279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2636 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2636  Uracil-DNA glycosylase superfamily  100 
 
 
221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3164  Uracil-DNA glycosylase superfamily  68.78 
 
 
221 aa  314  6e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.368387  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3772  Uracil-DNA glycosylase superfamily  58.48 
 
 
226 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.817518  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0925  Uracil-DNA glycosylase superfamily  57.08 
 
 
261 aa  243  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394614  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1564  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  55.16 
 
 
228 aa  242  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  hitchhiker  0.00784209 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3631  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  58.69 
 
 
226 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2949  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  57.14 
 
 
228 aa  236  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5791  Uracil-DNA glycosylase superfamily  54.91 
 
 
233 aa  234  7e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1903  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  55.7 
 
 
312 aa  234  9e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3689  Uracil-DNA glycosylase superfamily protein  57.28 
 
 
226 aa  231  5e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5298  Uracil-DNA glycosylase superfamily  54.63 
 
 
240 aa  223  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32190  uracil-DNA glycosylase  53.95 
 
 
235 aa  219  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.657779  normal  0.0875972 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0899  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  55.91 
 
 
253 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242395  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0842  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  55.26 
 
 
230 aa  219  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558809  normal  0.314333 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1028  Uracil-DNA glycosylase superfamily  53.1 
 
 
294 aa  218  6e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250169  normal  0.0211091 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0682  Uracil-DNA glycosylase superfamily  53.07 
 
 
276 aa  218  7e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263882  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0440  Uracil-DNA glycosylase superfamily  52.17 
 
 
251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1079  Uracil-DNA glycosylase superfamily  52.42 
 
 
291 aa  208  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0935  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  51.32 
 
 
284 aa  207  8e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4459  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  50.44 
 
 
284 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1651  Uracil-DNA glycosylase superfamily  51.3 
 
 
299 aa  202  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11285  hypothetical protein  51.35 
 
 
299 aa  202  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1040  Uracil-DNA glycosylase superfamily  48.48 
 
 
301 aa  202  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5226  Uracil-DNA glycosylase superfamily  50 
 
 
244 aa  200  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18668  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0366  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.5 
 
 
217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3128  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  50.66 
 
 
268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56795  hitchhiker  0.0037268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2236  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.49 
 
 
282 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8576  uracil-DNA glycosylase superfamily  47.79 
 
 
266 aa  195  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.610367  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1361  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  50 
 
 
214 aa  194  8.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29970  uracil-DNA glycosylase  47.19 
 
 
266 aa  194  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.50722 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3233  Uracil-DNA glycosylase superfamily  55.5 
 
 
281 aa  194  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718462  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0703  hypothetical protein  51.47 
 
 
207 aa  193  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.109523 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3755  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  57.61 
 
 
186 aa  191  8e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0169947  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1386  Uracil-DNA glycosylase superfamily  46.49 
 
 
236 aa  189  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0479897  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1551  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.62 
 
 
220 aa  187  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0811  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  52.61 
 
 
262 aa  186  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3971  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  49.78 
 
 
273 aa  185  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.649617  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3957  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  49.78 
 
 
273 aa  185  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4031  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  49.78 
 
 
273 aa  185  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2864  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.83 
 
 
223 aa  184  8e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.48935  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0736  putative uracil-DNA glycosylase  43.84 
 
 
224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2258  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.34 
 
 
242 aa  181  7e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1599  Uracil-DNA glycosylase superfamily  50.48 
 
 
212 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0720375  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1269  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.58 
 
 
238 aa  178  7e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3919  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  48.43 
 
 
271 aa  177  8e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2644  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.83 
 
 
225 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0136839  hitchhiker  0.00783391 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2448  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.15 
 
 
236 aa  175  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1908  hypothetical protein  47.29 
 
 
218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.443294  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2632  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.59 
 
 
226 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.122532  normal  0.188311 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1001  Uracil-DNA glycosylase superfamily  44.19 
 
 
228 aa  170  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00625229 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1860  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.85 
 
 
214 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0361601  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1921  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.75 
 
 
210 aa  170  2e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.21092 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0527  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  48.26 
 
 
211 aa  169  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0572467  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2605  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.81 
 
 
200 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0477634  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0544  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.41 
 
 
219 aa  167  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2965  Uracil-DNA glycosylase superfamily  45.32 
 
 
224 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1220  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.54 
 
 
232 aa  166  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58979  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1169  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.34 
 
 
206 aa  166  4e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00763816 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0380  Uracil-DNA glycosylase superfamily  45.19 
 
 
232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.172992  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1722  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.9 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.598455  normal  0.212618 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0720  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.28 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4690  putative uracil-DNA glycosylase  47.06 
 
 
229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  0.0692516 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2037  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.6 
 
 
215 aa  160  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.161308  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1579  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.27 
 
 
220 aa  160  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.111562  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1925  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.12 
 
 
225 aa  159  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0814  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.23 
 
 
231 aa  158  5e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0818  Uracil-DNA glycosylase superfamily  46.92 
 
 
215 aa  158  8e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0737592  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3835  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.26 
 
 
233 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0648  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.55 
 
 
223 aa  154  8e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0642  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.55 
 
 
223 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2639  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.06 
 
 
216 aa  151  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.990849  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0943  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.86 
 
 
220 aa  148  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0789384  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0466  uracil DNA glycosylase family protein  39.81 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.276682  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0248  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.58 
 
 
192 aa  89  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  0.366992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0318  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36 
 
 
193 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100378  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0183  Uracil-DNA glycosylase superfamily  32.47 
 
 
210 aa  72  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.589955  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1649  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.3 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00048269 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01520  uracil-DNA glycosylase, family 4  32.42 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0226409 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1393  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.27 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0795  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.27 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.33 
 
 
264 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0718  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.13 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.809619 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2305  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.53 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0147899 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.52 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0119  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.27 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3154  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.68 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2152  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.72 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.19 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.3735  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2784  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.35 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0335572 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1447  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.84 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0438  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.9 
 
 
189 aa  63.2  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.95 
 
 
304 aa  62.4  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0717  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.55 
 
 
195 aa  62.4  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.667137 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2491  DNA polymerase domain-containing protein  29.72 
 
 
264 aa  62  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1556  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.84 
 
 
230 aa  62  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.199846  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2605  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.29 
 
 
203 aa  61.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0689  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.72 
 
 
294 aa  61.2  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614175  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1369  putative DNA polymerase-related protein, bacteriophage-type  31.87 
 
 
292 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.424674  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1948  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.77 
 
 
190 aa  60.1  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.735506  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3405  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.97 
 
 
300 aa  59.7  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>