59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2063 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2063  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  100 
 
 		 155 aa  309  7.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20286 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1385  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  32.89 
 
 		 153 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0041  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000305005  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1135  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  24.49 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.551955  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0166  flavin-nucleotide-binding protein  25.97 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1407  nitroimidazole resistance protein, putative  30.06 
 
 		 178 aa  67.4  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.460048 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3154  putative nitroimidazole resistance protein  28.87 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2615  putative nitroimidazole resistance protein  25.66 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1107  putative nitroimidazole resistance protein  28.17 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0289  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  29.22 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0219  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  24.52 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  30.72 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0087  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.57 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1986  putative nitroimidazole resistance protein  24.4 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1156  nitroimidazole resistance protein, putative  24.39 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25.32 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1549  antibiotic resistance protein  28.8 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3868  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  25.95 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1620  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  24.03 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1104  nitroimidazole resistance protein, putative  26.8 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1227  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.77 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0424349 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2417  nitroimidazole resistance protein, putative  29.27 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608683  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2141  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  28.12 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0823  putative nitroimidazole resistance protein  25 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0109955  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3858  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  26.25 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788225  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1806  nitroimidazole resistance protein, putative  26.47 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000286648  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0096  flavin-nucleotide-binding protein  24 
 
 		 195 aa  53.9  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000283829  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0078  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  32.28 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3517  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.92 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0426327  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000555  predicted flavin-nucleotide-binding protein  24.03 
 
 		 218 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1007  hypothetical protein  28.1 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.596538 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20760  predicted flavin-nucleotide-binding protein  27.68 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1909  hypothetical protein  31.15 
 
 		 214 aa  48.5  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05333  hypothetical protein  26.06 
 
 		 218 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2966  flavin-nucleotide-binding protein-like  28.91 
 
 		 222 aa  47.4  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0350  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  19.38 
 
 		 170 aa  46.2  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.123938  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2339  hypothetical protein  24.35 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2731  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  29.3 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.560885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2299  hypothetical protein  31.71 
 
 		 210 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13866  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0082  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  30.91 
 
 		 210 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0746  putative cytoplasmic protein  27.83 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000242866  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1824  hypothetical protein  23.35 
 
 		 176 aa  44.3  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06490  predicted flavin-nucleotide-binding protein  26.19 
 
 		 165 aa  44.3  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  normal  0.449333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1192  hypothetical protein  25 
 
 		 209 aa  43.9  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0972272  normal  0.237635 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6845  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.34 
 
 		 241 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0247  LexA DNA-binding domain protein  23.23 
 
 		 233 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1948  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.05 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0449472  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1934  hypothetical protein  23.77 
 
 		 223 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0322  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  24.44 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346639  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0820  hypothetical protein  26.96 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.11136 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0526  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  22.88 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0759  putative 5-nitroimidazole antibiotic resistance  26.96 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.279608  normal  0.302454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6495  hypothetical protein  26.98 
 
 		 240 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0856  putative cytoplasmic protein  26.96 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.141086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4532  hypothetical protein  28.57 
 
 		 220 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0807  hypothetical protein  26.09 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0262203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3004  hypothetical protein  32.59 
 
 		 234 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1961  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  23.97 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>