More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3473 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
289 aa  547  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.105519  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6934  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  47.2 
 
 
289 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0574886  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8235  ABC transporter, permease protein  48.19 
 
 
306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.01 
 
 
309 aa  189  5e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  39.8 
 
 
287 aa  181  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.32 
 
 
319 aa  178  9e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
290 aa  176  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
294 aa  169  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.49 
 
 
309 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.849073  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.27 
 
 
320 aa  165  9e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.253823  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03080  permease component of ABC-type sugar transporter  37.59 
 
 
322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
312 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
308 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.48209 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
309 aa  162  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.98 
 
 
290 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0905  transmembrane permease MsmF  33.33 
 
 
289 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0122469  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.97 
 
 
305 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0388505  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2978  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
289 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.64 
 
 
318 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.106475 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
299 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.456499 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
299 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.52 
 
 
296 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515819  normal  0.562108 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
309 aa  159  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.75 
 
 
304 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44429  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
320 aa  159  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.305055  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6585  lactose transport system (permease)  39.38 
 
 
306 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
319 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.255158 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.85 
 
 
303 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0695484  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.1 
 
 
308 aa  157  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.05 
 
 
311 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17058  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.29 
 
 
313 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.737632 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.27 
 
 
296 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3942  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.17 
 
 
321 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.108149  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.46 
 
 
292 aa  156  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 
307 aa  156  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000296099  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
307 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0563  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.96 
 
 
294 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22835  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.81 
 
 
319 aa  155  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
309 aa  155  8e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.114297  normal  0.0929805 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
291 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2587  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
314 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000137508  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 
320 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.71 
 
 
295 aa  154  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
298 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15070  permease component of ABC-type sugar transporter  38.31 
 
 
311 aa  152  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0771026  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
296 aa  152  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000144721  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11550  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.66 
 
 
354 aa  152  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.0144146 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
309 aa  152  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3650  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  32.63 
 
 
315 aa  152  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0685768 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
328 aa  152  8.999999999999999e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.913769 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
315 aa  151  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
299 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.426381  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
317 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
296 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
305 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
330 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
329 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.811614  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
309 aa  150  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.179346  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 
309 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  35.48 
 
 
288 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.13 
 
 
318 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1486  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  31.05 
 
 
309 aa  150  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0456684  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
306 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31530  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.92 
 
 
313 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.68002  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0238  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
329 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3250  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  32.04 
 
 
310 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.07 
 
 
293 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2847  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
305 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.661532 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.68 
 
 
289 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5138  ABC transporter membrane spanning protein (maltose)  35.63 
 
 
275 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.566756  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.69 
 
 
294 aa  149  4e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000558297  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  31.82 
 
 
318 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5674  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
319 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0325503  normal  0.167 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
310 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181942  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 
315 aa  149  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
310 aa  149  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27710  permease component of ABC-type sugar transporter  34.27 
 
 
294 aa  149  8e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5460  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.06 
 
 
334 aa  148  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0810  ABC-type sugar transport system, permease component  32.74 
 
 
283 aa  148  9e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
328 aa  148  9e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.00155627 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
306 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28370  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.18 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.096742  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.67 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.648492  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.14 
 
 
315 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.744275  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2471  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.12566 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.42 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283647  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07100  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.38 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.790586  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
305 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1290  ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 
311 aa  146  5e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
312 aa  145  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.308461  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0295  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  33.92 
 
 
300 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.37 
 
 
315 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.442716 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.06 
 
 
293 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00259426  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
309 aa  145  9e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.43514  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.39 
 
 
332 aa  144  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.21 
 
 
321 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>