211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1925 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1925  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  100 
 
 
225 aa  458  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2258  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  84.35 
 
 
242 aa  392  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2632  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  82.44 
 
 
226 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.122532  normal  0.188311 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2965  Uracil-DNA glycosylase superfamily  74.09 
 
 
224 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2605  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  76.26 
 
 
200 aa  328  4e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0477634  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2644  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  74.15 
 
 
225 aa  327  7e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0136839  hitchhiker  0.00783391 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4690  putative uracil-DNA glycosylase  73.21 
 
 
229 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  0.0692516 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2864  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  67.62 
 
 
223 aa  288  4e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.48935  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3835  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  67.62 
 
 
233 aa  288  5.0000000000000004e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2448  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  63.94 
 
 
236 aa  278  4e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1001  Uracil-DNA glycosylase superfamily  66.18 
 
 
228 aa  278  6e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00625229 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0943  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  60.19 
 
 
220 aa  262  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0789384  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1579  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  57.82 
 
 
220 aa  254  9e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.111562  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0648  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  57.89 
 
 
223 aa  250  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1722  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  58.05 
 
 
225 aa  250  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.598455  normal  0.212618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0380  Uracil-DNA glycosylase superfamily  59.71 
 
 
232 aa  250  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.172992  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0466  uracil DNA glycosylase family protein  57.14 
 
 
228 aa  250  1e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.276682  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0642  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  57.89 
 
 
223 aa  250  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0527  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  56.8 
 
 
211 aa  247  8e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0572467  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2639  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  56.46 
 
 
216 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.990849  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1551  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  59.3 
 
 
220 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1860  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  58.65 
 
 
214 aa  241  5e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0361601  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1908  hypothetical protein  54 
 
 
218 aa  230  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.443294  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1599  Uracil-DNA glycosylase superfamily  55.72 
 
 
212 aa  226  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0720375  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1269  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  49.1 
 
 
238 aa  223  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1220  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  54 
 
 
232 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58979  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0703  hypothetical protein  49.25 
 
 
207 aa  206  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.109523 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2037  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  49.03 
 
 
215 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.161308  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1361  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  51.49 
 
 
214 aa  194  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0736  putative uracil-DNA glycosylase  49.04 
 
 
224 aa  180  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1564  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.32 
 
 
228 aa  179  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  hitchhiker  0.00784209 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2636  Uracil-DNA glycosylase superfamily  44.12 
 
 
221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3164  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.41 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.368387  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2949  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.45 
 
 
228 aa  158  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5791  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.63 
 
 
233 aa  148  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0899  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.34 
 
 
253 aa  148  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242395  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0682  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40.74 
 
 
276 aa  145  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263882  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3755  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.37 
 
 
186 aa  141  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0169947  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0925  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.52 
 
 
261 aa  139  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394614  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0366  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.59 
 
 
217 aa  139  3e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32190  uracil-DNA glycosylase  40.48 
 
 
235 aa  138  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.657779  normal  0.0875972 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0440  Uracil-DNA glycosylase superfamily  38.86 
 
 
251 aa  136  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4459  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.86 
 
 
284 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0935  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.98 
 
 
284 aa  135  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2236  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.59 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1040  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.63 
 
 
301 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3128  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.81 
 
 
268 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56795  hitchhiker  0.0037268 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0544  Uracil-DNA glycosylase superfamily  37.31 
 
 
219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5298  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.53 
 
 
240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0842  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.31 
 
 
230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558809  normal  0.314333 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11285  hypothetical protein  41.55 
 
 
299 aa  132  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3772  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40.1 
 
 
226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.817518  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0720  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.12 
 
 
217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1079  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.65 
 
 
291 aa  131  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0811  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.79 
 
 
262 aa  131  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1651  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.55 
 
 
299 aa  131  9e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3631  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.89 
 
 
226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1903  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.97 
 
 
312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3689  Uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.59 
 
 
226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8576  uracil-DNA glycosylase superfamily  39.81 
 
 
266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.610367  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1028  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40.74 
 
 
294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250169  normal  0.0211091 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1921  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.72 
 
 
210 aa  128  8.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.21092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5226  Uracil-DNA glycosylase superfamily  37.9 
 
 
244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18668  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1169  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.72 
 
 
206 aa  124  1e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00763816 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0814  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.21 
 
 
231 aa  124  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29970  uracil-DNA glycosylase  36.45 
 
 
266 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.50722 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3919  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.5 
 
 
271 aa  123  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3957  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.95 
 
 
273 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4031  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.95 
 
 
273 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0818  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40.72 
 
 
215 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0737592  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3971  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.95 
 
 
273 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.649617  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1386  Uracil-DNA glycosylase superfamily  37.5 
 
 
236 aa  114  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0479897  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3233  Uracil-DNA glycosylase superfamily  37.85 
 
 
281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718462  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0248  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  31.15 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  0.366992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0318  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  34.46 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100378  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1649  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.71 
 
 
209 aa  62.8  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00048269 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0717  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35 
 
 
195 aa  62.4  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.667137 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2515  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.29 
 
 
231 aa  60.8  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1393  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.46 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1937  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.98 
 
 
285 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.090684  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.53 
 
 
204 aa  60.5  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.3735  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2071  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.33 
 
 
211 aa  60.8  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.5 
 
 
205 aa  59.3  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3154  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.88 
 
 
201 aa  58.9  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2491  DNA polymerase domain-containing protein  32.62 
 
 
264 aa  58.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.78 
 
 
264 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2370  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.44 
 
 
245 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114234  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1589  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.44 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1494  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.44 
 
 
295 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.363091  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.56 
 
 
304 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1308  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.25 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0132537  normal  0.393253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1242  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.81 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.738609 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0689  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.23 
 
 
294 aa  56.6  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614175  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1363  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.57 
 
 
341 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5352  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28 
 
 
336 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1912  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.22 
 
 
199 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0798  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.23 
 
 
217 aa  56.2  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0718  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.48 
 
 
193 aa  56.2  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.809619 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2882  uracil-DNA glycosylase family 4 protein  31.76 
 
 
308 aa  55.8  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1944  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28 
 
 
345 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>