74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4477 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3638  flavin-nucleotide-binding protein  100 
 
 
216 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220848  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3889  flavin-nucleotide-binding protein  100 
 
 
216 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282164  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4477  flavin-nucleotide-binding protein  100 
 
 
189 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2201  flavin-nucleotide-binding protein  85.11 
 
 
216 aa  343  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.697368  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1692  hypothetical protein  62.77 
 
 
239 aa  245  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1397  hypothetical protein  60.11 
 
 
239 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2303  Uvs039  60.11 
 
 
239 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1479  hypothetical protein  60.11 
 
 
261 aa  237  8e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0989  hypothetical protein  60.11 
 
 
261 aa  237  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.856623  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1072  hypothetical protein  60.11 
 
 
261 aa  237  8e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0134  hypothetical protein  60.11 
 
 
261 aa  237  8e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0514  hypothetical protein  60.11 
 
 
261 aa  237  8e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3120  hypothetical protein  60.75 
 
 
227 aa  225  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3056  hypothetical protein  60.11 
 
 
227 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3402  hypothetical protein  59.57 
 
 
227 aa  220  8e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.278918 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1909  hypothetical protein  52.87 
 
 
214 aa  182  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000555  predicted flavin-nucleotide-binding protein  46.24 
 
 
218 aa  176  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1934  hypothetical protein  46.07 
 
 
223 aa  174  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135128  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2785  hypothetical protein  43.46 
 
 
217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4532  hypothetical protein  49.1 
 
 
220 aa  167  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427588  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05333  hypothetical protein  42.71 
 
 
218 aa  167  8e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7671  hypothetical protein  44.62 
 
 
214 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1605  hypothetical protein  48.82 
 
 
217 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1926  hypothetical protein  41.08 
 
 
219 aa  157  9e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0558  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  42.54 
 
 
208 aa  155  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2299  hypothetical protein  42.11 
 
 
210 aa  150  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13866  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1192  hypothetical protein  37.91 
 
 
209 aa  149  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0972272  normal  0.237635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5990  hypothetical protein  45.93 
 
 
215 aa  147  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6495  hypothetical protein  39.89 
 
 
240 aa  144  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0086  hypothetical protein  40.96 
 
 
216 aa  144  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1256  hypothetical protein  45.68 
 
 
179 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3493  hypothetical protein  40.45 
 
 
220 aa  142  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693999  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4187  hypothetical protein  39.2 
 
 
212 aa  141  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.877149  normal  0.040626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6845  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  40.59 
 
 
241 aa  141  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1567  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  40.53 
 
 
292 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.612765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1550  hypothetical protein  43.08 
 
 
227 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0342013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4542  hypothetical protein  39.89 
 
 
219 aa  135  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3754  hypothetical protein  38.69 
 
 
214 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0647  flavin-nucleotide-binding protein  38.37 
 
 
229 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4367  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  42.86 
 
 
220 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1309  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN- binding  40.74 
 
 
216 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.306682  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49040  hypothetical protein  38.51 
 
 
223 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1387  hypothetical protein  36.02 
 
 
219 aa  122  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5541  hypothetical protein  34.04 
 
 
220 aa  121  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.418646 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3004  hypothetical protein  40 
 
 
234 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2952  hypothetical protein  34.38 
 
 
199 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3467  hypothetical protein  38.98 
 
 
228 aa  118  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0244411  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2142  hypothetical protein  39.05 
 
 
226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5199  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  35.83 
 
 
211 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5287  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.83 
 
 
211 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119354  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5579  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.29 
 
 
211 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272111  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2966  flavin-nucleotide-binding protein-like  41.88 
 
 
222 aa  100  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.840561 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01781  conserved hypothetical protein  28.77 
 
 
266 aa  97.1  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0345274 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0082  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  34.27 
 
 
210 aa  95.9  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3858  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  27.56 
 
 
184 aa  61.6  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788225  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0219  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  28.17 
 
 
157 aa  53.9  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  24.19 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3154  putative nitroimidazole resistance protein  28.04 
 
 
154 aa  52.4  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0166  flavin-nucleotide-binding protein  24.75 
 
 
157 aa  52  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1107  putative nitroimidazole resistance protein  26.61 
 
 
154 aa  51.6  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0041  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  23.31 
 
 
152 aa  51.6  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295446  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25.16 
 
 
182 aa  51.6  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000305005  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2615  putative nitroimidazole resistance protein  26.72 
 
 
152 aa  50.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0078  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  24.6 
 
 
158 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2339  hypothetical protein  26.11 
 
 
168 aa  50.1  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20760  predicted flavin-nucleotide-binding protein  27.2 
 
 
167 aa  47.8  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00340  hypothetical protein  33.04 
 
 
277 aa  45.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0746  putative cytoplasmic protein  24.06 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000242866  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0350  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  20.59 
 
 
170 aa  43.5  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.123938  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0759  putative 5-nitroimidazole antibiotic resistance  24.06 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.279608  normal  0.302454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0820  hypothetical protein  24.06 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.11136 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0856  putative cytoplasmic protein  24.06 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.141086  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2998  nitroimidazole resistance protein, putative  31.87 
 
 
180 aa  42  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0807  hypothetical protein  22.56 
 
 
167 aa  41.6  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0262203  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>