137  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.32 
 
 
158 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.329696  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1794  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.32 
 
 
158 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.109434  unclonable  0.00000000507783 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0096  flavin-nucleotide-binding protein  26.61 
 
 
195 aa  43.9  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000283829  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2731  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  26.28 
 
 
205 aa  43.9  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.560885  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1407  nitroimidazole resistance protein, putative  34.43 
 
 
178 aa  43.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.460048 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1213  hypothetical protein  29.82 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0272669 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>