58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1193 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1193  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  634    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1113  hypothetical protein  99.37 
 
 		 317 aa  632  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1446  hypothetical protein  68.79 
 
 		 330 aa  350  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2293  hypothetical protein  54.55 
 
 		 320 aa  308  9e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5865  hypothetical protein  62.73 
 
 		 321 aa  285  5.999999999999999e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1169  hypothetical protein  55.17 
 
 		 150 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.200883 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5437  hypothetical protein  54.11 
 
 		 150 aa  165  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0570  hypothetical protein  52.2 
 
 		 161 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1353  hypothetical protein  52.78 
 
 		 148 aa  161  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1577  hypothetical protein  50 
 
 		 153 aa  150  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0797  hypothetical protein  48.05 
 
 		 179 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1304  hypothetical protein  46.71 
 
 		 156 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.448465  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0820  hypothetical protein  47.4 
 
 		 158 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.169744 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1124  hypothetical protein  48.03 
 
 		 156 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221098  normal  0.514803 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4396  hypothetical protein  47.4 
 
 		 158 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.479325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0831  hypothetical protein  46.75 
 
 		 158 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36530  hypothetical protein  48.94 
 
 		 150 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00120253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3135  hypothetical protein  48.23 
 
 		 150 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2262  hypothetical protein  44.97 
 
 		 154 aa  139  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal  0.0310926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4357  hypothetical protein  48.34 
 
 		 155 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5302  hypothetical protein  45.14 
 
 		 150 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163208  normal  0.0551746 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1001  hypothetical protein  41.96 
 
 		 154 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026081 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1593  hypothetical protein  42.28 
 
 		 148 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2163  hypothetical protein  35.51 
 
 		 150 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.096246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07210  hypothetical protein  37.76 
 
 		 158 aa  103  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1331  hypothetical protein  52.03 
 
 		 225 aa  98.2  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0559942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0760  Protein of unknown function DUF2383  37.21 
 
 		 151 aa  97.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.462088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04630  hypothetical protein  31.65 
 
 		 166 aa  94.4  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3187  hypothetical protein  32.24 
 
 		 155 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455411  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0169  hypothetical protein  34.75 
 
 		 150 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1042  hypothetical protein  50 
 
 		 225 aa  89.4  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0558467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0040  hypothetical protein  48.81 
 
 		 162 aa  86.7  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000158895 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2659  hypothetical protein  32.21 
 
 		 153 aa  85.1  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.295349  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1205  hypothetical protein  34.27 
 
 		 150 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512169 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2621  hypothetical protein  36.57 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.652955 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3966  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  32.17 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  0.194961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0359  hypothetical protein  33.8 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401814  normal  0.430905 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1746  hypothetical protein  32.37 
 
 		 151 aa  81.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0811  17 kDa surface antigen  47.62 
 
 		 456 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4998  hypothetical protein  29.27 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00225  hypothetical protein  29.2 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1122  hypothetical protein  29.8 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234261  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0627  hypothetical protein  29.86 
 
 		 153 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2897  hypothetical protein  33.09 
 
 		 152 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0169773 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1839  hypothetical protein  30.94 
 
 		 150 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.756028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3555  hypothetical protein  31.91 
 
 		 150 aa  62  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6235  Protein of unknown function DUF2383  25 
 
 		 151 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0178  hypothetical protein  29.29 
 
 		 144 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0335  hypothetical protein  38.46 
 
 		 109 aa  57  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.805533 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04113  hypothetical protein  43.84 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2261  hypothetical protein  27.86 
 
 		 156 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0881857  normal  0.0318922 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6198  hypothetical protein  30.37 
 
 		 148 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.697848  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3419  hypothetical protein  30.37 
 
 		 148 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2525  hypothetical protein  31.58 
 
 		 187 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4091  hypothetical protein  21.68 
 
 		 147 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0401  17 kDa surface antigen  32.08 
 
 		 385 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.693676 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4145  hypothetical protein  37.04 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000490948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3148  hypothetical protein  27.94 
 
 		 148 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.486705 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>