86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1549 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1549  antibiotic resistance protein  100 
 
 
177 aa  372  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  46.15 
 
 
182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000305005  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0041  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.45 
 
 
152 aa  84.3  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295446  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1296  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.5 
 
 
157 aa  82  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.474408  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0078  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31.75 
 
 
158 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0166  flavin-nucleotide-binding protein  29.37 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2615  putative nitroimidazole resistance protein  27.74 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0289  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  33.33 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1007  hypothetical protein  31.82 
 
 
154 aa  77  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.596538 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1948  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.1 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0449472  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2326  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.23 
 
 
156 aa  72  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3858  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  29.92 
 
 
184 aa  71.2  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788225  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  29.17 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1961  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.63 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988174  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.17 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1227  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.75 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0424349 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1106  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.38 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1620  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.88 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06490  predicted flavin-nucleotide-binding protein  28.57 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  normal  0.449333 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2998  nitroimidazole resistance protein, putative  32.03 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1135  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.06 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.551955  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20760  predicted flavin-nucleotide-binding protein  30 
 
 
167 aa  63.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1163  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.9 
 
 
157 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00783233  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0350  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  32.67 
 
 
170 aa  62.8  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.123938  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1739  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.71 
 
 
163 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044515  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3004  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  29.13 
 
 
153 aa  61.2  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0096  flavin-nucleotide-binding protein  29.55 
 
 
195 aa  60.1  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000283829  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2063  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  28.8 
 
 
155 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.20286 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0247  LexA DNA-binding domain protein  30.91 
 
 
233 aa  58.2  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3154  putative nitroimidazole resistance protein  31.96 
 
 
154 aa  57.8  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0558  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  28.57 
 
 
208 aa  57.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0759  putative 5-nitroimidazole antibiotic resistance  30.33 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.279608  normal  0.302454 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0322  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  22.78 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346639  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0856  putative cytoplasmic protein  30.33 
 
 
167 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.141086  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1387  hypothetical protein  26.98 
 
 
219 aa  55.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61444  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0820  hypothetical protein  30.33 
 
 
167 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.11136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6495  hypothetical protein  33.33 
 
 
240 aa  55.5  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1953  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  28.93 
 
 
163 aa  55.5  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.406915  normal  0.0305712 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0807  hypothetical protein  30.33 
 
 
167 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0262203  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4542  hypothetical protein  27.56 
 
 
219 aa  55.1  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49040  hypothetical protein  29.51 
 
 
223 aa  55.1  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2417  nitroimidazole resistance protein, putative  29.27 
 
 
158 aa  55.1  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608683  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0746  putative cytoplasmic protein  29.51 
 
 
161 aa  54.3  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000242866  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0087  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.47 
 
 
154 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2299  hypothetical protein  30.48 
 
 
210 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13866  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7671  hypothetical protein  28.36 
 
 
214 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1385  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  21.56 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2966  flavin-nucleotide-binding protein-like  30 
 
 
222 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3740  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  24.84 
 
 
150 aa  52.4  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1192  hypothetical protein  27.2 
 
 
209 aa  52.4  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0972272  normal  0.237635 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2339  hypothetical protein  28.69 
 
 
168 aa  52.4  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4532  hypothetical protein  26.61 
 
 
220 aa  52  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427588  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6845  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.25 
 
 
241 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3191  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  30.56 
 
 
77 aa  51.6  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1104  nitroimidazole resistance protein, putative  31.4 
 
 
156 aa  51.2  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1107  putative nitroimidazole resistance protein  28.87 
 
 
154 aa  51.2  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2952  hypothetical protein  22.07 
 
 
199 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2785  hypothetical protein  23.97 
 
 
217 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1926  hypothetical protein  26.83 
 
 
219 aa  48.9  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0471  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  24 
 
 
142 aa  48.9  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0514663  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0526  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.46 
 
 
153 aa  48.5  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1934  hypothetical protein  28.21 
 
 
223 aa  48.9  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135128  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0219  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  28.7 
 
 
157 aa  47  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3517  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.72 
 
 
154 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0426327  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2141  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  32.08 
 
 
171 aa  45.4  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3868  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  27.13 
 
 
153 aa  45.1  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3493  hypothetical protein  25.2 
 
 
220 aa  45.1  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693999  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0693  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  21.21 
 
 
150 aa  44.7  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1605  hypothetical protein  26.67 
 
 
217 aa  44.7  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3754  hypothetical protein  29.9 
 
 
214 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0082  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  26.55 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1567  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  25.98 
 
 
292 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.612765 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0048  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
359 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4250  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  26.24 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0060  GCN5-related N-acetyltransferase  31.46 
 
 
361 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.461775  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0044  GCN5-related N-acetyltransferase  33.75 
 
 
355 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1550  hypothetical protein  26.09 
 
 
227 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0342013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0647  flavin-nucleotide-binding protein  23.88 
 
 
229 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1256  hypothetical protein  27 
 
 
179 aa  42.4  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5541  hypothetical protein  20.97 
 
 
220 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.418646 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3909  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  31.82 
 
 
153 aa  42  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.748529  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4187  hypothetical protein  30.61 
 
 
212 aa  42  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.877149  normal  0.040626 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1909  hypothetical protein  26.05 
 
 
214 aa  41.6  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1986  putative nitroimidazole resistance protein  26.06 
 
 
171 aa  41.2  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1806  nitroimidazole resistance protein, putative  23.61 
 
 
171 aa  41.2  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000286648  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3782  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  26.88 
 
 
187 aa  40.8  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>