More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0736 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0736  putative uracil-DNA glycosylase  100 
 
 
224 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1564  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  49.07 
 
 
228 aa  219  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  hitchhiker  0.00784209 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3164  Uracil-DNA glycosylase superfamily  46.54 
 
 
221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.368387  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5791  Uracil-DNA glycosylase superfamily  45.91 
 
 
233 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1001  Uracil-DNA glycosylase superfamily  48 
 
 
228 aa  187  9e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00625229 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2636  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.84 
 
 
221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1551  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.2 
 
 
220 aa  181  7e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0703  hypothetical protein  44.6 
 
 
207 aa  181  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.109523 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2258  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  48.31 
 
 
242 aa  179  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1599  Uracil-DNA glycosylase superfamily  45.89 
 
 
212 aa  178  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0720375  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1860  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.67 
 
 
214 aa  178  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0361601  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3689  Uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.83 
 
 
226 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2864  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.63 
 
 
223 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.48935  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3631  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.34 
 
 
226 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1908  hypothetical protein  46.63 
 
 
218 aa  175  6e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.443294  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3772  Uracil-DNA glycosylase superfamily  44.24 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.817518  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2448  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.58 
 
 
236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2632  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.15 
 
 
226 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.122532  normal  0.188311 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0366  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.63 
 
 
217 aa  170  1e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2949  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.18 
 
 
228 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1361  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.23 
 
 
214 aa  169  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2965  Uracil-DNA glycosylase superfamily  45.45 
 
 
224 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1925  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.41 
 
 
225 aa  167  8e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2236  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.72 
 
 
282 aa  167  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3835  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.78 
 
 
233 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2605  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.37 
 
 
200 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0477634  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0380  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.65 
 
 
232 aa  165  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.172992  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0899  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.84 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242395  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4459  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.98 
 
 
284 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2644  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.5 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0136839  hitchhiker  0.00783391 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0440  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.78 
 
 
251 aa  162  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1579  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.06 
 
 
220 aa  162  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.111562  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0943  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.86 
 
 
220 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0789384  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1651  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.44 
 
 
299 aa  161  9e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2037  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.45 
 
 
215 aa  160  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.161308  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1220  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.58 
 
 
232 aa  160  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58979  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1921  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.83 
 
 
210 aa  161  1e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.21092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0682  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.2 
 
 
276 aa  160  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263882  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3919  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.83 
 
 
271 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11285  hypothetical protein  39.81 
 
 
299 aa  159  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29970  uracil-DNA glycosylase  40.36 
 
 
266 aa  159  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.50722 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0544  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.44 
 
 
219 aa  159  4e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0842  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.55 
 
 
230 aa  158  8e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558809  normal  0.314333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4690  putative uracil-DNA glycosylase  42.51 
 
 
229 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  0.0692516 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0527  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45 
 
 
211 aa  157  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0572467  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2639  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.4 
 
 
216 aa  156  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.990849  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3755  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.28 
 
 
186 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0169947  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1269  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.27 
 
 
238 aa  156  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0935  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.59 
 
 
284 aa  156  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0925  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40 
 
 
261 aa  155  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394614  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0648  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.58 
 
 
223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5298  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.07 
 
 
240 aa  154  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1169  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.18 
 
 
206 aa  154  1e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00763816 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1903  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.55 
 
 
312 aa  154  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3971  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.74 
 
 
273 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.649617  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4031  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.74 
 
 
273 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0642  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.12 
 
 
223 aa  153  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3957  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.74 
 
 
273 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1079  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.67 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0720  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.47 
 
 
217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1040  Uracil-DNA glycosylase superfamily  38.74 
 
 
301 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32190  uracil-DNA glycosylase  40 
 
 
235 aa  149  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.657779  normal  0.0875972 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1028  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.13 
 
 
294 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250169  normal  0.0211091 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0811  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.71 
 
 
262 aa  148  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1722  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.18 
 
 
225 aa  147  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.598455  normal  0.212618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5226  Uracil-DNA glycosylase superfamily  38.6 
 
 
244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18668  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0466  uracil DNA glycosylase family protein  41.4 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.276682  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3128  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.22 
 
 
268 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56795  hitchhiker  0.0037268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8576  uracil-DNA glycosylase superfamily  37.33 
 
 
266 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.610367  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3233  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.47 
 
 
281 aa  143  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718462  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1386  Uracil-DNA glycosylase superfamily  38.12 
 
 
236 aa  143  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0479897  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0814  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.45 
 
 
231 aa  135  7.000000000000001e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0818  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.42 
 
 
215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0737592  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0318  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.02 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100378  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0248  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  34.21 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  0.366992 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.51 
 
 
304 aa  75.5  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_379  uracil DNA glycosylase superfamily, DNA polymerase bacteriophage-type  33.55 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0483  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.16 
 
 
195 aa  70.9  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000659964  normal  0.795166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3405  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.18 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11480  Uracil-DNA glycosylase  30.37 
 
 
210 aa  71.6  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353711  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0119  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.21 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1649  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.33 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00048269 
 
 
-
 
NC_002936  DET0437  uracil-DNA glycosylase, putative  36.44 
 
 
189 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0292507  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1992  hypothetical protein  32.74 
 
 
211 aa  68.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.770462  normal  0.123925 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2071  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.3 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2305  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.48 
 
 
192 aa  67.8  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0147899 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1393  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.75 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0426  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.66 
 
 
193 aa  67  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000629945  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0717  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.1 
 
 
195 aa  67  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.667137 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0411  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.66 
 
 
193 aa  67  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000323475  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1494  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.57 
 
 
295 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.363091  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0795  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.56 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1589  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.57 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.1 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.3735  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0157  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.57 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0205394  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1056  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.37 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2334  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.46 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1500  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.93 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.43423  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.75 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1180  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.67 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>