248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2864 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2864  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  100 
 
 
223 aa  454  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.48935  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2258  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  67.91 
 
 
242 aa  288  3e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2965  Uracil-DNA glycosylase superfamily  69.46 
 
 
224 aa  288  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2632  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  69.12 
 
 
226 aa  286  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.122532  normal  0.188311 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2644  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  65.9 
 
 
225 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0136839  hitchhiker  0.00783391 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2605  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  69 
 
 
200 aa  281  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0477634  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1579  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  65.44 
 
 
220 aa  281  5.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.111562  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3835  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  67.15 
 
 
233 aa  280  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1925  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  67.62 
 
 
225 aa  271  7e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1722  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  58.85 
 
 
225 aa  258  6e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.598455  normal  0.212618 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1001  Uracil-DNA glycosylase superfamily  59.28 
 
 
228 aa  256  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00625229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4690  putative uracil-DNA glycosylase  63.55 
 
 
229 aa  256  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  0.0692516 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2448  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  62.38 
 
 
236 aa  256  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1551  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  61.31 
 
 
220 aa  249  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0380  Uracil-DNA glycosylase superfamily  57.08 
 
 
232 aa  246  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.172992  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1860  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  60.39 
 
 
214 aa  245  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0361601  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0642  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  57.21 
 
 
223 aa  242  3e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0648  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  57.21 
 
 
223 aa  242  3.9999999999999997e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0466  uracil DNA glycosylase family protein  54.84 
 
 
228 aa  238  5.999999999999999e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.276682  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2639  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  56.28 
 
 
216 aa  237  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.990849  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0527  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  58.91 
 
 
211 aa  236  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0572467  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0943  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  56.19 
 
 
220 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0789384  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1599  Uracil-DNA glycosylase superfamily  58.91 
 
 
212 aa  231  5e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0720375  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1220  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  54.59 
 
 
232 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58979  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0703  hypothetical protein  54.77 
 
 
207 aa  219  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.109523 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1908  hypothetical protein  56.72 
 
 
218 aa  219  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.443294  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1361  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  54.41 
 
 
214 aa  208  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1269  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  50 
 
 
238 aa  206  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2037  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  48.08 
 
 
215 aa  192  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.161308  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2636  Uracil-DNA glycosylase superfamily  46.83 
 
 
221 aa  184  9e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3164  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.19 
 
 
221 aa  181  6e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.368387  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0736  putative uracil-DNA glycosylase  46.63 
 
 
224 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1564  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.96 
 
 
228 aa  170  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  hitchhiker  0.00784209 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5791  Uracil-DNA glycosylase superfamily  45.05 
 
 
233 aa  159  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2949  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.54 
 
 
228 aa  155  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3631  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.23 
 
 
226 aa  154  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0440  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.01 
 
 
251 aa  153  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3772  Uracil-DNA glycosylase superfamily  44.7 
 
 
226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.817518  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32190  uracil-DNA glycosylase  41.41 
 
 
235 aa  151  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.657779  normal  0.0875972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0682  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.61 
 
 
276 aa  150  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263882  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3689  Uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.28 
 
 
226 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5226  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.91 
 
 
244 aa  148  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18668  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11285  hypothetical protein  42.72 
 
 
299 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0366  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.15 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0935  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.06 
 
 
284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1028  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.52 
 
 
294 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250169  normal  0.0211091 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5298  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.9 
 
 
240 aa  142  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1079  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.6 
 
 
291 aa  141  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2236  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.91 
 
 
282 aa  141  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1903  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.1 
 
 
312 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8576  uracil-DNA glycosylase superfamily  39.52 
 
 
266 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.610367  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29970  uracil-DNA glycosylase  41.12 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.50722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0811  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.14 
 
 
262 aa  138  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0842  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.55 
 
 
230 aa  138  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558809  normal  0.314333 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0925  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.52 
 
 
261 aa  137  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394614  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0899  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.09 
 
 
253 aa  136  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242395  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1921  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.05 
 
 
210 aa  136  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.21092 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1651  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40 
 
 
299 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3755  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.16 
 
 
186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0169947  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0720  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40 
 
 
217 aa  134  8e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1040  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.17 
 
 
301 aa  134  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0544  Uracil-DNA glycosylase superfamily  36.45 
 
 
219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1386  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40.36 
 
 
236 aa  132  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0479897  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1169  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.92 
 
 
206 aa  132  5e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00763816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3128  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40 
 
 
268 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56795  hitchhiker  0.0037268 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3919  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.28 
 
 
271 aa  129  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4459  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.52 
 
 
284 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0818  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40.82 
 
 
215 aa  123  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0737592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3233  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.28 
 
 
281 aa  118  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718462  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3957  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.28 
 
 
273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4031  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.28 
 
 
273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3971  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.28 
 
 
273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.649617  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0814  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.06 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0248  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  32.64 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  0.366992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0318  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  34.27 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100378  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1126  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.77 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0426  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.43 
 
 
193 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000629945  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.78 
 
 
264 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0411  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.43 
 
 
193 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000323475  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2076  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.16 
 
 
194 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1242  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.11 
 
 
264 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.738609 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1649  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.53 
 
 
209 aa  62  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00048269 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2515  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.53 
 
 
231 aa  61.6  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1308  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.11 
 
 
264 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0132537  normal  0.393253 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0689  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.23 
 
 
294 aa  61.2  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614175  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.42 
 
 
204 aa  60.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.3735  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2152  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.89 
 
 
241 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1948  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.48 
 
 
190 aa  59.7  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.735506  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1992  hypothetical protein  29.38 
 
 
211 aa  59.7  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.770462  normal  0.123925 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.76 
 
 
304 aa  59.7  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0718  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.58 
 
 
193 aa  58.9  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.809619 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0014  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.8 
 
 
263 aa  58.9  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.45 
 
 
220 aa  58.9  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0717  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.57 
 
 
195 aa  58.9  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.667137 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1369  putative DNA polymerase-related protein, bacteriophage-type  31.46 
 
 
292 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.424674  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2305  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.11 
 
 
192 aa  58.5  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0147899 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1912  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.74 
 
 
199 aa  58.2  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0091  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.16 
 
 
216 aa  57.8  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1393  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.54 
 
 
210 aa  58.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1530  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.84 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.929969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>