More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1530 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1530  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  100 
 
 
237 aa  476  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.929969  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11480  Uracil-DNA glycosylase  42.66 
 
 
210 aa  118  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353711  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1479  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.4 
 
 
184 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0426  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.65 
 
 
193 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000629945  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1351  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.75 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0411  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.65 
 
 
193 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000323475  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1649  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.31 
 
 
209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00048269 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1056  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.63 
 
 
196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0147  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.2 
 
 
202 aa  109  5e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0483  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.76 
 
 
195 aa  108  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000659964  normal  0.795166 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1244  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.14 
 
 
221 aa  108  6e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0157  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.56 
 
 
200 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0205394  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1556  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.67 
 
 
230 aa  108  9.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.199846  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.03 
 
 
210 aa  106  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1126  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.39 
 
 
235 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3067  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.66 
 
 
187 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000874061  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1589  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.26 
 
 
205 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1494  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.13 
 
 
295 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.363091  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.36 
 
 
186 aa  105  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000159527  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2305  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.69 
 
 
192 aa  105  5e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0147899 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0290  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.26 
 
 
207 aa  105  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2009  phage SpO1 DNA polymerase-related protein  42.47 
 
 
224 aa  105  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331799  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5828  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.06 
 
 
209 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.11 
 
 
220 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2370  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.84 
 
 
245 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114234  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.31 
 
 
264 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1948  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.71 
 
 
190 aa  104  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.735506  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1085  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.87 
 
 
217 aa  104  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.863324  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2925  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.56 
 
 
259 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5015  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.85 
 
 
380 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.641312  normal  0.046521 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0440  uracil-DNA glycosylase  38.85 
 
 
275 aa  103  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0798  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.42 
 
 
217 aa  103  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0718  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.23 
 
 
193 aa  103  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.809619 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1500  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.3 
 
 
255 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.43423  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0091  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.71 
 
 
216 aa  102  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1940  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.16 
 
 
205 aa  102  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000409376 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1838  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.11 
 
 
185 aa  102  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.44 
 
 
249 aa  102  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.133247  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2671  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.28 
 
 
253 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.663672 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1083  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.75 
 
 
277 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.761546 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0936  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.86 
 
 
196 aa  102  8e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07710  uracil-DNA glycosylase, family 4  34.5 
 
 
213 aa  101  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.26 
 
 
209 aa  100  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2543  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.89 
 
 
235 aa  100  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0670794  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2345  putative DNA polymerase  38.51 
 
 
274 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.191175  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2071  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.62 
 
 
211 aa  101  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2152  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.76 
 
 
241 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2161  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.43 
 
 
191 aa  99.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.336529  hitchhiker  0.000279236 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2076  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.32 
 
 
194 aa  99.4  4e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1912  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.96 
 
 
199 aa  99  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0413  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.85 
 
 
242 aa  99.4  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.13684  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.36 
 
 
205 aa  99  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1210  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.52 
 
 
282 aa  98.6  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal  0.843697 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1487  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.57 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0438  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.06 
 
 
189 aa  97.8  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0717  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.97 
 
 
195 aa  97.8  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.667137 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0909  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.86 
 
 
285 aa  97.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0200  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.77 
 
 
305 aa  98.2  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1058  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.67 
 
 
276 aa  97.8  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4359  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.3 
 
 
277 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0982104  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4431  phage SPO1 DNA polymerase-like protein  34.48 
 
 
226 aa  97.1  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.696718  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_379  uracil DNA glycosylase superfamily, DNA polymerase bacteriophage-type  33.68 
 
 
206 aa  96.7  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3405  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.86 
 
 
300 aa  96.7  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1937  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.67 
 
 
285 aa  96.3  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.090684  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1447  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.83 
 
 
200 aa  96.3  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3154  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.86 
 
 
201 aa  96.3  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0082  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.59 
 
 
264 aa  95.9  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1297  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.89 
 
 
187 aa  95.5  6e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1228  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.32 
 
 
276 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1308  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.04 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0132537  normal  0.393253 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2276  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.31 
 
 
243 aa  94.7  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0259  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.89 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382173  normal  0.0633983 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2334  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.04 
 
 
219 aa  94  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07331  Uracil-DNA glycosylase  37.5 
 
 
187 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.444861  hitchhiker  0.00512235 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1242  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.73 
 
 
264 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.738609 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1983  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.41 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.643872 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0108  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.81 
 
 
187 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2596  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.67 
 
 
301 aa  93.2  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.213752 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.58 
 
 
304 aa  93.2  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0265  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.56 
 
 
211 aa  93.2  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01520  uracil-DNA glycosylase, family 4  39.57 
 
 
195 aa  93.6  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0226409 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3219  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.67 
 
 
289 aa  93.2  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2416  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.12 
 
 
190 aa  93.6  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0437  uracil-DNA glycosylase, putative  34.97 
 
 
189 aa  92.8  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0292507  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2784  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.35 
 
 
211 aa  92.8  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0335572 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2121  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.41 
 
 
271 aa  92.4  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0266  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.43 
 
 
315 aa  92.4  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1723  putative phage DNA polymerase  39.04 
 
 
213 aa  92  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3061  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.01 
 
 
255 aa  92  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.247484  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1870  Uracil-DNA glycosylase-like protein  37.58 
 
 
233 aa  92  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00147256  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0119  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.74 
 
 
191 aa  92  7e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0466  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.36 
 
 
264 aa  91.7  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113584  hitchhiker  0.00887798 
 
 
-
 
NC_004310  BR0620  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.88 
 
 
290 aa  90.9  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.316003  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1768  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.77 
 
 
194 aa  91.3  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0893  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.31 
 
 
227 aa  90.9  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148707 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2515  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.06 
 
 
231 aa  90.9  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0619  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.88 
 
 
290 aa  90.9  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5420  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.52 
 
 
300 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2893  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.31 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.260893  normal  0.720547 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.01 
 
 
204 aa  90.9  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.3735  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>