More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2661 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2661  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  100 
 
 
260 aa  511  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.642929  normal  0.357955 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1001  hypothetical protein  98.46 
 
 
260 aa  501  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0224  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  83.4 
 
 
259 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.215269  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3901  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  60.59 
 
 
300 aa  315  3e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.463834  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3061  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  60.39 
 
 
255 aa  310  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.247484  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3090  uracil-DNA glycosylase  59.85 
 
 
265 aa  287  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.646333  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0438  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  59.69 
 
 
271 aa  267  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0718  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.48 
 
 
290 aa  212  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0909  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.88 
 
 
285 aa  210  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1228  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.27 
 
 
276 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1083  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.17 
 
 
277 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.761546 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4359  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.9 
 
 
277 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0982104  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0440  uracil-DNA glycosylase  41.83 
 
 
275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0620  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.76 
 
 
290 aa  199  5e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.316003  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0619  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.76 
 
 
290 aa  199  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3219  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.53 
 
 
289 aa  198  6e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1210  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.8 
 
 
282 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal  0.843697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2373  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.74 
 
 
307 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2659  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.58 
 
 
285 aa  192  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.845005  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2028  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.6 
 
 
290 aa  192  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0266  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.61 
 
 
315 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2345  putative DNA polymerase  52.17 
 
 
274 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.191175  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1058  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.33 
 
 
276 aa  186  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2596  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.88 
 
 
301 aa  184  9e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.213752 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.11 
 
 
278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0074  uracil-DNA glycosylase  44.67 
 
 
261 aa  181  1e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4616  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.68 
 
 
334 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259396  normal  0.244304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5420  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.47 
 
 
300 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2189  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.29 
 
 
286 aa  179  4.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4246  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.68 
 
 
323 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.558315  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4766  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.68 
 
 
309 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0164  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.93 
 
 
273 aa  177  2e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4076  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.68 
 
 
295 aa  176  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0044  DNA polymerase-related protein  42.93 
 
 
261 aa  175  6e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0443  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.14 
 
 
281 aa  175  7e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0935  uracil-DNA glycosylase  44.16 
 
 
255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2543  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.95 
 
 
235 aa  168  7e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0670794  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1126  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.03 
 
 
235 aa  168  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2009  phage SpO1 DNA polymerase-related protein  43.36 
 
 
224 aa  166  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331799  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0303  putative DNA polymerase-related protein  51.69 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440976  normal  0.0410762 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0259  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.06 
 
 
238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382173  normal  0.0633983 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5015  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.05 
 
 
380 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.641312  normal  0.046521 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2671  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.86 
 
 
253 aa  160  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.663672 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0372  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50 
 
 
294 aa  160  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000046016 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1500  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.96 
 
 
255 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.43423  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2925  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.28 
 
 
259 aa  156  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0936  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.34 
 
 
299 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269917  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0014  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.88 
 
 
263 aa  155  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2166  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.63 
 
 
272 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.832765  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0483  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.31 
 
 
195 aa  153  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000659964  normal  0.795166 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.15 
 
 
210 aa  154  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0413  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.72 
 
 
242 aa  153  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.13684  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1589  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.41 
 
 
205 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3067  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.51 
 
 
187 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000874061  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1085  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41 
 
 
299 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.735603  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.94 
 
 
249 aa  152  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.133247  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1369  putative DNA polymerase-related protein, bacteriophage-type  46.27 
 
 
292 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.424674  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.57 
 
 
330 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0647  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.92 
 
 
289 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.268073 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1494  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.32 
 
 
295 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.363091  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1308  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.98 
 
 
264 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0132537  normal  0.393253 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4431  phage SPO1 DNA polymerase-like protein  41.95 
 
 
226 aa  149  5e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.696718  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2370  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.32 
 
 
245 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114234  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1870  Uracil-DNA glycosylase-like protein  38.46 
 
 
233 aa  148  9e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00147256  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1242  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.4 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.738609 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.11 
 
 
205 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5828  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.55 
 
 
209 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2481  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.4 
 
 
414 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  hitchhiker  0.000867118 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0290  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.67 
 
 
207 aa  145  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2003  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  44.33 
 
 
433 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14331  Uracil-DNA glycosylase  47.02 
 
 
183 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1397  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.9 
 
 
317 aa  145  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.60425 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1556  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.12 
 
 
230 aa  145  8.000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.199846  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1838  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.86 
 
 
185 aa  145  9e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0333  hypothetical protein  41.85 
 
 
200 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0314  hypothetical protein  42.39 
 
 
200 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1297  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.54 
 
 
187 aa  144  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1656  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.57 
 
 
401 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00964982 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2276  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.59 
 
 
243 aa  143  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1580  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  43.84 
 
 
220 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0245048  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0893  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.38 
 
 
227 aa  142  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148707 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2463  uracil-DNA glycosylase  43.63 
 
 
455 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2121  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.52 
 
 
271 aa  142  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2519  uracil-DNA glycosylase  43.84 
 
 
455 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1355  uracil-DNA glycosylase  43.63 
 
 
455 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00548958  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2082  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  43.63 
 
 
455 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.268517  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3960  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.13 
 
 
191 aa  142  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300932  hitchhiker  0.00000000403692 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3230  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  43.63 
 
 
455 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0200  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.07 
 
 
305 aa  142  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1937  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.87 
 
 
285 aa  141  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.090684  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2607  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  44.06 
 
 
468 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0082  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.98 
 
 
264 aa  141  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2882  uracil-DNA glycosylase family 4 protein  40.74 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40 
 
 
186 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000159527  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1363  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.55 
 
 
341 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1940  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.58 
 
 
205 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000409376 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.74 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.934489  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1944  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.83 
 
 
345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3405  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.34 
 
 
300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.83 
 
 
367 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>