More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3772 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3772  Uracil-DNA glycosylase superfamily  100 
 
 
226 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.817518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3689  Uracil-DNA glycosylase superfamily protein  97.67 
 
 
226 aa  417  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3631  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  96.28 
 
 
226 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2949  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  66.82 
 
 
228 aa  285  5e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3755  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  77.22 
 
 
186 aa  276  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0169947  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1564  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  55.51 
 
 
228 aa  268  5.9999999999999995e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  hitchhiker  0.00784209 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5791  Uracil-DNA glycosylase superfamily  63.51 
 
 
233 aa  265  4e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5298  Uracil-DNA glycosylase superfamily  60.96 
 
 
240 aa  264  8e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0842  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  59.56 
 
 
230 aa  258  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558809  normal  0.314333 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29970  uracil-DNA glycosylase  58.01 
 
 
266 aa  256  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.50722 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4459  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  58.7 
 
 
284 aa  255  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0899  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  61.75 
 
 
253 aa  254  6e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242395  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32190  uracil-DNA glycosylase  59.29 
 
 
235 aa  254  6e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.657779  normal  0.0875972 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2236  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  57.89 
 
 
282 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0682  Uracil-DNA glycosylase superfamily  62.44 
 
 
276 aa  251  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263882  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0925  Uracil-DNA glycosylase superfamily  60.89 
 
 
261 aa  251  5.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8576  uracil-DNA glycosylase superfamily  58.41 
 
 
266 aa  251  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.610367  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1040  Uracil-DNA glycosylase superfamily  56.6 
 
 
301 aa  251  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1028  Uracil-DNA glycosylase superfamily  61.26 
 
 
294 aa  250  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250169  normal  0.0211091 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1079  Uracil-DNA glycosylase superfamily  61.74 
 
 
291 aa  250  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3128  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  59.21 
 
 
268 aa  248  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56795  hitchhiker  0.0037268 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1903  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  57.02 
 
 
312 aa  248  5e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2636  Uracil-DNA glycosylase superfamily  58.48 
 
 
221 aa  246  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5226  Uracil-DNA glycosylase superfamily  57.76 
 
 
244 aa  246  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18668  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3164  Uracil-DNA glycosylase superfamily  58.67 
 
 
221 aa  245  4e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.368387  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0440  Uracil-DNA glycosylase superfamily  56.95 
 
 
251 aa  244  8e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1651  Uracil-DNA glycosylase superfamily  57.39 
 
 
299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0935  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  56.33 
 
 
284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3233  Uracil-DNA glycosylase superfamily  63.3 
 
 
281 aa  238  5e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718462  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3971  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  58.04 
 
 
273 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.649617  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3957  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  58.04 
 
 
273 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4031  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  58.04 
 
 
273 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11285  hypothetical protein  53.98 
 
 
299 aa  224  7e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3919  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  54.63 
 
 
271 aa  218  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0811  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  59.22 
 
 
262 aa  215  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1386  Uracil-DNA glycosylase superfamily  44.93 
 
 
236 aa  213  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0479897  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0366  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.59 
 
 
217 aa  203  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0544  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.21 
 
 
219 aa  185  5e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1921  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.28 
 
 
210 aa  175  6e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.21092 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0736  putative uracil-DNA glycosylase  44.24 
 
 
224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0818  Uracil-DNA glycosylase superfamily  50 
 
 
215 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0737592  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1361  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.41 
 
 
214 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1169  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.02 
 
 
206 aa  167  2e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00763816 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0814  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.47 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1599  Uracil-DNA glycosylase superfamily  45.41 
 
 
212 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0720375  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0703  hypothetical protein  44.23 
 
 
207 aa  158  6e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.109523 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0720  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.03 
 
 
217 aa  158  8e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1551  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.5 
 
 
220 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1220  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.05 
 
 
232 aa  154  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58979  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1908  hypothetical protein  44.23 
 
 
218 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.443294  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2864  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.7 
 
 
223 aa  152  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.48935  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1722  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.98 
 
 
225 aa  147  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.598455  normal  0.212618 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2448  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.03 
 
 
236 aa  143  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1269  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.01 
 
 
238 aa  142  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0527  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.95 
 
 
211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0572467  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2644  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0136839  hitchhiker  0.00783391 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2258  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.51 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1579  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.86 
 
 
220 aa  139  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.111562  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1001  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.45 
 
 
228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00625229 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1860  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.4 
 
 
214 aa  135  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0361601  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2605  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.65 
 
 
200 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0477634  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4690  putative uracil-DNA glycosylase  41.23 
 
 
229 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  0.0692516 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3835  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.85 
 
 
233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2965  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.83 
 
 
224 aa  131  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0380  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40.09 
 
 
232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.172992  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2632  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.31 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.122532  normal  0.188311 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2037  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.26 
 
 
215 aa  125  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.161308  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1925  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.16 
 
 
225 aa  124  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0642  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.03 
 
 
223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0648  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.57 
 
 
223 aa  118  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2639  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.32 
 
 
216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.990849  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0466  uracil DNA glycosylase family protein  35.02 
 
 
228 aa  115  7.999999999999999e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.276682  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0943  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.41 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0789384  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0248  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  35.81 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  0.366992 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1649  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.5 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00048269 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0318  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.49 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100378  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0119  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.96 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0795  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.16 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3154  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.41 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1447  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.94 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_379  uracil DNA glycosylase superfamily, DNA polymerase bacteriophage-type  32.68 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0303  putative DNA polymerase-related protein  33.33 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440976  normal  0.0410762 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2076  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.16 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1369  putative DNA polymerase-related protein, bacteriophage-type  31.67 
 
 
292 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.424674  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.02 
 
 
264 aa  74.7  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2449  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.33 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.38 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1242  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.67 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.738609 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1308  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.11 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0132537  normal  0.393253 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2515  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.1 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1479  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.54 
 
 
184 aa  72  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0437  uracil-DNA glycosylase, putative  37.27 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0292507  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0689  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.44 
 
 
294 aa  71.6  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614175  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0091  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  24.39 
 
 
216 aa  71.2  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2152  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.94 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1085  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.75 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.863324  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1948  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.03 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.735506  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0718  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.9 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.809619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1944  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.11 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.84 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.3735  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>