More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2502 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2882  uracil-DNA glycosylase family 4 protein  100 
 
 
308 aa  622  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  100 
 
 
308 aa  622  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.934489  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1242  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.83 
 
 
264 aa  241  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.738609 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  59.04 
 
 
330 aa  241  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1308  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.36 
 
 
264 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0132537  normal  0.393253 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1397  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.97 
 
 
317 aa  238  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.60425 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1369  putative DNA polymerase-related protein, bacteriophage-type  57.67 
 
 
292 aa  237  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.424674  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2152  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.88 
 
 
241 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  61.67 
 
 
264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1937  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  56.04 
 
 
285 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.090684  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0372  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.7 
 
 
294 aa  228  7e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000046016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2481  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  57.39 
 
 
414 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  hitchhiker  0.000867118 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  58.2 
 
 
304 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1363  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.11 
 
 
341 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1656  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  56.82 
 
 
401 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00964982 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1944  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.72 
 
 
345 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.48 
 
 
367 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6034  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.06 
 
 
346 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0371104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2043  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.06 
 
 
346 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2062  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.94 
 
 
342 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2463  uracil-DNA glycosylase  53.48 
 
 
455 aa  222  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2519  uracil-DNA glycosylase  53.48 
 
 
455 aa  222  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2607  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  53.48 
 
 
468 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3230  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  53.19 
 
 
455 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1355  uracil-DNA glycosylase  53.19 
 
 
455 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00548958  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2082  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  53.19 
 
 
455 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.268517  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2515  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  56.54 
 
 
231 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2003  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  52.31 
 
 
433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0303  putative DNA polymerase-related protein  54.08 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440976  normal  0.0410762 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0689  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.52 
 
 
294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614175  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1580  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  53.19 
 
 
220 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0245048  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2121  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.09 
 
 
271 aa  218  8.999999999999998e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1983  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.79 
 
 
260 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.643872 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1234  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.01 
 
 
358 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532559  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5352  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.97 
 
 
336 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2276  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.81 
 
 
243 aa  211  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2009  phage SpO1 DNA polymerase-related protein  58.58 
 
 
224 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331799  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1723  putative phage DNA polymerase  56.18 
 
 
213 aa  209  4e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1500  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.03 
 
 
255 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.43423  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2370  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.11 
 
 
245 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114234  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1494  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.85 
 
 
295 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.363091  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1589  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.85 
 
 
205 aa  198  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5015  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.04 
 
 
380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.641312  normal  0.046521 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2925  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.46 
 
 
259 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0552  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.26 
 
 
264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446381  hitchhiker  0.00103013 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1126  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.18 
 
 
235 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2671  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.8 
 
 
253 aa  192  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.663672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0082  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.89 
 
 
264 aa  189  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0333  hypothetical protein  50.3 
 
 
200 aa  186  5e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0314  hypothetical protein  50.3 
 
 
200 aa  185  7e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.57 
 
 
249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.133247  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0466  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.6 
 
 
264 aa  182  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113584  hitchhiker  0.00887798 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0014  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.28 
 
 
263 aa  178  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2543  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.49 
 
 
235 aa  175  7e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0670794  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1912  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.77 
 
 
199 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.06 
 
 
209 aa  174  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3775  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.73 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.858318  normal  0.0557135 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.8 
 
 
210 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.07 
 
 
186 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000159527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3960  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.86 
 
 
191 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300932  hitchhiker  0.00000000403692 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1838  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.98 
 
 
185 aa  170  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3067  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.78 
 
 
187 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000874061  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3405  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.82 
 
 
300 aa  170  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2491  DNA polymerase domain-containing protein  39.57 
 
 
264 aa  168  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0365  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.59 
 
 
208 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2605  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.2 
 
 
203 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0483  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.05 
 
 
195 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000659964  normal  0.795166 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0200  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.76 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.5 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0266  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.98 
 
 
315 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1085  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.2 
 
 
217 aa  160  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.863324  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2071  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.09 
 
 
211 aa  160  3e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0231  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.97 
 
 
252 aa  158  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0104568  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3864  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.87 
 
 
327 aa  158  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0209903 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0909  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.54 
 
 
285 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1393  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.44 
 
 
210 aa  156  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.06 
 
 
205 aa  156  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2416  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.1 
 
 
190 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0265  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.4 
 
 
211 aa  155  6e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2028  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.6 
 
 
290 aa  155  7e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2373  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.65 
 
 
307 aa  155  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0893  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.94 
 
 
227 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148707 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5420  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.21 
 
 
300 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3108  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.68 
 
 
189 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1649  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.75 
 
 
209 aa  155  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00048269 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4076  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.25 
 
 
295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3219  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40 
 
 
289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0343  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.34 
 
 
223 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.202316  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1116  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.46 
 
 
305 aa  153  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0413  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.67 
 
 
242 aa  153  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.13684  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01520  uracil-DNA glycosylase, family 4  45.09 
 
 
195 aa  152  5e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0226409 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1236  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.17 
 
 
220 aa  152  5e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.289271  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3901  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.68 
 
 
300 aa  152  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.463834  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0839  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.05 
 
 
297 aa  152  5e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0413074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.4 
 
 
278 aa  153  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0147  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.71 
 
 
202 aa  151  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1180  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.67 
 
 
187 aa  152  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11480  Uracil-DNA glycosylase  42.78 
 
 
210 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353711  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0935  uracil-DNA glycosylase  38.65 
 
 
255 aa  150  2e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1210  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.59 
 
 
282 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal  0.843697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>