16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_6198 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_6198  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  296  6e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.697848  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3419  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  296  6e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939671  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3148  hypothetical protein  77.24 
 
 
148 aa  236  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.486705 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1260  hypothetical protein  53.42 
 
 
153 aa  155  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2920  hypothetical protein  53.42 
 
 
153 aa  155  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.869525 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2698  hypothetical protein  53.19 
 
 
152 aa  150  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1687  hypothetical protein  34.27 
 
 
149 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3778  hypothetical protein  34.06 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119444  normal  0.0564298 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4024  hypothetical protein  31.47 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1244  hypothetical protein  28.79 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0835823  unclonable  0.0000000177159 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3562  hypothetical protein  28.32 
 
 
147 aa  60.5  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558443  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1113  hypothetical protein  30.83 
 
 
317 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1193  hypothetical protein  30.83 
 
 
317 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2293  hypothetical protein  28.7 
 
 
320 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5865  hypothetical protein  27.97 
 
 
321 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1205  hypothetical protein  28.57 
 
 
150 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.512169 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>