179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0380 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0380  Uracil-DNA glycosylase superfamily  100 
 
 
232 aa  471  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.172992  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3835  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  60.85 
 
 
233 aa  257  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2632  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  62.14 
 
 
226 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.122532  normal  0.188311 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2965  Uracil-DNA glycosylase superfamily  57.4 
 
 
224 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0527  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  57.49 
 
 
211 aa  247  9e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0572467  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2258  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  56.88 
 
 
242 aa  246  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2864  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  57.08 
 
 
223 aa  246  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.48935  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2644  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  58.74 
 
 
225 aa  241  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0136839  hitchhiker  0.00783391 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1925  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  59.71 
 
 
225 aa  240  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2605  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  59 
 
 
200 aa  234  8e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0477634  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4690  putative uracil-DNA glycosylase  53.51 
 
 
229 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  0.0692516 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0943  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  55.71 
 
 
220 aa  229  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0789384  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1001  Uracil-DNA glycosylase superfamily  56.4 
 
 
228 aa  227  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00625229 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1722  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  54.33 
 
 
225 aa  223  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.598455  normal  0.212618 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1860  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  55.29 
 
 
214 aa  223  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0361601  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1579  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  54.33 
 
 
220 aa  223  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.111562  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2448  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  53.59 
 
 
236 aa  223  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0642  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  55.29 
 
 
223 aa  218  5e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0648  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.29 
 
 
223 aa  218  6e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1908  hypothetical protein  55.78 
 
 
218 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.443294  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1599  Uracil-DNA glycosylase superfamily  54.19 
 
 
212 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0720375  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1551  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  50.98 
 
 
220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1220  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  52.5 
 
 
232 aa  211  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58979  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2639  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  51.2 
 
 
216 aa  205  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.990849  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0703  hypothetical protein  49.49 
 
 
207 aa  202  5e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.109523 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0466  uracil DNA glycosylase family protein  49.05 
 
 
228 aa  199  3e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.276682  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1269  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.87 
 
 
238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1361  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  51.49 
 
 
214 aa  192  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2037  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  48.56 
 
 
215 aa  188  7e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.161308  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0736  putative uracil-DNA glycosylase  42.65 
 
 
224 aa  165  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2636  Uracil-DNA glycosylase superfamily  45.19 
 
 
221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3164  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.2 
 
 
221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.368387  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1564  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.06 
 
 
228 aa  154  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  hitchhiker  0.00784209 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32190  uracil-DNA glycosylase  43.72 
 
 
235 aa  150  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.657779  normal  0.0875972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0682  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.85 
 
 
276 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263882  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0925  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.86 
 
 
261 aa  140  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394614  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5298  Uracil-DNA glycosylase superfamily  44.91 
 
 
240 aa  141  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1028  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.86 
 
 
294 aa  135  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250169  normal  0.0211091 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1651  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.1 
 
 
299 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1921  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.21092 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1169  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.45 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00763816 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0720  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.39 
 
 
217 aa  131  6.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3128  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.47 
 
 
268 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56795  hitchhiker  0.0037268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2236  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.53 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3772  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40.09 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.817518  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11285  hypothetical protein  40 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1079  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.18 
 
 
291 aa  129  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1903  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.28 
 
 
312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0544  Uracil-DNA glycosylase superfamily  35.71 
 
 
219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5791  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40.76 
 
 
233 aa  128  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0366  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.02 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3689  Uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.6 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1040  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.73 
 
 
301 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29970  uracil-DNA glycosylase  40.91 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.50722 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4459  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.62 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0899  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.72 
 
 
253 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242395  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0842  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.72 
 
 
230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558809  normal  0.314333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2949  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.82 
 
 
228 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0440  Uracil-DNA glycosylase superfamily  37.62 
 
 
251 aa  125  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5226  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.91 
 
 
244 aa  125  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18668  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3631  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.11 
 
 
226 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3755  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.67 
 
 
186 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0169947  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3233  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.06 
 
 
281 aa  124  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718462  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3957  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.62 
 
 
273 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4031  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.62 
 
 
273 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3971  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.62 
 
 
273 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.649617  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0935  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.31 
 
 
284 aa  122  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3919  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.86 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8576  uracil-DNA glycosylase superfamily  37.67 
 
 
266 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.610367  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0811  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.3 
 
 
262 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0814  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.7 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0818  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40.21 
 
 
215 aa  112  6e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0737592  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1386  Uracil-DNA glycosylase superfamily  34.1 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0479897  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0248  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  34.04 
 
 
192 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  0.366992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0318  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  32.82 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100378  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0082  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.61 
 
 
264 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.53 
 
 
204 aa  57.4  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.3735  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2305  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.17 
 
 
192 aa  56.6  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0147899 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1530  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.84 
 
 
237 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.929969  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3154  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.37 
 
 
201 aa  55.1  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1126  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.15 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.03 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.133247  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1948  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.63 
 
 
190 aa  54.7  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.735506  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0119  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25.76 
 
 
191 aa  54.7  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3405  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.28 
 
 
300 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1500  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.77 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.43423  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0718  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.86 
 
 
193 aa  53.1  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.809619 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1487  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.23 
 
 
245 aa  52.8  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0717  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.65 
 
 
195 aa  53.1  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.667137 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1649  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.53 
 
 
209 aa  52.8  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00048269 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.09 
 
 
220 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2076  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.47 
 
 
194 aa  52.4  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2515  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.97 
 
 
231 aa  52.4  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1494  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.77 
 
 
295 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.363091  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1447  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.56 
 
 
200 aa  52  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0426  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.3 
 
 
193 aa  52  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000629945  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0411  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.3 
 
 
193 aa  52  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000323475  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2370  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.77 
 
 
245 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114234  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1589  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.77 
 
 
205 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0157  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.88 
 
 
200 aa  51.6  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0205394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>