53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6269 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6269  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  100 
 
 		 151 aa  318  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341844  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2284  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  47.95 
 
 		 149 aa  150  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.145472  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0864  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  45.14 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1820  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.33 
 
 		 144 aa  94.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1372  hypothetical protein  30.61 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.823726  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1328  hypothetical protein  29.93 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4880  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  32.21 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.746169 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0471  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.87 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0514663  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3548  hypothetical protein  34.29 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3740  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.39 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0166  flavin-nucleotide-binding protein  26.62 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0066  hypothetical protein  32.53 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.905175  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0289  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  40.68 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0097  hypothetical protein  29.41 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.578349  hitchhiker  0.00635148 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2995  hypothetical protein  33.8 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0657  hypothetical protein  28.92 
 
 		 160 aa  51.2  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.52348  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2326  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.99 
 
 		 156 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1794  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.14 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.109434  unclonable  0.00000000507783 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1137  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  30.14 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.329696  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0412  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.77 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0738895  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  31.03 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468979  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0982  hypothetical protein  28.74 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175108 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2085  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.58 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000125188 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2086  hypothetical protein  28.74 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.58745 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1739  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.8 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044515  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0873  hypothetical protein  36.76 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04380  predicted flavin-nucleotide-binding protein  36.23 
 
 		 174 aa  47.4  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0353  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  27.69 
 
 		 135 aa  47.4  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.934539  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1296  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.6 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.474408  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0247  LexA DNA-binding domain protein  27.15 
 
 		 233 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  31.75 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1131  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.29 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3292  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  28.71 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000330862  normal  0.034856 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0041  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  23.6 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1948  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  23.4 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0449472  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1429  hypothetical protein  28.24 
 
 		 184 aa  45.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1961  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  22.58 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988174  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1213  hypothetical protein  27.06 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0272669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0947  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31.33 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.011553  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0952  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  32.53 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1135  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31.15 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.551955  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0917  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.23 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.688385  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0633  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.38 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429345  normal  0.0292132 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0035  hypothetical protein  27.59 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.37 
 
 		 158 aa  41.6  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1002  hypothetical protein  25.74 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45242  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0526  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.71 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1068  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  30.11 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000115819  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2615  putative nitroimidazole resistance protein  29.17 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2174  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.49 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1387  hypothetical protein  24.37 
 
 		 219 aa  40.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61444  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0384  hypothetical protein  26.55 
 
 		 135 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0163229  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0393  hypothetical protein  26.55 
 
 		 135 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.831448  normal  0.755308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>