More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1058 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1058  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  100 
 
 
276 aa  545  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0266  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  63.24 
 
 
315 aa  236  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2028  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  60.99 
 
 
290 aa  226  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0443  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.24 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1228  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.12 
 
 
276 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3061  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.46 
 
 
255 aa  215  5e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.247484  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4359  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.92 
 
 
277 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0982104  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1083  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.35 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.761546 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0718  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.1 
 
 
290 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2345  putative DNA polymerase  57.54 
 
 
274 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.191175  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1210  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.07 
 
 
282 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal  0.843697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2373  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  56.52 
 
 
307 aa  208  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0074  uracil-DNA glycosylase  50.27 
 
 
261 aa  207  2e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3901  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.71 
 
 
300 aa  205  7e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.463834  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.89 
 
 
278 aa  204  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0440  uracil-DNA glycosylase  45.53 
 
 
275 aa  204  1e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5420  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.19 
 
 
300 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0164  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.39 
 
 
273 aa  202  5e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0044  DNA polymerase-related protein  47.21 
 
 
261 aa  202  5e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3219  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.96 
 
 
289 aa  202  6e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2596  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.03 
 
 
301 aa  201  9e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.213752 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3090  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.646333  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4616  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.7 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259396  normal  0.244304 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4766  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.7 
 
 
309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4246  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.7 
 
 
323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.558315  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4076  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.14 
 
 
295 aa  198  9e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0909  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.65 
 
 
285 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2659  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.24 
 
 
285 aa  192  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.845005  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2189  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.48 
 
 
286 aa  192  6e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0620  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.53 
 
 
290 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.316003  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0619  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.53 
 
 
290 aa  191  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0935  uracil-DNA glycosylase  49.73 
 
 
255 aa  190  2e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0936  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.87 
 
 
299 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269917  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0224  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.69 
 
 
259 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.215269  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2661  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.94 
 
 
260 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.642929  normal  0.357955 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1001  hypothetical protein  52.94 
 
 
260 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1085  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.52 
 
 
299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.735603  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0647  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.37 
 
 
289 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.268073 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0438  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.22 
 
 
271 aa  176  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1285  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.44 
 
 
274 aa  176  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.07 
 
 
210 aa  169  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5828  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.03 
 
 
209 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2166  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.56 
 
 
272 aa  169  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.832765  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0483  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.82 
 
 
195 aa  168  9e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000659964  normal  0.795166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2009  phage SpO1 DNA polymerase-related protein  45.85 
 
 
224 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331799  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3405  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.78 
 
 
300 aa  166  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1384  DNA polymerase  43.4 
 
 
302 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0442603  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1494  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.77 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.363091  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1589  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.77 
 
 
205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2543  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.12 
 
 
235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0670794  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2370  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.24 
 
 
245 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114234  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11480  Uracil-DNA glycosylase  44.71 
 
 
210 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353711  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1500  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.04 
 
 
255 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.43423  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1870  Uracil-DNA glycosylase-like protein  41.67 
 
 
233 aa  156  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00147256  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3960  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50 
 
 
191 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300932  hitchhiker  0.00000000403692 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0466  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43 
 
 
264 aa  156  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113584  hitchhiker  0.00887798 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2515  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.74 
 
 
231 aa  155  7e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.86 
 
 
186 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000159527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2925  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.16 
 
 
259 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0290  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.65 
 
 
207 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3067  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.62 
 
 
187 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000874061  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1363  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.88 
 
 
341 aa  152  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1937  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.31 
 
 
285 aa  152  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.090684  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.09 
 
 
209 aa  152  5e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1369  putative DNA polymerase-related protein, bacteriophage-type  46.73 
 
 
292 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.424674  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2671  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.52 
 
 
253 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.663672 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0303  putative DNA polymerase-related protein  43.72 
 
 
260 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440976  normal  0.0410762 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2152  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.78 
 
 
241 aa  148  8e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0689  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.37 
 
 
294 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614175  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1308  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.57 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0132537  normal  0.393253 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2121  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.3 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2003  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  45.23 
 
 
433 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.58 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0372  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.21 
 
 
294 aa  146  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000046016 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0893  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.08 
 
 
227 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148707 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.71 
 
 
205 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5015  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.67 
 
 
380 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.641312  normal  0.046521 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1397  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.82 
 
 
317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.60425 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6034  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.15 
 
 
346 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0371104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2043  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.15 
 
 
346 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.04 
 
 
249 aa  146  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.133247  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1940  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.09 
 
 
205 aa  145  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000409376 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2276  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.03 
 
 
243 aa  145  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0014  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.46 
 
 
263 aa  145  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1649  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.22 
 
 
209 aa  145  6e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00048269 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1242  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.98 
 
 
264 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.738609 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1580  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  43.33 
 
 
220 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0245048  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2463  uracil-DNA glycosylase  43.33 
 
 
455 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2519  uracil-DNA glycosylase  43.33 
 
 
455 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2082  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  40.89 
 
 
455 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.268517  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0259  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.08 
 
 
238 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382173  normal  0.0633983 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1912  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.49 
 
 
199 aa  145  9e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3230  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  40.89 
 
 
455 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1355  uracil-DNA glycosylase  40.89 
 
 
455 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00548958  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.66 
 
 
264 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2062  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.66 
 
 
342 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1944  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.81 
 
 
345 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2481  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.09 
 
 
414 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  hitchhiker  0.000867118 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3864  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.57 
 
 
327 aa  143  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0209903 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.81 
 
 
367 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>