More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1921 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1921  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  100 
 
 
210 aa  429  1e-119  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.21092 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1169  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  94.09 
 
 
206 aa  391  1e-108  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00763816 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0814  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  56.6 
 
 
231 aa  237  1e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0544  Uracil-DNA glycosylase superfamily  51.83 
 
 
219 aa  235  3e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0720  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.42 
 
 
217 aa  194  8.000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2949  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.45 
 
 
228 aa  178  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32190  uracil-DNA glycosylase  44.04 
 
 
235 aa  177  7e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.657779  normal  0.0875972 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11285  hypothetical protein  46.05 
 
 
299 aa  177  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3772  Uracil-DNA glycosylase superfamily  45.28 
 
 
226 aa  175  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.817518  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1651  Uracil-DNA glycosylase superfamily  45.85 
 
 
299 aa  174  6e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0366  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.74 
 
 
217 aa  174  8e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0682  Uracil-DNA glycosylase superfamily  44.89 
 
 
276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263882  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0440  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.69 
 
 
251 aa  172  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3689  Uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.18 
 
 
226 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2636  Uracil-DNA glycosylase superfamily  44.75 
 
 
221 aa  170  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5298  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.53 
 
 
240 aa  170  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1903  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.79 
 
 
312 aa  171  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3631  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.69 
 
 
226 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0899  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.27 
 
 
253 aa  169  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242395  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3919  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.75 
 
 
271 aa  169  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3128  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.25 
 
 
268 aa  169  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56795  hitchhiker  0.0037268 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3164  Uracil-DNA glycosylase superfamily  45.21 
 
 
221 aa  168  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.368387  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0842  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.08 
 
 
230 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558809  normal  0.314333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8576  uracil-DNA glycosylase superfamily  44.89 
 
 
266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.610367  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1040  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.61 
 
 
301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1564  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.55 
 
 
228 aa  165  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  hitchhiker  0.00784209 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5791  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.13 
 
 
233 aa  162  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5226  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.42 
 
 
244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18668  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0736  putative uracil-DNA glycosylase  40.83 
 
 
224 aa  161  8.000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1386  Uracil-DNA glycosylase superfamily  38.84 
 
 
236 aa  159  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0479897  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3233  Uracil-DNA glycosylase superfamily  45.98 
 
 
281 aa  159  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718462  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0811  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43 
 
 
262 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1079  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.61 
 
 
291 aa  159  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2236  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.41 
 
 
282 aa  157  9e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0925  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.42 
 
 
261 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394614  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0935  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.99 
 
 
284 aa  154  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29970  uracil-DNA glycosylase  40.81 
 
 
266 aa  154  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.50722 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3971  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.58 
 
 
273 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.649617  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3957  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.58 
 
 
273 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4031  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.58 
 
 
273 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1599  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.67 
 
 
212 aa  152  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0720375  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4459  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.91 
 
 
284 aa  151  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1028  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40.83 
 
 
294 aa  150  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250169  normal  0.0211091 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3755  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.88 
 
 
186 aa  148  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0169947  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1551  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.9 
 
 
220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1908  hypothetical protein  41.06 
 
 
218 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.443294  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1220  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.86 
 
 
232 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58979  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0703  hypothetical protein  40.2 
 
 
207 aa  139  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.109523 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1269  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.65 
 
 
238 aa  137  8.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0818  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.22 
 
 
215 aa  137  8.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0737592  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2864  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.05 
 
 
223 aa  136  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.48935  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1001  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40.29 
 
 
228 aa  135  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00625229 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2965  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.9 
 
 
224 aa  134  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0380  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40 
 
 
232 aa  134  9e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.172992  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1361  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.29 
 
 
214 aa  134  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2605  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.95 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0477634  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2258  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.41 
 
 
242 aa  132  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2632  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.21 
 
 
226 aa  128  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.122532  normal  0.188311 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2644  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.34 
 
 
225 aa  124  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0136839  hitchhiker  0.00783391 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1722  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.06 
 
 
225 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.598455  normal  0.212618 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0527  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.82 
 
 
211 aa  122  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0572467  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2448  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.56 
 
 
236 aa  122  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4690  putative uracil-DNA glycosylase  38.07 
 
 
229 aa  121  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  0.0692516 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2037  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.81 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.161308  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1925  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.72 
 
 
225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1860  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.62 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0361601  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0642  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  33.98 
 
 
223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3835  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.69 
 
 
233 aa  115  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0648  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.98 
 
 
223 aa  115  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0943  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  34.43 
 
 
220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0789384  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2639  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  31.55 
 
 
216 aa  109  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.990849  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0466  uracil DNA glycosylase family protein  32.34 
 
 
228 aa  106  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.276682  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1579  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  35.35 
 
 
220 aa  106  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.111562  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0248  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.57 
 
 
192 aa  93.2  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  0.366992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0318  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.26 
 
 
193 aa  90.9  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100378  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0718  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.78 
 
 
193 aa  87.8  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.809619 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1364  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.58 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6465  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.58 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.114604  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6057  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.11 
 
 
223 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  0.181537 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2305  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.58 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0147899 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0438  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.11 
 
 
189 aa  77  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1479  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.71 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2491  DNA polymerase domain-containing protein  29.95 
 
 
264 aa  75.5  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.25 
 
 
308 aa  75.1  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.934489  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2882  uracil-DNA glycosylase family 4 protein  29.25 
 
 
308 aa  75.1  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2605  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.93 
 
 
203 aa  74.7  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1656  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.39 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00964982 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4460  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.52 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2481  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.83 
 
 
414 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  hitchhiker  0.000867118 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1369  putative DNA polymerase-related protein, bacteriophage-type  31.28 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.424674  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1912  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.33 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.18 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693226  normal  0.500254 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5631  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.18 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609757  normal  0.0369434 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1056  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.91 
 
 
196 aa  72  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1948  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.5 
 
 
190 aa  72  0.000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.735506  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0119  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.24 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0157  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.44 
 
 
200 aa  72  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0205394  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2076  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.22 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2152  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.22 
 
 
241 aa  70.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1487  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.09 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>