222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1269 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1269  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  100 
 
 
238 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0703  hypothetical protein  63.43 
 
 
207 aa  270  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.109523 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1599  Uracil-DNA glycosylase superfamily  59.19 
 
 
212 aa  254  8e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0720375  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1908  hypothetical protein  58.99 
 
 
218 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.443294  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1361  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  57.94 
 
 
214 aa  236  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2258  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  50.67 
 
 
242 aa  232  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2632  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  50.92 
 
 
226 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.122532  normal  0.188311 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2448  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  51.83 
 
 
236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1925  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  49.1 
 
 
225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2605  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  50.95 
 
 
200 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0477634  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2644  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  49.33 
 
 
225 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0136839  hitchhiker  0.00783391 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2965  Uracil-DNA glycosylase superfamily  50.93 
 
 
224 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2864  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  50 
 
 
223 aa  206  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.48935  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4690  putative uracil-DNA glycosylase  49.3 
 
 
229 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  0.0692516 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1579  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  49.09 
 
 
220 aa  202  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.111562  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1551  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  49.53 
 
 
220 aa  201  7e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1001  Uracil-DNA glycosylase superfamily  48.61 
 
 
228 aa  201  8e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00625229 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0527  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  50.24 
 
 
211 aa  198  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0572467  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0380  Uracil-DNA glycosylase superfamily  47.87 
 
 
232 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.172992  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2037  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  48.62 
 
 
215 aa  196  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.161308  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3835  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.82 
 
 
233 aa  194  9e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1860  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.54 
 
 
214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0361601  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0648  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.15 
 
 
223 aa  187  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0642  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.15 
 
 
223 aa  187  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1722  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.77 
 
 
225 aa  187  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.598455  normal  0.212618 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2639  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.15 
 
 
216 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.990849  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0943  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  48.17 
 
 
220 aa  185  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0789384  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2636  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.58 
 
 
221 aa  178  8e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0466  uracil DNA glycosylase family protein  41.89 
 
 
228 aa  171  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.276682  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3164  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.55 
 
 
221 aa  167  9e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.368387  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1564  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.01 
 
 
228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  hitchhiker  0.00784209 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1220  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.78 
 
 
232 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58979  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2949  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.16 
 
 
228 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0736  putative uracil-DNA glycosylase  40.27 
 
 
224 aa  156  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0682  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.75 
 
 
276 aa  155  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8576  uracil-DNA glycosylase superfamily  40.27 
 
 
266 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.610367  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0366  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.61 
 
 
217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1028  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40.27 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250169  normal  0.0211091 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5791  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.26 
 
 
233 aa  146  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0720  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.86 
 
 
217 aa  145  6e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0925  Uracil-DNA glycosylase superfamily  37.9 
 
 
261 aa  143  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394614  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3128  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.44 
 
 
268 aa  143  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56795  hitchhiker  0.0037268 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3772  Uracil-DNA glycosylase superfamily  38.01 
 
 
226 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.817518  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5298  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.89 
 
 
240 aa  142  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3631  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.89 
 
 
226 aa  141  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1040  Uracil-DNA glycosylase superfamily  36.21 
 
 
301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2236  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.84 
 
 
282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0899  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.84 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242395  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1903  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.95 
 
 
312 aa  139  6e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3689  Uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.43 
 
 
226 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1921  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.65 
 
 
210 aa  137  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.21092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4459  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.24 
 
 
284 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29970  uracil-DNA glycosylase  37.95 
 
 
266 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.50722 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1386  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.59 
 
 
236 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0479897  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1079  Uracil-DNA glycosylase superfamily  37.9 
 
 
291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5226  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.73 
 
 
244 aa  135  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18668  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32190  uracil-DNA glycosylase  39.11 
 
 
235 aa  135  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.657779  normal  0.0875972 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0842  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.84 
 
 
230 aa  135  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558809  normal  0.314333 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3755  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.05 
 
 
186 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0169947  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11285  hypothetical protein  39.72 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1169  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.16 
 
 
206 aa  132  5e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00763816 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1651  Uracil-DNA glycosylase superfamily  37.39 
 
 
299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3919  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  35.48 
 
 
271 aa  129  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0440  Uracil-DNA glycosylase superfamily  38.36 
 
 
251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0544  Uracil-DNA glycosylase superfamily  35.24 
 
 
219 aa  122  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0935  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.65 
 
 
284 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0814  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.25 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3957  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.99 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4031  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.99 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3971  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.99 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.649617  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0818  Uracil-DNA glycosylase superfamily  38.16 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0737592  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0811  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.79 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3233  Uracil-DNA glycosylase superfamily  34.8 
 
 
281 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718462  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0248  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  35.54 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  0.366992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0318  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.55 
 
 
193 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100378  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1126  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.13 
 
 
235 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1649  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.44 
 
 
209 aa  63.5  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00048269 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3154  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.36 
 
 
201 aa  62  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.02 
 
 
304 aa  60.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1870  Uracil-DNA glycosylase-like protein  30.38 
 
 
233 aa  60.1  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00147256  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0333  hypothetical protein  33.12 
 
 
200 aa  58.9  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2671  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.59 
 
 
253 aa  58.9  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.663672 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2305  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36 
 
 
192 aa  58.9  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0147899 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0314  hypothetical protein  32.91 
 
 
200 aa  58.5  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1180  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.25 
 
 
187 aa  58.5  0.00000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0718  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.67 
 
 
193 aa  58.5  0.00000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.809619 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1447  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  26.89 
 
 
200 aa  58.5  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1912  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.54 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2071  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.81 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1244  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.07 
 
 
221 aa  56.6  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0717  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.49 
 
 
195 aa  57  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.667137 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5015  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.35 
 
 
380 aa  56.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.641312  normal  0.046521 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5828  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.43 
 
 
209 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0091  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.09 
 
 
216 aa  56.2  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.12 
 
 
217 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693226  normal  0.500254 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1948  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36 
 
 
190 aa  55.5  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.735506  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2152  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.43 
 
 
241 aa  55.1  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1479  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.3 
 
 
184 aa  55.1  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.33 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1530  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.65 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.929969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>