215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0682 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0682  Uracil-DNA glycosylase superfamily  100 
 
 
276 aa  540  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263882  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5226  Uracil-DNA glycosylase superfamily  67.66 
 
 
244 aa  325  5e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18668  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32190  uracil-DNA glycosylase  68.22 
 
 
235 aa  308  9e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.657779  normal  0.0875972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5298  Uracil-DNA glycosylase superfamily  64.5 
 
 
240 aa  285  5e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0440  Uracil-DNA glycosylase superfamily  61.47 
 
 
251 aa  278  9e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29970  uracil-DNA glycosylase  61.09 
 
 
266 aa  275  5e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.50722 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0925  Uracil-DNA glycosylase superfamily  64.47 
 
 
261 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394614  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0842  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  60.26 
 
 
230 aa  273  3e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558809  normal  0.314333 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0899  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  61.16 
 
 
253 aa  266  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242395  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1040  Uracil-DNA glycosylase superfamily  56.5 
 
 
301 aa  257  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3772  Uracil-DNA glycosylase superfamily  62.44 
 
 
226 aa  251  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.817518  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5791  Uracil-DNA glycosylase superfamily  60.87 
 
 
233 aa  249  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1903  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  57.2 
 
 
312 aa  250  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8576  uracil-DNA glycosylase superfamily  55.88 
 
 
266 aa  249  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.610367  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3919  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  61.26 
 
 
271 aa  246  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3689  Uracil-DNA glycosylase superfamily protein  62.56 
 
 
226 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1079  Uracil-DNA glycosylase superfamily  57.87 
 
 
291 aa  245  6.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1028  Uracil-DNA glycosylase superfamily  57.52 
 
 
294 aa  244  9e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250169  normal  0.0211091 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3631  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  62.09 
 
 
226 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11285  hypothetical protein  57.27 
 
 
299 aa  243  3e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0811  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  60.59 
 
 
262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3128  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  55.28 
 
 
268 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56795  hitchhiker  0.0037268 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1651  Uracil-DNA glycosylase superfamily  58.87 
 
 
299 aa  240  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0935  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  56.39 
 
 
284 aa  239  5e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2949  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  58.22 
 
 
228 aa  238  6.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2236  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  54.42 
 
 
282 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3233  Uracil-DNA glycosylase superfamily  62.16 
 
 
281 aa  230  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718462  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4459  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  51.93 
 
 
284 aa  222  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2636  Uracil-DNA glycosylase superfamily  52.61 
 
 
221 aa  218  7.999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1564  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  48.21 
 
 
228 aa  211  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  hitchhiker  0.00784209 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3957  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  55.6 
 
 
273 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4031  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  55.6 
 
 
273 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3971  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  55.6 
 
 
273 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.649617  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3164  Uracil-DNA glycosylase superfamily  48.7 
 
 
221 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.368387  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3755  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  55.85 
 
 
186 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0169947  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0544  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.56 
 
 
219 aa  179  4e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1386  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.13 
 
 
236 aa  175  6e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0479897  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1921  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.74 
 
 
210 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.21092 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0366  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.89 
 
 
217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1169  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.78 
 
 
206 aa  168  9e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00763816 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0814  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.54 
 
 
231 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0736  putative uracil-DNA glycosylase  42.2 
 
 
224 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1269  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.75 
 
 
238 aa  155  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1599  Uracil-DNA glycosylase superfamily  44.65 
 
 
212 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0720375  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1551  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.58 
 
 
220 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0720  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.44 
 
 
217 aa  152  5e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1722  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.33 
 
 
225 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.598455  normal  0.212618 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2864  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.13 
 
 
223 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.48935  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2605  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.72 
 
 
200 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0477634  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2258  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.52 
 
 
242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0703  hypothetical protein  42.59 
 
 
207 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.109523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2965  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.67 
 
 
224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4690  putative uracil-DNA glycosylase  40.74 
 
 
229 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  0.0692516 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2644  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.7 
 
 
225 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0136839  hitchhiker  0.00783391 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1001  Uracil-DNA glycosylase superfamily  44.39 
 
 
228 aa  145  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00625229 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0380  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.85 
 
 
232 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.172992  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0527  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.38 
 
 
211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0572467  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1925  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.45 
 
 
225 aa  140  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2632  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.94 
 
 
226 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.122532  normal  0.188311 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1579  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40 
 
 
220 aa  139  7e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.111562  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3835  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.4 
 
 
233 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0648  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.92 
 
 
223 aa  136  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0642  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.92 
 
 
223 aa  136  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1908  hypothetical protein  42.06 
 
 
218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.443294  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1361  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.2 
 
 
214 aa  135  8e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0818  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.73 
 
 
215 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0737592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2037  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.96 
 
 
215 aa  133  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.161308  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1860  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.04 
 
 
214 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0361601  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2448  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.35 
 
 
236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1220  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.85 
 
 
232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58979  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2639  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.37 
 
 
216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.990849  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0943  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.19 
 
 
220 aa  119  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0789384  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0466  uracil DNA glycosylase family protein  36.2 
 
 
228 aa  115  7.999999999999999e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.276682  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0248  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  34.21 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  0.366992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0318  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  34 
 
 
193 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100378  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1649  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.41 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00048269 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1768  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.36 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1056  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.83 
 
 
196 aa  65.1  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0183  Uracil-DNA glycosylase superfamily  31.61 
 
 
210 aa  64.3  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.589955  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0689  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.16 
 
 
294 aa  62.8  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614175  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1369  putative DNA polymerase-related protein, bacteriophage-type  33.33 
 
 
292 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.424674  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.73 
 
 
264 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.31 
 
 
204 aa  59.7  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.3735  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1447  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.76 
 
 
200 aa  59.3  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0372  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.35 
 
 
294 aa  59.3  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000046016 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0119  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.27 
 
 
191 aa  59.3  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0717  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.48 
 
 
195 aa  59.3  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.667137 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.33 
 
 
210 aa  59.3  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0718  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.63 
 
 
193 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.809619 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1937  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.14 
 
 
285 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.090684  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_379  uracil DNA glycosylase superfamily, DNA polymerase bacteriophage-type  33.9 
 
 
206 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1397  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.14 
 
 
317 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.60425 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2152  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.16 
 
 
241 aa  56.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3700  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  35.09 
 
 
193 aa  56.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0303  putative DNA polymerase-related protein  35.83 
 
 
260 aa  56.2  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440976  normal  0.0410762 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3154  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.42 
 
 
201 aa  55.8  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.89 
 
 
249 aa  55.8  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.133247  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0437  uracil-DNA glycosylase, putative  33.62 
 
 
189 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0292507  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.22 
 
 
308 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.934489  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2009  phage SpO1 DNA polymerase-related protein  37.12 
 
 
224 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>