99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1079 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1079  Uracil-DNA glycosylase superfamily  100 
 
 
291 aa  567  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0935  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  63.74 
 
 
284 aa  328  9e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11285  hypothetical protein  63.24 
 
 
299 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1028  Uracil-DNA glycosylase superfamily  60.93 
 
 
294 aa  313  1.9999999999999998e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250169  normal  0.0211091 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3128  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  61.89 
 
 
268 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56795  hitchhiker  0.0037268 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4459  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  60.3 
 
 
284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1040  Uracil-DNA glycosylase superfamily  61.51 
 
 
301 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2236  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  57.56 
 
 
282 aa  301  7.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8576  uracil-DNA glycosylase superfamily  61.92 
 
 
266 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.610367  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3919  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  61.69 
 
 
271 aa  285  4e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0925  Uracil-DNA glycosylase superfamily  61.29 
 
 
261 aa  276  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394614  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4031  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  61.03 
 
 
273 aa  275  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3957  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  61.03 
 
 
273 aa  275  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3971  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  61.03 
 
 
273 aa  275  4e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.649617  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32190  uracil-DNA glycosylase  61.67 
 
 
235 aa  272  5.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.657779  normal  0.0875972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5298  Uracil-DNA glycosylase superfamily  62.34 
 
 
240 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0811  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  60.98 
 
 
262 aa  264  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0440  Uracil-DNA glycosylase superfamily  57.26 
 
 
251 aa  259  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0842  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  62.88 
 
 
230 aa  257  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558809  normal  0.314333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5226  Uracil-DNA glycosylase superfamily  57.26 
 
 
244 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18668  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0899  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  63.76 
 
 
253 aa  251  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242395  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3772  Uracil-DNA glycosylase superfamily  61.74 
 
 
226 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.817518  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1903  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  56.49 
 
 
312 aa  251  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29970  uracil-DNA glycosylase  54.55 
 
 
266 aa  248  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.50722 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0682  Uracil-DNA glycosylase superfamily  57.87 
 
 
276 aa  245  6.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263882  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3631  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  61.36 
 
 
226 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3689  Uracil-DNA glycosylase superfamily protein  61.36 
 
 
226 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1651  Uracil-DNA glycosylase superfamily  56.41 
 
 
299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5791  Uracil-DNA glycosylase superfamily  56.28 
 
 
233 aa  232  5e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2949  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  58.87 
 
 
228 aa  223  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1564  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  50.93 
 
 
228 aa  215  9e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  hitchhiker  0.00784209 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3233  Uracil-DNA glycosylase superfamily  56.82 
 
 
281 aa  209  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718462  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2636  Uracil-DNA glycosylase superfamily  52.42 
 
 
221 aa  208  9e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3164  Uracil-DNA glycosylase superfamily  52.16 
 
 
221 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.368387  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1386  Uracil-DNA glycosylase superfamily  45.92 
 
 
236 aa  191  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0479897  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3755  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  57.3 
 
 
186 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0169947  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0366  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.65 
 
 
217 aa  175  7e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0544  Uracil-DNA glycosylase superfamily  38.16 
 
 
219 aa  168  8e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1921  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.61 
 
 
210 aa  159  5e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.21092 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1169  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.23 
 
 
206 aa  155  1e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00763816 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0736  putative uracil-DNA glycosylase  41.67 
 
 
224 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1599  Uracil-DNA glycosylase superfamily  44.6 
 
 
212 aa  152  8e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0720375  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0814  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.91 
 
 
231 aa  150  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0720  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.66 
 
 
217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1579  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.9 
 
 
220 aa  145  9e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.111562  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2864  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.33 
 
 
223 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.48935  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3835  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.18 
 
 
233 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1361  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.72 
 
 
214 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1269  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.9 
 
 
238 aa  136  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0703  hypothetical protein  41.12 
 
 
207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.109523 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2258  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.65 
 
 
242 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0527  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.13 
 
 
211 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0572467  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1722  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.65 
 
 
225 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.598455  normal  0.212618 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1908  hypothetical protein  41.51 
 
 
218 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.443294  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1220  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.44 
 
 
232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58979  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0380  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.18 
 
 
232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.172992  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2644  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.04 
 
 
225 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0136839  hitchhiker  0.00783391 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2965  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.51 
 
 
224 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2605  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.11 
 
 
200 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0477634  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4690  putative uracil-DNA glycosylase  39.34 
 
 
229 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  0.0692516 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1001  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.92 
 
 
228 aa  125  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00625229 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1925  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.23 
 
 
225 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1860  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.4 
 
 
214 aa  122  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0361601  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0818  Uracil-DNA glycosylase superfamily  44 
 
 
215 aa  122  9e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0737592  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1551  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.27 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2632  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.73 
 
 
226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.122532  normal  0.188311 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2448  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.72 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0648  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.12 
 
 
223 aa  115  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0642  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.12 
 
 
223 aa  115  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0466  uracil DNA glycosylase family protein  37.33 
 
 
228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.276682  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0943  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  34.8 
 
 
220 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0789384  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2037  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.46 
 
 
215 aa  109  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.161308  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2639  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.09 
 
 
216 aa  108  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.990849  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0318  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.82 
 
 
193 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100378  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0248  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  34.46 
 
 
192 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  0.366992 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3405  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.73 
 
 
300 aa  59.3  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.76 
 
 
204 aa  55.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.3735  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1056  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.39 
 
 
196 aa  54.3  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.43 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2882  uracil-DNA glycosylase family 4 protein  28.08 
 
 
308 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.08 
 
 
308 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.934489  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0183  Uracil-DNA glycosylase superfamily  30.34 
 
 
210 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.589955  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1649  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.27 
 
 
209 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00048269 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1768  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.39 
 
 
194 aa  47.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0119  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  24.73 
 
 
191 aa  46.6  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2152  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.95 
 
 
241 aa  46.2  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4460  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.52 
 
 
207 aa  46.2  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1447  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.86 
 
 
200 aa  46.2  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1912  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.77 
 
 
199 aa  45.8  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1494  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.33 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.363091  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1589  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.33 
 
 
205 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2449  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.54 
 
 
210 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2370  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.33 
 
 
245 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114234  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2515  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.43 
 
 
231 aa  43.5  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0717  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.38 
 
 
195 aa  43.5  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.667137 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0356  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.26 
 
 
225 aa  43.1  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.606658  normal  0.0957243 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1530  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.6 
 
 
237 aa  43.5  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.929969  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3154  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.78 
 
 
201 aa  42.4  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2660  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.86 
 
 
205 aa  42.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.405963  normal  0.388577 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>