48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0627 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0627  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  316  6e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3187  hypothetical protein  49.34 
 
 		 155 aa  158  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455411  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3966  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  46.05 
 
 		 151 aa  133  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  0.194961 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2659  hypothetical protein  44.3 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.295349  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0359  hypothetical protein  38.71 
 
 		 154 aa  113  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401814  normal  0.430905 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1122  hypothetical protein  37.58 
 
 		 160 aa  110  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234261  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2897  hypothetical protein  34.72 
 
 		 152 aa  90.5  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0169773 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6235  Protein of unknown function DUF2383  38.21 
 
 		 151 aa  87  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1577  hypothetical protein  31.25 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1839  hypothetical protein  31.69 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.756028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5437  hypothetical protein  31.91 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1001  hypothetical protein  28.47 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026081 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2293  hypothetical protein  30.61 
 
 		 320 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1169  hypothetical protein  30.5 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.200883 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36530  hypothetical protein  28.37 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00120253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3135  hypothetical protein  28.37 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2262  hypothetical protein  30.14 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal  0.0310926 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1353  hypothetical protein  25 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07210  hypothetical protein  26.21 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5865  hypothetical protein  31.01 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1113  hypothetical protein  30.56 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2621  hypothetical protein  32.48 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.652955 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0760  Protein of unknown function DUF2383  27.01 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.462088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0570  hypothetical protein  29.37 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04630  hypothetical protein  26.39 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00225  hypothetical protein  26.24 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1193  hypothetical protein  29.86 
 
 		 317 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1593  hypothetical protein  29.31 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0831  hypothetical protein  25.83 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4357  hypothetical protein  26.03 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1124  hypothetical protein  24.49 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221098  normal  0.514803 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0797  hypothetical protein  26.92 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0820  hypothetical protein  26.92 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.169744 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4396  hypothetical protein  24.16 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.479325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5302  hypothetical protein  24.11 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163208  normal  0.0551746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1446  hypothetical protein  30.23 
 
 		 330 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1746  hypothetical protein  31.48 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1304  hypothetical protein  23.48 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.448465  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2163  hypothetical protein  20 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.096246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3778  hypothetical protein  28.12 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119444  normal  0.0564298 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0169  hypothetical protein  24.55 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4024  hypothetical protein  26.77 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0178  hypothetical protein  25.74 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1205  hypothetical protein  25 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512169 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1244  hypothetical protein  25.38 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0835823  unclonable  0.0000000177159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1687  hypothetical protein  26.55 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01766  hypothetical protein  25.44 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.756616  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3555  hypothetical protein  27.59 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>