245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0720 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0720  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  100 
 
 
217 aa  442  1e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0366  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.39 
 
 
217 aa  196  3e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1921  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.42 
 
 
210 aa  194  9e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.21092 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1169  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.17 
 
 
206 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00763816 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1564  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.79 
 
 
228 aa  182  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  hitchhiker  0.00784209 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5791  Uracil-DNA glycosylase superfamily  45.09 
 
 
233 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0399068 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0544  Uracil-DNA glycosylase superfamily  44.91 
 
 
219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2949  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.59 
 
 
228 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2636  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.28 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3164  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.66 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.368387  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0440  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.74 
 
 
251 aa  162  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5298  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.67 
 
 
240 aa  159  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3772  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.03 
 
 
226 aa  158  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.817518  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1903  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.79 
 
 
312 aa  158  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3689  Uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.03 
 
 
226 aa  157  8e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1386  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.18 
 
 
236 aa  157  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0479897  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32190  uracil-DNA glycosylase  40.87 
 
 
235 aa  156  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.657779  normal  0.0875972 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4459  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.18 
 
 
284 aa  156  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1028  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.98 
 
 
294 aa  155  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250169  normal  0.0211091 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3631  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.55 
 
 
226 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1651  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.36 
 
 
299 aa  153  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0682  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.72 
 
 
276 aa  152  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263882  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0736  putative uracil-DNA glycosylase  40.47 
 
 
224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0814  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.06 
 
 
231 aa  150  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1908  hypothetical protein  43.65 
 
 
218 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.443294  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1040  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.47 
 
 
301 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0925  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40.71 
 
 
261 aa  149  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394614  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11285  hypothetical protein  41.82 
 
 
299 aa  149  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1079  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.66 
 
 
291 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0842  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.33 
 
 
230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558809  normal  0.314333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5226  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40.74 
 
 
244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18668  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0899  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.23 
 
 
253 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242395  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1551  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.18 
 
 
220 aa  146  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1001  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.41 
 
 
228 aa  145  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00625229 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1269  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.86 
 
 
238 aa  145  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29970  uracil-DNA glycosylase  39.91 
 
 
266 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.50722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8576  uracil-DNA glycosylase superfamily  42.25 
 
 
266 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.610367  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1361  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.87 
 
 
214 aa  142  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2236  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.68 
 
 
282 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0811  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.31 
 
 
262 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3919  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.72 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3128  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.71 
 
 
268 aa  139  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56795  hitchhiker  0.0037268 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0703  hypothetical protein  41.92 
 
 
207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.109523 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1599  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.39 
 
 
212 aa  138  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0720375  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3957  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.13 
 
 
273 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4031  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.13 
 
 
273 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3971  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.13 
 
 
273 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.649617  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2258  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.62 
 
 
242 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0935  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.68 
 
 
284 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2864  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40 
 
 
223 aa  134  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.48935  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0380  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.39 
 
 
232 aa  131  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.172992  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2632  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.26 
 
 
226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.122532  normal  0.188311 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1722  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43 
 
 
225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.598455  normal  0.212618 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0527  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.91 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0572467  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0818  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40.7 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0737592  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3755  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.31 
 
 
186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0169947  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1220  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.32 
 
 
232 aa  129  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58979  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3233  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.5 
 
 
281 aa  128  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718462  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2448  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.7 
 
 
236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2644  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.94 
 
 
225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0136839  hitchhiker  0.00783391 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2639  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.31 
 
 
216 aa  126  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.990849  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2605  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.29 
 
 
200 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0477634  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4690  putative uracil-DNA glycosylase  40.61 
 
 
229 aa  124  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  0.0692516 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1925  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.12 
 
 
225 aa  124  9e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2037  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.39 
 
 
215 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.161308  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0943  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.42 
 
 
220 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0789384  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2965  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.09 
 
 
224 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0648  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.31 
 
 
223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1860  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.63 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0361601  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0642  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.31 
 
 
223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1579  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.95 
 
 
220 aa  116  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.111562  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3835  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.62 
 
 
233 aa  114  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0466  uracil DNA glycosylase family protein  36.45 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.276682  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3405  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.95 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1912  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.76 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0248  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  28.73 
 
 
192 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  0.366992 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2152  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.27 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30 
 
 
330 aa  64.3  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1649  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00048269 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0183  Uracil-DNA glycosylase superfamily  32.17 
 
 
210 aa  63.5  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.589955  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0147  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.22 
 
 
202 aa  63.5  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1838  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.72 
 
 
185 aa  63.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3775  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.07 
 
 
273 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.858318  normal  0.0557135 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.27 
 
 
249 aa  62  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.133247  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11480  Uracil-DNA glycosylase  30.05 
 
 
210 aa  61.6  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353711  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0718  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.23 
 
 
193 aa  61.6  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.809619 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.92 
 
 
304 aa  61.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0483  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.41 
 
 
195 aa  60.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000659964  normal  0.795166 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0689  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.14 
 
 
294 aa  61.2  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614175  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0318  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  26.5 
 
 
193 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100378  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.18 
 
 
308 aa  59.7  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.934489  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2882  uracil-DNA glycosylase family 4 protein  32.18 
 
 
308 aa  59.7  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.17 
 
 
210 aa  59.7  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2076  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.38 
 
 
194 aa  59.7  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1369  putative DNA polymerase-related protein, bacteriophage-type  32.43 
 
 
292 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.424674  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2515  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.76 
 
 
231 aa  59.7  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1479  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.1 
 
 
184 aa  59.7  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2334  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.55 
 
 
219 aa  59.3  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2121  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.76 
 
 
271 aa  58.9  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0303  putative DNA polymerase-related protein  30.87 
 
 
260 aa  58.9  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440976  normal  0.0410762 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>