More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0248 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0248  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  100 
 
 
192 aa  390  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  0.366992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0318  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  78.65 
 
 
193 aa  317  7e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100378  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0183  Uracil-DNA glycosylase superfamily  37.29 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.589955  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2639  Uracil-DNA glycosylase superfamily  38.42 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3342  Uracil-DNA glycosylase superfamily  35.6 
 
 
216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.747141  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1992  hypothetical protein  34.86 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.770462  normal  0.123925 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1578  Uracil-DNA glycosylase-like protein  34.69 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2893  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.2 
 
 
254 aa  108  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.260893  normal  0.720547 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2009  phage SpO1 DNA polymerase-related protein  40.24 
 
 
224 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331799  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0119  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.4 
 
 
191 aa  107  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0795  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.99 
 
 
219 aa  106  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3700  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  30.6 
 
 
193 aa  102  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2152  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.04 
 
 
241 aa  101  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1447  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.31 
 
 
200 aa  100  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0157  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.5 
 
 
200 aa  99.8  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0205394  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.75 
 
 
210 aa  99.4  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.24 
 
 
204 aa  99  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.3735  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1912  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.9 
 
 
199 aa  99  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0798  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40 
 
 
217 aa  98.6  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1649  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.33 
 
 
209 aa  97.8  9e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00048269 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.15 
 
 
264 aa  97.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_379  uracil DNA glycosylase superfamily, DNA polymerase bacteriophage-type  36.48 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1870  Uracil-DNA glycosylase-like protein  35.63 
 
 
233 aa  96.7  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00147256  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1768  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.36 
 
 
194 aa  95.9  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2784  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.78 
 
 
211 aa  95.9  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0335572 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.93 
 
 
205 aa  95.5  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3154  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.08 
 
 
201 aa  95.5  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0231  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.13 
 
 
252 aa  95.5  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0104568  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4431  phage SPO1 DNA polymerase-like protein  34.13 
 
 
226 aa  95.1  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.696718  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3067  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.13 
 
 
187 aa  94.7  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000874061  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0200  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.89 
 
 
305 aa  94.7  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0413  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.52 
 
 
242 aa  94.7  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.13684  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0437  uracil-DNA glycosylase, putative  36.6 
 
 
189 aa  94.4  9e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0292507  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0147  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.73 
 
 
202 aa  94  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5015  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.32 
 
 
380 aa  94  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.641312  normal  0.046521 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2003  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  35.15 
 
 
433 aa  92.8  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1487  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.55 
 
 
245 aa  93.6  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1656  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.59 
 
 
401 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00964982 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0372  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.16 
 
 
294 aa  93.2  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000046016 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1944  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.76 
 
 
345 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1940  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.32 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000409376 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0259  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.33 
 
 
238 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382173  normal  0.0633983 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.76 
 
 
367 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1921  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.57 
 
 
210 aa  93.2  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.21092 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1580  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  35.15 
 
 
220 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0245048  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1589  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.12 
 
 
205 aa  92.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0717  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.16 
 
 
195 aa  92  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.667137 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2463  uracil-DNA glycosylase  35.15 
 
 
455 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1494  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.12 
 
 
295 aa  92  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.363091  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1244  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.72 
 
 
221 aa  92  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2082  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  35.15 
 
 
455 aa  92  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.268517  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2370  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.12 
 
 
245 aa  92  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2519  uracil-DNA glycosylase  35.15 
 
 
455 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3230  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  35.15 
 
 
455 aa  92  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1355  uracil-DNA glycosylase  35.15 
 
 
455 aa  92  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00548958  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2491  DNA polymerase domain-containing protein  33.33 
 
 
264 aa  91.7  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2607  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  35.15 
 
 
468 aa  91.7  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2605  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.13 
 
 
203 aa  91.3  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.14 
 
 
209 aa  91.3  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2949  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.96 
 
 
228 aa  91.3  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2121  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.73 
 
 
271 aa  91.3  9e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2481  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.54 
 
 
414 aa  90.9  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  hitchhiker  0.000867118 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1393  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.4 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.75 
 
 
220 aa  90.9  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5352  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.76 
 
 
336 aa  90.5  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1242  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.76 
 
 
264 aa  90.9  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.738609 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.22 
 
 
206 aa  90.5  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0748398  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6034  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.76 
 
 
346 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0371104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2043  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.76 
 
 
346 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1983  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.54 
 
 
260 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.643872 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1220  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.91 
 
 
232 aa  89.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58979  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1500  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.12 
 
 
255 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.43423  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2062  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.76 
 
 
342 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1308  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.76 
 
 
264 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0132537  normal  0.393253 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1234  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.15 
 
 
358 aa  89.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532559  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2305  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.13 
 
 
192 aa  89.4  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0147899 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2543  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.13 
 
 
235 aa  89.4  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0670794  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11480  Uracil-DNA glycosylase  34.44 
 
 
210 aa  89.4  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353711  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1599  Uracil-DNA glycosylase superfamily  36.36 
 
 
212 aa  89.4  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0720375  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1363  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.94 
 
 
341 aa  89  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0290  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.58 
 
 
207 aa  89  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2636  Uracil-DNA glycosylase superfamily  37.58 
 
 
221 aa  89  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0356  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.8 
 
 
225 aa  89  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.606658  normal  0.0957243 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1723  putative phage DNA polymerase  34.73 
 
 
213 aa  88.6  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0893  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.74 
 
 
227 aa  88.6  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148707 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0718  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.14 
 
 
193 aa  88.6  5e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.809619 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1564  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  35.12 
 
 
228 aa  88.6  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  hitchhiker  0.00784209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0082  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.54 
 
 
264 aa  88.2  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0426  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.76 
 
 
193 aa  88.2  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000629945  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0411  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.76 
 
 
193 aa  88.2  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000323475  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0113  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.4 
 
 
206 aa  88.2  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2161  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.74 
 
 
191 aa  87.8  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.336529  hitchhiker  0.000279236 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2416  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.73 
 
 
190 aa  87.8  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1236  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.05 
 
 
220 aa  87.8  9e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.289271  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5828  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.29 
 
 
209 aa  87.8  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1937  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.74 
 
 
285 aa  87  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.090684  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1180  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.74 
 
 
187 aa  87.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3405  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.33 
 
 
300 aa  87.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2276  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.53 
 
 
243 aa  86.3  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32190  uracil-DNA glycosylase  39.47 
 
 
235 aa  86.7  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.657779  normal  0.0875972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>