68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3467 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3467  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0244411  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3004  hypothetical protein  74.77 
 
 		 234 aa  318  3.9999999999999996e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1605  hypothetical protein  52.24 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7671  hypothetical protein  47.55 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4542  hypothetical protein  53.08 
 
 		 219 aa  169  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5990  hypothetical protein  51.47 
 
 		 215 aa  168  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4187  hypothetical protein  44.65 
 
 		 212 aa  167  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.877149  normal  0.040626 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0647  flavin-nucleotide-binding protein  49.32 
 
 		 229 aa  167  9e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1934  hypothetical protein  43 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1256  hypothetical protein  52.05 
 
 		 179 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0558  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  44.08 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000555  predicted flavin-nucleotide-binding protein  41.12 
 
 		 218 aa  151  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4532  hypothetical protein  44.83 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1567  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  46.23 
 
 		 292 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.612765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6495  hypothetical protein  42.36 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2785  hypothetical protein  43.72 
 
 		 217 aa  148  8e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5541  hypothetical protein  43.05 
 
 		 220 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.418646 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05333  hypothetical protein  39.59 
 
 		 218 aa  144  8.000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2201  flavin-nucleotide-binding protein  40.45 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.697368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3056  hypothetical protein  45.21 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3889  flavin-nucleotide-binding protein  39.71 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3638  flavin-nucleotide-binding protein  39.71 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1387  hypothetical protein  37.38 
 
 		 219 aa  138  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61444  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1309  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN- binding  43.37 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.306682  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3120  hypothetical protein  46.03 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6845  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  39.8 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1550  hypothetical protein  44.93 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0342013 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3402  hypothetical protein  44.62 
 
 		 227 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278918 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1926  hypothetical protein  37.85 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1692  hypothetical protein  43.6 
 
 		 239 aa  135  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1072  hypothetical protein  41.59 
 
 		 261 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0989  hypothetical protein  41.59 
 
 		 261 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.856623  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1479  hypothetical protein  41.59 
 
 		 261 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0134  hypothetical protein  41.59 
 
 		 261 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0514  hypothetical protein  41.59 
 
 		 261 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1397  hypothetical protein  41.59 
 
 		 239 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2303  Uvs039  41.59 
 
 		 239 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3493  hypothetical protein  40.2 
 
 		 220 aa  134  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693999  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2142  hypothetical protein  46.54 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2299  hypothetical protein  44.04 
 
 		 210 aa  133  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13866  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49040  hypothetical protein  36.99 
 
 		 223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1909  hypothetical protein  48.97 
 
 		 214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4477  flavin-nucleotide-binding protein  40.11 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2952  hypothetical protein  36.08 
 
 		 199 aa  124  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3754  hypothetical protein  37.69 
 
 		 214 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1192  hypothetical protein  32.84 
 
 		 209 aa  121  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0972272  normal  0.237635 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0086  hypothetical protein  36.41 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5199  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  40.62 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5287  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  40.62 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5579  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  39.73 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4367  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  40.29 
 
 		 220 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0082  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  40.2 
 
 		 210 aa  111  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2966  flavin-nucleotide-binding protein-like  35.47 
 
 		 222 aa  102  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.840561 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01781  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345274 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  28.48 
 
 		 176 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3154  putative nitroimidazole resistance protein  30.26 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1107  putative nitroimidazole resistance protein  29.33 
 
 		 154 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0041  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25 
 
 		 152 aa  53.9  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2339  hypothetical protein  25.32 
 
 		 168 aa  53.1  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1135  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  24.37 
 
 		 152 aa  50.1  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.551955  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3740  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25.89 
 
 		 150 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3858  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  23.33 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788225  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0166  flavin-nucleotide-binding protein  25.66 
 
 		 157 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.41 
 
 		 182 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000305005  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00340  hypothetical protein  32.64 
 
 		 277 aa  45.8  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2326  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.81 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0219  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  20.65 
 
 		 157 aa  42.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2417  nitroimidazole resistance protein, putative  23.42 
 
 		 158 aa  41.6  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>