More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6934 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6934  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
289 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0574886  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.2 
 
 
289 aa  225  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.105519  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8235  ABC transporter, permease protein  41.73 
 
 
306 aa  195  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03080  permease component of ABC-type sugar transporter  40.29 
 
 
322 aa  176  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
328 aa  171  9e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.00155627 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.85 
 
 
309 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
296 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515819  normal  0.562108 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
330 aa  165  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  36.97 
 
 
288 aa  165  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
312 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31530  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.23 
 
 
313 aa  159  7e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.68002  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
309 aa  158  9e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.179346  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
319 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.255158 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11550  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.74 
 
 
354 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.0144146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  34.17 
 
 
318 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.77 
 
 
306 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0924232  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
309 aa  153  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.849073  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3250  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  34.63 
 
 
310 aa  152  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27710  permease component of ABC-type sugar transporter  33.33 
 
 
294 aa  151  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
307 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000296099  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 
290 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1361  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
315 aa  150  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193472  normal  0.165724 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
307 aa  149  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
306 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.692762  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  33.81 
 
 
307 aa  149  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.93 
 
 
296 aa  149  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.648492  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 
295 aa  148  8e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
320 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.305055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
296 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000144721  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.18 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.16 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.86 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000506379  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.5 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.130846  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.52 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0388505  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
315 aa  146  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18898  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
315 aa  146  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
317 aa  146  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0810  ABC-type sugar transport system, permease component  30.21 
 
 
283 aa  145  5e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
306 aa  145  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1486  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  29.62 
 
 
309 aa  145  6e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0456684  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.79 
 
 
317 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.156333  normal  0.563407 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
314 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59424  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
299 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.456499 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.7 
 
 
297 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2978  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
289 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.27 
 
 
309 aa  143  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.05 
 
 
329 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.811614  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
314 aa  143  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000089983 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  34.75 
 
 
287 aa  142  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
297 aa  143  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000488765  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2913  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
299 aa  143  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
299 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
332 aa  142  5e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
303 aa  142  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0695484  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00850  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.59 
 
 
320 aa  142  7e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.37 
 
 
294 aa  142  7e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 
319 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.426381  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.114297  normal  0.0929805 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.43514  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.49 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.484603  normal  0.727796 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
294 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0540669  normal  0.0518644 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 
315 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0166747  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01490  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.82 
 
 
324 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.659857  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.82 
 
 
314 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0144983  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.88 
 
 
315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0068  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.59 
 
 
306 aa  139  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
297 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  34.3 
 
 
305 aa  139  4.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
308 aa  139  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172129  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
319 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1290  ABC transporter, permease protein  33.98 
 
 
311 aa  139  7e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
309 aa  139  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.049937  normal  0.069127 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.53 
 
 
309 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
338 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.786552  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
309 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 
316 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.41 
 
 
294 aa  138  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1304  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  30.71 
 
 
334 aa  137  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00913134  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2071  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
345 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000672298  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
292 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
313 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4017  carbohydrate ABC transporter permease  31.12 
 
 
294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.71 
 
 
294 aa  136  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.17 
 
 
311 aa  136  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17058  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
296 aa  136  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21160  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.1 
 
 
314 aa  136  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103465  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12339  sugar-transport integral membrane protein ABC transporter uspA  33.92 
 
 
290 aa  136  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6585  lactose transport system (permease)  36.76 
 
 
306 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
318 aa  136  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.575298  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1182  sugar ABC transporter, permease protein, putative  35.66 
 
 
319 aa  136  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547049  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
312 aa  135  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
327 aa  135  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.744275  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
307 aa  135  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.9 
 
 
310 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181942  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
310 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3574  carbohydrate ABC transporter permease  30.77 
 
 
294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>