67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0647 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0647  flavin-nucleotide-binding protein  100 
 
 
229 aa  448  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4542  hypothetical protein  68.47 
 
 
219 aa  270  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5990  hypothetical protein  62.86 
 
 
215 aa  261  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1605  hypothetical protein  62.5 
 
 
217 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7671  hypothetical protein  60.48 
 
 
214 aa  231  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5541  hypothetical protein  55.92 
 
 
220 aa  221  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.418646 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1256  hypothetical protein  65.52 
 
 
179 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1934  hypothetical protein  48.8 
 
 
223 aa  205  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135128  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4187  hypothetical protein  51.17 
 
 
212 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.877149  normal  0.040626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1567  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  50 
 
 
292 aa  189  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.612765 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2785  hypothetical protein  46.86 
 
 
217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4532  hypothetical protein  46.86 
 
 
220 aa  179  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427588  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2142  hypothetical protein  53.81 
 
 
226 aa  179  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1926  hypothetical protein  48.19 
 
 
219 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000555  predicted flavin-nucleotide-binding protein  42.58 
 
 
218 aa  165  6.9999999999999995e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0558  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  42.51 
 
 
208 aa  162  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05333  hypothetical protein  42.11 
 
 
218 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3467  hypothetical protein  49.3 
 
 
228 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0244411  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1550  hypothetical protein  42.15 
 
 
227 aa  155  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0342013 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1909  hypothetical protein  43.9 
 
 
214 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3004  hypothetical protein  49.27 
 
 
234 aa  153  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1387  hypothetical protein  38.28 
 
 
219 aa  152  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61444  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2201  flavin-nucleotide-binding protein  40.82 
 
 
216 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.697368  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3889  flavin-nucleotide-binding protein  40.21 
 
 
216 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282164  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3638  flavin-nucleotide-binding protein  40.21 
 
 
216 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220848  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0514  hypothetical protein  43.95 
 
 
261 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0134  hypothetical protein  43.95 
 
 
261 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1072  hypothetical protein  43.95 
 
 
261 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0989  hypothetical protein  43.95 
 
 
261 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.856623  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1479  hypothetical protein  43.95 
 
 
261 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1692  hypothetical protein  44.93 
 
 
239 aa  144  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49040  hypothetical protein  37.32 
 
 
223 aa  143  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3402  hypothetical protein  44.5 
 
 
227 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.278918 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1397  hypothetical protein  44.44 
 
 
239 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2303  Uvs039  44.44 
 
 
239 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2299  hypothetical protein  42.64 
 
 
210 aa  143  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13866  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3056  hypothetical protein  45.9 
 
 
227 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3120  hypothetical protein  44.86 
 
 
227 aa  141  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3493  hypothetical protein  39.32 
 
 
220 aa  141  8e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693999  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6845  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  36.73 
 
 
241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0086  hypothetical protein  33.81 
 
 
216 aa  138  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2952  hypothetical protein  37.43 
 
 
199 aa  136  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3754  hypothetical protein  37.56 
 
 
214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1192  hypothetical protein  31.5 
 
 
209 aa  134  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0972272  normal  0.237635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6495  hypothetical protein  35.48 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4477  flavin-nucleotide-binding protein  38.37 
 
 
189 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4367  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  42.44 
 
 
220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1309  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN- binding  41.08 
 
 
216 aa  122  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.306682  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0082  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  39.89 
 
 
210 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2966  flavin-nucleotide-binding protein-like  42.55 
 
 
222 aa  106  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.840561 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01781  conserved hypothetical protein  31.6 
 
 
266 aa  104  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0345274 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5199  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  37.44 
 
 
211 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5287  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.44 
 
 
211 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119354  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5579  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.44 
 
 
211 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272111  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1107  putative nitroimidazole resistance protein  33.79 
 
 
154 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3154  putative nitroimidazole resistance protein  31.72 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  28.28 
 
 
176 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0041  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  23.61 
 
 
152 aa  55.5  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295446  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2731  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  31.21 
 
 
205 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.560885  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1739  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  24.29 
 
 
163 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044515  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0166  flavin-nucleotide-binding protein  19.67 
 
 
157 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0746  putative cytoplasmic protein  22.88 
 
 
161 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000242866  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1135  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  20.83 
 
 
152 aa  44.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.551955  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2615  putative nitroimidazole resistance protein  22.7 
 
 
152 aa  44.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0289  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  25.4 
 
 
157 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2417  nitroimidazole resistance protein, putative  22.13 
 
 
158 aa  43.9  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608683  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1549  antibiotic resistance protein  23.88 
 
 
177 aa  42.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>