More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0426 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0411  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  100 
 
 
193 aa  394  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000323475  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0426  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  100 
 
 
193 aa  394  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000629945  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0157  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  60.96 
 
 
200 aa  236  1e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0205394  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0147  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.08 
 
 
202 aa  212  1.9999999999999998e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  57.32 
 
 
205 aa  190  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1085  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  58.93 
 
 
217 aa  189  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.863324  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1940  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.68 
 
 
205 aa  185  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000409376 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50 
 
 
210 aa  184  9e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0466  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.9 
 
 
264 aa  171  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113584  hitchhiker  0.00887798 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0795  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.74 
 
 
219 aa  171  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0936  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.19 
 
 
196 aa  171  9e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0082  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.2 
 
 
264 aa  168  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1500  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.98 
 
 
255 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.43423  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1351  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.3 
 
 
226 aa  167  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.71 
 
 
186 aa  166  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000159527  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11480  Uracil-DNA glycosylase  48.86 
 
 
210 aa  166  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.89 
 
 
249 aa  164  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.133247  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0893  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.09 
 
 
227 aa  164  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148707 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0259  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.36 
 
 
238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382173  normal  0.0633983 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5828  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.88 
 
 
209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1487  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.62 
 
 
245 aa  162  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3960  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.56 
 
 
191 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300932  hitchhiker  0.00000000403692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2449  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.71 
 
 
210 aa  162  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_379  uracil DNA glycosylase superfamily, DNA polymerase bacteriophage-type  46.96 
 
 
206 aa  161  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1838  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.7 
 
 
185 aa  161  7e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4431  phage SPO1 DNA polymerase-like protein  46.49 
 
 
226 aa  159  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.696718  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3108  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.62 
 
 
189 aa  159  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1393  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.22 
 
 
210 aa  159  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2543  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.52 
 
 
235 aa  158  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0670794  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0413  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.36 
 
 
242 aa  158  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.13684  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1494  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.26 
 
 
295 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.363091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2925  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.55 
 
 
259 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0091  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.03 
 
 
216 aa  156  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2370  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.49 
 
 
245 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114234  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1589  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.26 
 
 
205 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.41 
 
 
206 aa  155  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0748398  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3067  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.71 
 
 
187 aa  155  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000874061  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.45 
 
 
209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1126  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.39 
 
 
235 aa  154  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.32 
 
 
220 aa  153  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0290  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.88 
 
 
207 aa  154  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2605  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.67 
 
 
203 aa  152  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0333  hypothetical protein  40.74 
 
 
200 aa  152  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0798  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.08 
 
 
217 aa  152  4e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2009  phage SpO1 DNA polymerase-related protein  45.6 
 
 
224 aa  152  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331799  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2416  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.71 
 
 
190 aa  152  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1870  Uracil-DNA glycosylase-like protein  47.24 
 
 
233 aa  151  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00147256  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0718  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.44 
 
 
193 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.809619 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4076  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.39 
 
 
212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.134405  normal  0.334505 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3775  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.2 
 
 
273 aa  151  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.858318  normal  0.0557135 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2276  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.24 
 
 
243 aa  150  8e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1297  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.43 
 
 
187 aa  150  8e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2076  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.66 
 
 
194 aa  150  8.999999999999999e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0314  hypothetical protein  40.21 
 
 
200 aa  150  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1912  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.78 
 
 
199 aa  150  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2671  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.74 
 
 
253 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.663672 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1649  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.31 
 
 
209 aa  150  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00048269 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0200  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.32 
 
 
305 aa  149  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0483  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.92 
 
 
195 aa  149  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000659964  normal  0.795166 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1056  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.2 
 
 
196 aa  148  6e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2305  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50 
 
 
192 aa  148  6e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0147899 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0113  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.82 
 
 
206 aa  147  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.89 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1948  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.9 
 
 
190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.735506  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0270  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.3 
 
 
249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0438  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.68 
 
 
189 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0437  uracil-DNA glycosylase, putative  46.2 
 
 
189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0292507  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2071  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.62 
 
 
211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1180  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.03 
 
 
187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2028  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.53 
 
 
290 aa  145  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.13 
 
 
304 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01520  uracil-DNA glycosylase, family 4  42.22 
 
 
195 aa  144  5e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0226409 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0839  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.66 
 
 
297 aa  144  9e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0413074 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0231  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.11 
 
 
252 aa  144  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0104568  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1242  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.02 
 
 
264 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.738609 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2596  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.51 
 
 
301 aa  143  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.213752 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1308  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.46 
 
 
264 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0132537  normal  0.393253 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0119  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.67 
 
 
191 aa  142  3e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1244  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.18 
 
 
221 aa  142  4e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3405  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.72 
 
 
300 aa  142  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1236  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.91 
 
 
220 aa  141  5e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.289271  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4359  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.62 
 
 
277 aa  141  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0982104  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0503  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.61 
 
 
216 aa  141  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0365  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.38 
 
 
208 aa  141  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0689  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.49 
 
 
294 aa  141  7e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614175  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1944  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.86 
 
 
345 aa  141  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07331  Uracil-DNA glycosylase  51.39 
 
 
187 aa  140  8e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.444861  hitchhiker  0.00512235 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2893  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.12 
 
 
254 aa  140  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.260893  normal  0.720547 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1228  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.11 
 
 
276 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.86 
 
 
367 aa  141  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07710  uracil-DNA glycosylase, family 4  42.26 
 
 
213 aa  140  9e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1556  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.56 
 
 
230 aa  140  9e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.199846  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44 
 
 
308 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.934489  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0108  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.69 
 
 
187 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0443  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.51 
 
 
281 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1234  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.68 
 
 
358 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532559  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2882  uracil-DNA glycosylase family 4 protein  44 
 
 
308 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.24 
 
 
330 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2043  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.06 
 
 
346 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0356  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.45 
 
 
225 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.606658  normal  0.0957243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>