67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3402 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3402  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278918 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3056  hypothetical protein  94.27 
 
 		 227 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1692  hypothetical protein  79.07 
 
 		 239 aa  354  5e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1397  hypothetical protein  78.95 
 
 		 239 aa  348  5e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2303  Uvs039  78.95 
 
 		 239 aa  348  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0514  hypothetical protein  78.95 
 
 		 261 aa  347  7e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0134  hypothetical protein  78.95 
 
 		 261 aa  347  7e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1072  hypothetical protein  78.95 
 
 		 261 aa  347  7e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0989  hypothetical protein  78.95 
 
 		 261 aa  347  7e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.856623  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1479  hypothetical protein  78.95 
 
 		 261 aa  347  7e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3120  hypothetical protein  76.61 
 
 		 227 aa  343  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3638  flavin-nucleotide-binding protein  56.48 
 
 		 216 aa  247  9e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3889  flavin-nucleotide-binding protein  56.48 
 
 		 216 aa  247  9e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2201  flavin-nucleotide-binding protein  57.48 
 
 		 216 aa  238  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.697368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4477  flavin-nucleotide-binding protein  59.57 
 
 		 189 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1909  hypothetical protein  57.22 
 
 		 214 aa  209  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2299  hypothetical protein  54.04 
 
 		 210 aa  209  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13866  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000555  predicted flavin-nucleotide-binding protein  52.46 
 
 		 218 aa  202  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2785  hypothetical protein  50.48 
 
 		 217 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05333  hypothetical protein  50.27 
 
 		 218 aa  192  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1934  hypothetical protein  46.26 
 
 		 223 aa  189  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4532  hypothetical protein  51.06 
 
 		 220 aa  184  8e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1605  hypothetical protein  52.17 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3493  hypothetical protein  49.73 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693999  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7671  hypothetical protein  50.54 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1550  hypothetical protein  44.39 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0342013 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0558  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  45.23 
 
 		 208 aa  168  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1387  hypothetical protein  43 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61444  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1926  hypothetical protein  44.34 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3754  hypothetical protein  46.08 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6495  hypothetical protein  43.24 
 
 		 240 aa  165  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4187  hypothetical protein  44.56 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.877149  normal  0.040626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6845  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  40.89 
 
 		 241 aa  158  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4542  hypothetical protein  47.14 
 
 		 219 aa  155  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3004  hypothetical protein  46.97 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49040  hypothetical protein  42.08 
 
 		 223 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1567  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  41.59 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.612765 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0086  hypothetical protein  39.15 
 
 		 216 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5990  hypothetical protein  46.45 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0647  flavin-nucleotide-binding protein  44.33 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2952  hypothetical protein  37.64 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5541  hypothetical protein  39.89 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.418646 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1256  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  138  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1192  hypothetical protein  36.98 
 
 		 209 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0972272  normal  0.237635 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3467  hypothetical protein  43.72 
 
 		 228 aa  132  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0244411  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1309  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN- binding  40.62 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.306682  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4367  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  41.44 
 
 		 220 aa  125  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2142  hypothetical protein  43.35 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5199  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  36.32 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5287  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  36.32 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5579  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.85 
 
 		 211 aa  118  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0082  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  41.07 
 
 		 210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01781  conserved hypothetical protein  29.79 
 
 		 266 aa  102  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2966  flavin-nucleotide-binding protein-like  38.76 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  26.45 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3858  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  25.58 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1107  putative nitroimidazole resistance protein  29.57 
 
 		 154 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3154  putative nitroimidazole resistance protein  29.82 
 
 		 154 aa  48.9  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2615  putative nitroimidazole resistance protein  26.28 
 
 		 152 aa  47.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00340  hypothetical protein  28.64 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0041  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  23.19 
 
 		 152 aa  45.8  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  24.5 
 
 		 182 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000305005  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0746  putative cytoplasmic protein  25.68 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000242866  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0856  putative cytoplasmic protein  24.49 
 
 		 167 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.141086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0166  flavin-nucleotide-binding protein  22.86 
 
 		 157 aa  42.4  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0078  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  30.09 
 
 		 158 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0759  putative 5-nitroimidazole antibiotic resistance  25 
 
 		 161 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.279608  normal  0.302454 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>