18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2920 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1260  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  307  4e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2920  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  307  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.869525 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2698  hypothetical protein  84.31 
 
 
152 aa  257  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3419  hypothetical protein  53.42 
 
 
148 aa  155  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939671  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3148  hypothetical protein  55.03 
 
 
148 aa  155  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.486705 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6198  hypothetical protein  53.42 
 
 
148 aa  155  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.697848  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1687  hypothetical protein  35.92 
 
 
149 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1244  hypothetical protein  35.16 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0835823  unclonable  0.0000000177159 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3778  hypothetical protein  37.96 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119444  normal  0.0564298 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4024  hypothetical protein  34.07 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3562  hypothetical protein  29.73 
 
 
147 aa  61.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558443  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1577  hypothetical protein  30.14 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2262  hypothetical protein  33.8 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal  0.0310926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0797  hypothetical protein  31.67 
 
 
179 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0831  hypothetical protein  31.67 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521275  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4396  hypothetical protein  31.67 
 
 
158 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.479325  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4126  hypothetical protein  28.97 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0820  hypothetical protein  31.67 
 
 
158 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.169744 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>