44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2163 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2163  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  305  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.096246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0169  hypothetical protein  54.67 
 
 		 150 aa  181  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3135  hypothetical protein  40.28 
 
 		 150 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36530  hypothetical protein  39.58 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00120253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5437  hypothetical protein  38.41 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1169  hypothetical protein  38.41 
 
 		 150 aa  121  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.200883 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2293  hypothetical protein  42.07 
 
 		 320 aa  121  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2262  hypothetical protein  35.86 
 
 		 154 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal  0.0310926 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5302  hypothetical protein  38.41 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163208  normal  0.0551746 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1577  hypothetical protein  37.76 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0570  hypothetical protein  36.11 
 
 		 161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1113  hypothetical protein  35.66 
 
 		 317 aa  102  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1193  hypothetical protein  35.66 
 
 		 317 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1353  hypothetical protein  35.86 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1124  hypothetical protein  30.87 
 
 		 156 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221098  normal  0.514803 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1001  hypothetical protein  35.62 
 
 		 154 aa  97.1  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026081 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1304  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.448465  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5865  hypothetical protein  34.13 
 
 		 321 aa  92.8  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0797  hypothetical protein  31.79 
 
 		 179 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0820  hypothetical protein  31.79 
 
 		 158 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.169744 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4396  hypothetical protein  31.13 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.479325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1446  hypothetical protein  38.1 
 
 		 330 aa  88.2  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0831  hypothetical protein  31.13 
 
 		 158 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4357  hypothetical protein  32.21 
 
 		 155 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07210  hypothetical protein  27.89 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3187  hypothetical protein  31.85 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455411  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1122  hypothetical protein  36.61 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234261  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2897  hypothetical protein  32.12 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0169773 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1593  hypothetical protein  29.46 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0359  hypothetical protein  31.47 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401814  normal  0.430905 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1205  hypothetical protein  26.47 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512169 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2659  hypothetical protein  28.26 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.295349  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1839  hypothetical protein  32.11 
 
 		 150 aa  60.1  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.756028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0760  Protein of unknown function DUF2383  27.27 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.462088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3966  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  32.18 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  0.194961 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04630  hypothetical protein  24.8 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1746  hypothetical protein  26.36 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6235  Protein of unknown function DUF2383  31.82 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0627  hypothetical protein  20 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2261  hypothetical protein  23.97 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0881857  normal  0.0318922 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00225  hypothetical protein  23.64 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0112  hypothetical protein  26.03 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0749559 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3555  hypothetical protein  25.68 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0131  hypothetical protein  25.34 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>