More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0372 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0372  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  100 
 
 
294 aa  580  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000046016 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0303  putative DNA polymerase-related protein  56.9 
 
 
260 aa  309  4e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440976  normal  0.0410762 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1937  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  68.95 
 
 
285 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.090684  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1397  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  65.13 
 
 
317 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.60425 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1369  putative DNA polymerase-related protein, bacteriophage-type  66.84 
 
 
292 aa  276  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.424674  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2003  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  64.65 
 
 
433 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1363  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  64.58 
 
 
341 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2463  uracil-DNA glycosylase  64.77 
 
 
455 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2519  uracil-DNA glycosylase  64.14 
 
 
455 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1308  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  63.64 
 
 
264 aa  269  5e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0132537  normal  0.393253 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3230  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  64.14 
 
 
455 aa  268  7e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1355  uracil-DNA glycosylase  64.14 
 
 
455 aa  268  7e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00548958  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2082  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  64.14 
 
 
455 aa  268  7e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.268517  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2607  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  64.14 
 
 
468 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1944  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  64.4 
 
 
345 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.47 
 
 
367 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1242  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  63.1 
 
 
264 aa  265  5e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.738609 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1656  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  65.45 
 
 
401 aa  265  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00964982 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1580  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  64.14 
 
 
220 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0245048  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1234  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  65.43 
 
 
358 aa  264  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532559  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6034  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  62.81 
 
 
346 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0371104  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2481  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  65.1 
 
 
414 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  hitchhiker  0.000867118 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2043  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  62.81 
 
 
346 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2062  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  62.31 
 
 
342 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5352  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.85 
 
 
336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2152  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.43 
 
 
241 aa  253  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  60.53 
 
 
330 aa  250  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2276  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  61.08 
 
 
243 aa  242  5e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2121  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  58.82 
 
 
271 aa  239  4e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.81 
 
 
264 aa  236  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2882  uracil-DNA glycosylase family 4 protein  48.51 
 
 
308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.51 
 
 
308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.934489  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  59.57 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0689  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.92 
 
 
294 aa  229  5e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614175  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2515  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  59.22 
 
 
231 aa  226  4e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1723  putative phage DNA polymerase  58.15 
 
 
213 aa  223  4e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1983  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.6 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.643872 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0552  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  56.99 
 
 
264 aa  205  6e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446381  hitchhiker  0.00103013 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1500  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.6 
 
 
255 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.43423  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1494  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  56 
 
 
295 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.363091  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2009  phage SpO1 DNA polymerase-related protein  56.32 
 
 
224 aa  202  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331799  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1589  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  56 
 
 
205 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2370  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.02 
 
 
245 aa  201  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114234  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2925  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.18 
 
 
259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0466  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.98 
 
 
264 aa  196  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113584  hitchhiker  0.00887798 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3405  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.26 
 
 
300 aa  193  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2671  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.26 
 
 
253 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.663672 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0333  hypothetical protein  51.79 
 
 
200 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0314  hypothetical protein  51.79 
 
 
200 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.71 
 
 
249 aa  186  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.133247  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1126  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.29 
 
 
235 aa  185  9e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0014  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50 
 
 
263 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5015  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50 
 
 
380 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.641312  normal  0.046521 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0082  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50 
 
 
264 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2491  DNA polymerase domain-containing protein  42.68 
 
 
264 aa  177  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2543  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.95 
 
 
235 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0670794  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3775  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.34 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.858318  normal  0.0557135 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.4 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1210  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.57 
 
 
282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal  0.843697 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0266  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.68 
 
 
315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0935  uracil-DNA glycosylase  46.56 
 
 
255 aa  172  5e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0200  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.57 
 
 
305 aa  172  6.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1083  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.19 
 
 
277 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.761546 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2028  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.19 
 
 
290 aa  170  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1912  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.47 
 
 
199 aa  169  4e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3219  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.68 
 
 
289 aa  169  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3960  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.16 
 
 
191 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300932  hitchhiker  0.00000000403692 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1228  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.02 
 
 
276 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.69 
 
 
209 aa  167  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.78 
 
 
210 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4359  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.45 
 
 
277 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0982104  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3067  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.57 
 
 
187 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000874061  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2605  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.39 
 
 
203 aa  166  5e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2596  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.89 
 
 
301 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.213752 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2345  putative DNA polymerase  46.89 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.191175  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2373  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.65 
 
 
307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0443  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.65 
 
 
281 aa  161  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2784  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.96 
 
 
211 aa  161  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0335572 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1940  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.85 
 
 
205 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000409376 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5828  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.7 
 
 
209 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4246  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.59 
 
 
323 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.558315  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0909  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.74 
 
 
285 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1870  Uracil-DNA glycosylase-like protein  43.82 
 
 
233 aa  160  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00147256  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4616  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.59 
 
 
334 aa  159  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259396  normal  0.244304 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0365  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.71 
 
 
208 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3108  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.32 
 
 
189 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4076  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.44 
 
 
295 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2661  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50 
 
 
260 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.642929  normal  0.357955 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3061  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.42 
 
 
255 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.247484  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0440  uracil-DNA glycosylase  42.45 
 
 
275 aa  156  4e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0164  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.55 
 
 
273 aa  156  5.0000000000000005e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0718  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.25 
 
 
290 aa  155  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0224  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.02 
 
 
259 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.215269  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.13 
 
 
186 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000159527  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1393  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.94 
 
 
210 aa  155  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4766  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.11 
 
 
309 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1001  hypothetical protein  49.44 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0074  uracil-DNA glycosylase  41.11 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0936  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.84 
 
 
196 aa  153  4e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1487  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.33 
 
 
245 aa  152  5e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>