296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1564 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1564  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  100 
 
 
228 aa  472  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  hitchhiker  0.00784209 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3772  Uracil-DNA glycosylase superfamily  55.51 
 
 
226 aa  268  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.817518  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3164  Uracil-DNA glycosylase superfamily  56.31 
 
 
221 aa  267  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.368387  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3631  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  56.94 
 
 
226 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3689  Uracil-DNA glycosylase superfamily protein  56.94 
 
 
226 aa  264  7e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2636  Uracil-DNA glycosylase superfamily  55.16 
 
 
221 aa  242  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5791  Uracil-DNA glycosylase superfamily  52.21 
 
 
233 aa  236  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2949  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  53.12 
 
 
228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5298  Uracil-DNA glycosylase superfamily  52.47 
 
 
240 aa  232  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4459  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  49.12 
 
 
284 aa  229  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29970  uracil-DNA glycosylase  50.43 
 
 
266 aa  227  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.50722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8576  uracil-DNA glycosylase superfamily  51.89 
 
 
266 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.610367  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2236  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  49.12 
 
 
282 aa  225  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0925  Uracil-DNA glycosylase superfamily  48.44 
 
 
261 aa  225  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394614  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1040  Uracil-DNA glycosylase superfamily  47.73 
 
 
301 aa  224  9e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0842  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  50.22 
 
 
230 aa  223  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558809  normal  0.314333 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0736  putative uracil-DNA glycosylase  49.07 
 
 
224 aa  219  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1079  Uracil-DNA glycosylase superfamily  50.93 
 
 
291 aa  214  5.9999999999999996e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0899  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  50.93 
 
 
253 aa  214  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242395  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3128  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.93 
 
 
268 aa  214  7e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56795  hitchhiker  0.0037268 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0440  Uracil-DNA glycosylase superfamily  48.02 
 
 
251 aa  214  8e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32190  uracil-DNA glycosylase  48.23 
 
 
235 aa  213  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.657779  normal  0.0875972 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1651  Uracil-DNA glycosylase superfamily  48.46 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4031  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  50.89 
 
 
273 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3957  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  50.89 
 
 
273 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3971  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  50.89 
 
 
273 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.649617  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0682  Uracil-DNA glycosylase superfamily  48.21 
 
 
276 aa  211  7e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263882  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11285  hypothetical protein  48.64 
 
 
299 aa  210  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3755  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  57.54 
 
 
186 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0169947  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5226  Uracil-DNA glycosylase superfamily  46.49 
 
 
244 aa  207  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18668  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1903  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.02 
 
 
312 aa  207  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0366  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.79 
 
 
217 aa  203  1e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0935  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.37 
 
 
284 aa  202  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1028  Uracil-DNA glycosylase superfamily  45.45 
 
 
294 aa  201  7e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250169  normal  0.0211091 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3919  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.34 
 
 
271 aa  197  9e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3233  Uracil-DNA glycosylase superfamily  48.64 
 
 
281 aa  194  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718462  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1361  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.01 
 
 
214 aa  188  5.999999999999999e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0703  hypothetical protein  47.32 
 
 
207 aa  184  8e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.109523 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1386  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.3 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0479897  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0720  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.79 
 
 
217 aa  182  3e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0811  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.67 
 
 
262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  0.338684 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0544  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.31 
 
 
219 aa  178  4.999999999999999e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1551  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.15 
 
 
220 aa  177  9e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2258  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.34 
 
 
242 aa  176  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1001  Uracil-DNA glycosylase superfamily  47.17 
 
 
228 aa  175  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00625229 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1599  Uracil-DNA glycosylase superfamily  46.38 
 
 
212 aa  174  9e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0720375  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1925  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.85 
 
 
225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1579  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.23 
 
 
220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.111562  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1908  hypothetical protein  45.89 
 
 
218 aa  172  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.443294  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2864  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.96 
 
 
223 aa  170  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.48935  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2448  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.69 
 
 
236 aa  168  6e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0527  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.08 
 
 
211 aa  167  8e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0572467  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3835  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.5 
 
 
233 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2965  Uracil-DNA glycosylase superfamily  46.38 
 
 
224 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1921  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.55 
 
 
210 aa  165  5e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.21092 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1269  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.01 
 
 
238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4690  putative uracil-DNA glycosylase  46.86 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  0.0692516 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2605  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.41 
 
 
200 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0477634  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2037  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.38 
 
 
215 aa  161  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.161308  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2632  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.93 
 
 
226 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.122532  normal  0.188311 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2644  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43 
 
 
225 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0136839  hitchhiker  0.00783391 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0818  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.47 
 
 
215 aa  160  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0737592  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1169  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40 
 
 
206 aa  157  9e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00763816 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1220  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.98 
 
 
232 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58979  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0380  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.06 
 
 
232 aa  154  8e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.172992  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1860  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.9 
 
 
214 aa  152  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0361601  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1722  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.31 
 
 
225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.598455  normal  0.212618 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0814  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.45 
 
 
231 aa  146  3e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0943  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.66 
 
 
220 aa  141  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0789384  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2639  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.05 
 
 
216 aa  136  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.990849  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0648  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.91 
 
 
223 aa  135  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0642  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.91 
 
 
223 aa  135  7.000000000000001e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0466  uracil DNA glycosylase family protein  38.03 
 
 
228 aa  132  6e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.276682  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0248  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  35.12 
 
 
192 aa  88.6  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  0.366992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0318  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.24 
 
 
193 aa  85.5  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100378  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3154  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.48 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.41 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.3735  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2515  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.25 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0183  Uracil-DNA glycosylase superfamily  32.65 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.589955  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0717  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.16 
 
 
195 aa  74.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.667137 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1447  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.19 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1656  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.1 
 
 
401 aa  72  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00964982 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2481  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.59 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  hitchhiker  0.000867118 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1649  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.14 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00048269 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2009  phage SpO1 DNA polymerase-related protein  31.86 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331799  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1912  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.5 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1768  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.48 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0119  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.12 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1369  putative DNA polymerase-related protein, bacteriophage-type  29.08 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.424674  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.59 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0795  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.71 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_379  uracil DNA glycosylase superfamily, DNA polymerase bacteriophage-type  29.38 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2605  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.12 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2449  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.17 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0437  uracil-DNA glycosylase, putative  34.17 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0292507  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2491  DNA polymerase domain-containing protein  31.25 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6034  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.56 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0371104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2043  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.56 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2062  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.56 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.94 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.133247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>