13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3148 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3148  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  296  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.486705 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6198  hypothetical protein  77.24 
 
 		 148 aa  236  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.697848  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3419  hypothetical protein  77.24 
 
 		 148 aa  236  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1260  hypothetical protein  55.03 
 
 		 153 aa  155  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2920  hypothetical protein  55.03 
 
 		 153 aa  155  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.869525 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2698  hypothetical protein  57.97 
 
 		 152 aa  153  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1244  hypothetical protein  33.58 
 
 		 152 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0835823  unclonable  0.0000000177159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1687  hypothetical protein  34.72 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4024  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3778  hypothetical protein  32.28 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119444  normal  0.0564298 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3562  hypothetical protein  29.31 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1113  hypothetical protein  27.56 
 
 		 317 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1193  hypothetical protein  27.56 
 
 		 317 aa  41.6  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>