49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5302 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5302  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  301  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163208  normal  0.0551746 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5437  hypothetical protein  66.44 
 
 		 150 aa  216  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1169  hypothetical protein  64.43 
 
 		 150 aa  209  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.200883 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36530  hypothetical protein  50 
 
 		 150 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00120253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3135  hypothetical protein  48.57 
 
 		 150 aa  147  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1353  hypothetical protein  51.43 
 
 		 148 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2262  hypothetical protein  46.04 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal  0.0310926 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2293  hypothetical protein  44.52 
 
 		 320 aa  136  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0570  hypothetical protein  43.26 
 
 		 161 aa  134  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1124  hypothetical protein  45.45 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221098  normal  0.514803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1113  hypothetical protein  46.21 
 
 		 317 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1193  hypothetical protein  46.21 
 
 		 317 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5865  hypothetical protein  45.04 
 
 		 321 aa  124  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1577  hypothetical protein  40.29 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4357  hypothetical protein  42.86 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1001  hypothetical protein  43.88 
 
 		 154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026081 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0831  hypothetical protein  40.41 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1446  hypothetical protein  47.37 
 
 		 330 aa  114  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4396  hypothetical protein  38.26 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.479325  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2163  hypothetical protein  38.41 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.096246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0820  hypothetical protein  39.73 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.169744 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0797  hypothetical protein  39.73 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1304  hypothetical protein  40.97 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.448465  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0169  hypothetical protein  38.85 
 
 		 150 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1593  hypothetical protein  38.57 
 
 		 148 aa  95.1  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3187  hypothetical protein  32 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455411  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3966  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  38.03 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  0.194961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1122  hypothetical protein  35.57 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234261  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2659  hypothetical protein  33.8 
 
 		 153 aa  83.6  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.295349  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2897  hypothetical protein  34.25 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0169773 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0359  hypothetical protein  35.57 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401814  normal  0.430905 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0760  Protein of unknown function DUF2383  30.58 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.462088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1205  hypothetical protein  31.16 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512169 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1746  hypothetical protein  33.09 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1839  hypothetical protein  30.87 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.756028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07210  hypothetical protein  27.66 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0627  hypothetical protein  24.11 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04630  hypothetical protein  28.81 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2621  hypothetical protein  32.48 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.652955 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6235  Protein of unknown function DUF2383  25.98 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00225  hypothetical protein  21.58 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0178  hypothetical protein  30.88 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3555  hypothetical protein  30.77 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4091  hypothetical protein  25 
 
 		 147 aa  50.8  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0271  hypothetical protein  26.67 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000678514 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01766  hypothetical protein  32.87 
 
 		 151 aa  47.4  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.756616  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2261  hypothetical protein  22.63 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0881857  normal  0.0318922 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0112  hypothetical protein  26.98 
 
 		 145 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0749559 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0131  hypothetical protein  26.19 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>