More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0266 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0266  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  100 
 
 
315 aa  619  1e-176  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2373  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.7 
 
 
307 aa  242  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2028  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.83 
 
 
290 aa  236  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1058  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  63.24 
 
 
276 aa  235  6e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3219  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.5 
 
 
289 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1083  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.08 
 
 
277 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.761546 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0619  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.75 
 
 
290 aa  231  9e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0620  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.75 
 
 
290 aa  231  9e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.316003  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0718  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.64 
 
 
290 aa  231  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0440  uracil-DNA glycosylase  44.53 
 
 
275 aa  229  5e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2659  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.61 
 
 
285 aa  229  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.845005  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2596  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.52 
 
 
301 aa  229  6e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.213752 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1228  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.07 
 
 
276 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1210  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.12 
 
 
282 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal  0.843697 
 
 
-
 
NC_002978  WD0164  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.6 
 
 
273 aa  223  4.9999999999999996e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4246  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.44 
 
 
323 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.558315  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5420  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.78 
 
 
300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.69 
 
 
278 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0074  uracil-DNA glycosylase  40.07 
 
 
261 aa  217  2e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2345  putative DNA polymerase  49.26 
 
 
274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.191175  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3061  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.89 
 
 
255 aa  216  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.247484  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3901  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.8 
 
 
300 aa  215  7e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.463834  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0044  DNA polymerase-related protein  39.57 
 
 
261 aa  214  9.999999999999999e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0909  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.71 
 
 
285 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4076  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.93 
 
 
295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0936  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41 
 
 
299 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269917  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4616  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.24 
 
 
334 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259396  normal  0.244304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4359  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.81 
 
 
277 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0982104  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2189  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.51 
 
 
286 aa  209  6e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0443  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.59 
 
 
281 aa  207  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0647  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.86 
 
 
289 aa  206  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.268073 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4766  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.97 
 
 
309 aa  206  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0935  uracil-DNA glycosylase  49.2 
 
 
255 aa  202  9e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3090  uracil-DNA glycosylase  53.37 
 
 
265 aa  199  7e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.646333  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1085  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.86 
 
 
299 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.735603  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1384  DNA polymerase  41.7 
 
 
302 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0442603  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2661  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.01 
 
 
260 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.642929  normal  0.357955 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1001  hypothetical protein  43.01 
 
 
260 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0224  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.34 
 
 
259 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.215269  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2009  phage SpO1 DNA polymerase-related protein  50.27 
 
 
224 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331799  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.13 
 
 
330 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3405  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.61 
 
 
300 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1242  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.98 
 
 
264 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.738609 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1369  putative DNA polymerase-related protein, bacteriophage-type  47.76 
 
 
292 aa  176  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.424674  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1308  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.47 
 
 
264 aa  175  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0132537  normal  0.393253 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2166  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.27 
 
 
272 aa  175  9e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.832765  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2481  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45 
 
 
414 aa  175  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  hitchhiker  0.000867118 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1723  putative phage DNA polymerase  49.46 
 
 
213 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.07 
 
 
367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0466  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.09 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113584  hitchhiker  0.00887798 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1944  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.07 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2062  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.38 
 
 
342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5352  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.38 
 
 
336 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1363  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.45 
 
 
341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6034  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.38 
 
 
346 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0371104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2043  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.38 
 
 
346 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1494  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.07 
 
 
295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.363091  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2003  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  48.3 
 
 
433 aa  172  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0372  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.68 
 
 
294 aa  172  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000046016 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2543  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.49 
 
 
235 aa  172  5.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0670794  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1656  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.94 
 
 
401 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00964982 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2370  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.19 
 
 
245 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114234  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1589  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.07 
 
 
205 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3230  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  48.02 
 
 
455 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2082  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  48.02 
 
 
455 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.268517  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2519  uracil-DNA glycosylase  48.3 
 
 
455 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2463  uracil-DNA glycosylase  48.3 
 
 
455 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1397  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.29 
 
 
317 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.60425 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1355  uracil-DNA glycosylase  48.02 
 
 
455 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00548958  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2607  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  48.3 
 
 
468 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0303  putative DNA polymerase-related protein  49.47 
 
 
260 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440976  normal  0.0410762 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1937  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.86 
 
 
285 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.090684  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1234  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.79 
 
 
358 aa  170  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532559  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1580  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  48.3 
 
 
220 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0245048  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1500  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.03 
 
 
255 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.43423  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0014  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.69 
 
 
263 aa  169  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3960  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.7 
 
 
191 aa  169  7e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300932  hitchhiker  0.00000000403692 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2276  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.71 
 
 
243 aa  167  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2515  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.09 
 
 
231 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2121  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.68 
 
 
271 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1285  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.6 
 
 
274 aa  166  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2491  DNA polymerase domain-containing protein  45.64 
 
 
264 aa  165  9e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0438  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.88 
 
 
271 aa  163  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1556  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.46 
 
 
230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.199846  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0483  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.33 
 
 
195 aa  162  7e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000659964  normal  0.795166 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2152  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.71 
 
 
241 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.98 
 
 
308 aa  161  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.934489  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2882  uracil-DNA glycosylase family 4 protein  40.98 
 
 
308 aa  161  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0689  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.78 
 
 
294 aa  160  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614175  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0413  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.56 
 
 
242 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.13684  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.52 
 
 
264 aa  160  4e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.05 
 
 
210 aa  159  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2671  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.02 
 
 
253 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.663672 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3108  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.02 
 
 
189 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.75 
 
 
205 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0259  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.42 
 
 
238 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382173  normal  0.0633983 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0314  hypothetical protein  45.61 
 
 
200 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.6 
 
 
249 aa  157  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.133247  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5828  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.14 
 
 
209 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0333  hypothetical protein  45.61 
 
 
200 aa  156  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>