232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0544 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0544  Uracil-DNA glycosylase superfamily  100 
 
 
219 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1921  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  51.83 
 
 
210 aa  235  4e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.21092 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1169  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  53.24 
 
 
206 aa  230  2e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00763816 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0440  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.89 
 
 
251 aa  190  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1651  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.23 
 
 
299 aa  189  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3772  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.21 
 
 
226 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.817518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3689  Uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.93 
 
 
226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32190  uracil-DNA glycosylase  44.91 
 
 
235 aa  179  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.657779  normal  0.0875972 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3631  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.47 
 
 
226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0682  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.56 
 
 
276 aa  178  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263882  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1564  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.31 
 
 
228 aa  178  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  hitchhiker  0.00784209 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5791  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.91 
 
 
233 aa  177  8e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5298  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.67 
 
 
240 aa  177  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1028  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40 
 
 
294 aa  176  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250169  normal  0.0211091 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29970  uracil-DNA glycosylase  39.04 
 
 
266 aa  176  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.50722 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3164  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40.97 
 
 
221 aa  176  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.368387  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1903  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.05 
 
 
312 aa  176  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0366  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.96 
 
 
217 aa  176  4e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0925  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.26 
 
 
261 aa  175  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394614  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1040  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.32 
 
 
301 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0720  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.91 
 
 
217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8576  uracil-DNA glycosylase superfamily  38.94 
 
 
266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.610367  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0814  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.84 
 
 
231 aa  171  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3128  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.1 
 
 
268 aa  170  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56795  hitchhiker  0.0037268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5226  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.2 
 
 
244 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18668  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0935  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.82 
 
 
284 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1079  Uracil-DNA glycosylase superfamily  38.16 
 
 
291 aa  169  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3919  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.18 
 
 
271 aa  168  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1386  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40.52 
 
 
236 aa  167  9e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0479897  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2636  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.41 
 
 
221 aa  167  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11285  hypothetical protein  41.28 
 
 
299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2236  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.35 
 
 
282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0899  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.34 
 
 
253 aa  164  9e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242395  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0842  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.99 
 
 
230 aa  161  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558809  normal  0.314333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4459  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.57 
 
 
284 aa  160  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0736  putative uracil-DNA glycosylase  39.44 
 
 
224 aa  159  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2949  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.09 
 
 
228 aa  158  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3233  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.28 
 
 
281 aa  157  9e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718462  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3755  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.01 
 
 
186 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0169947  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1551  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.79 
 
 
220 aa  152  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0811  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.79 
 
 
262 aa  151  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1599  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.07 
 
 
212 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0720375  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3957  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.81 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4031  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.81 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3971  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.81 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.649617  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1001  Uracil-DNA glycosylase superfamily  38.65 
 
 
228 aa  145  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00625229 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1908  hypothetical protein  40.1 
 
 
218 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.443294  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0818  Uracil-DNA glycosylase superfamily  37.8 
 
 
215 aa  141  7e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0737592  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1220  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.72 
 
 
232 aa  135  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58979  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1860  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.11 
 
 
214 aa  134  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0361601  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1361  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.49 
 
 
214 aa  134  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0703  hypothetical protein  38.35 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.109523 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2864  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.45 
 
 
223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.48935  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2448  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.59 
 
 
236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2258  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.11 
 
 
242 aa  132  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2965  Uracil-DNA glycosylase superfamily  36.67 
 
 
224 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3835  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  34.45 
 
 
233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2644  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.74 
 
 
225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0136839  hitchhiker  0.00783391 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0943  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.21 
 
 
220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0789384  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2605  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.88 
 
 
200 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0477634  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0380  Uracil-DNA glycosylase superfamily  35.71 
 
 
232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.172992  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2632  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.32 
 
 
226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.122532  normal  0.188311 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1722  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.02 
 
 
225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.598455  normal  0.212618 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0527  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.87 
 
 
211 aa  124  9e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0572467  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2037  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.67 
 
 
215 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.161308  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4690  putative uracil-DNA glycosylase  35.12 
 
 
229 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  0.0692516 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1925  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.32 
 
 
225 aa  123  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2639  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  35.65 
 
 
216 aa  123  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.990849  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1269  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  35.24 
 
 
238 aa  122  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1579  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.14 
 
 
220 aa  123  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.111562  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0642  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  34.88 
 
 
223 aa  118  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0648  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.88 
 
 
223 aa  118  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0466  uracil DNA glycosylase family protein  36.74 
 
 
228 aa  114  7.999999999999999e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.276682  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0183  Uracil-DNA glycosylase superfamily  27.16 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.589955  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0718  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.09 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.809619 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.84 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.133247  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2639  Uracil-DNA glycosylase superfamily  25.93 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0248  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  27.61 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  0.366992 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1363  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.57 
 
 
341 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0318  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  28.05 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100378  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0119  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.84 
 
 
191 aa  64.3  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1447  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.36 
 
 
200 aa  64.3  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2305  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.73 
 
 
192 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0147899 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0372  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.68 
 
 
294 aa  63.2  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000046016 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3154  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.56 
 
 
201 aa  63.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2076  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.02 
 
 
194 aa  62.8  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0303  putative DNA polymerase-related protein  29.3 
 
 
260 aa  62.4  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440976  normal  0.0410762 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.66 
 
 
204 aa  62.4  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.3735  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.84 
 
 
330 aa  62  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1369  putative DNA polymerase-related protein, bacteriophage-type  27.08 
 
 
292 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.424674  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2481  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.49 
 
 
414 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  hitchhiker  0.000867118 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0091  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.82 
 
 
216 aa  60.1  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1656  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.49 
 
 
401 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00964982 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1056  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.79 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1578  Uracil-DNA glycosylase-like protein  28.17 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0270  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.63 
 
 
249 aa  59.7  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0157  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.45 
 
 
200 aa  59.3  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0205394  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1234  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  26.7 
 
 
358 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532559  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1948  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.3 
 
 
190 aa  59.3  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.735506  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5352  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.68 
 
 
336 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.142834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>