46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1122 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1122  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  328  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234261  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0359  hypothetical protein  60.67 
 
 		 154 aa  191  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401814  normal  0.430905 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3187  hypothetical protein  50.32 
 
 		 155 aa  163  9e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455411  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3966  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  52.03 
 
 		 151 aa  154  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  0.194961 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2659  hypothetical protein  48.99 
 
 		 153 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.295349  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2897  hypothetical protein  43.36 
 
 		 152 aa  117  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0169773 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0627  hypothetical protein  37.58 
 
 		 153 aa  110  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1839  hypothetical protein  38.1 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.756028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1169  hypothetical protein  36.91 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.200883 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1124  hypothetical protein  37.01 
 
 		 156 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221098  normal  0.514803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6235  Protein of unknown function DUF2383  36.62 
 
 		 151 aa  97.4  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5437  hypothetical protein  36.24 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1577  hypothetical protein  37.84 
 
 		 153 aa  95.1  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4357  hypothetical protein  35.33 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1304  hypothetical protein  36.36 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.448465  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1001  hypothetical protein  35.17 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0760  Protein of unknown function DUF2383  34.53 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.462088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2262  hypothetical protein  33.56 
 
 		 154 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal  0.0310926 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5302  hypothetical protein  35.57 
 
 		 150 aa  85.5  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163208  normal  0.0551746 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2293  hypothetical protein  34.69 
 
 		 320 aa  84  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3135  hypothetical protein  34.72 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36530  hypothetical protein  32.87 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00120253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1353  hypothetical protein  35.37 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0831  hypothetical protein  34.84 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5865  hypothetical protein  35.9 
 
 		 321 aa  80.9  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0570  hypothetical protein  31.17 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0797  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4396  hypothetical protein  32.03 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.479325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0820  hypothetical protein  32.68 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.169744 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04630  hypothetical protein  30.37 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1446  hypothetical protein  41.38 
 
 		 330 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1113  hypothetical protein  30.77 
 
 		 317 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1193  hypothetical protein  30.77 
 
 		 317 aa  70.5  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2163  hypothetical protein  36.61 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.096246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0178  hypothetical protein  32.59 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07210  hypothetical protein  28.17 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1593  hypothetical protein  28.38 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1205  hypothetical protein  28.87 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512169 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0169  hypothetical protein  28.77 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2621  hypothetical protein  32.65 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.652955 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1746  hypothetical protein  28.37 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3555  hypothetical protein  32.12 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01766  hypothetical protein  29.25 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.756616  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00225  hypothetical protein  24.09 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1871  Ferritin Dps family protein  26.67 
 
 		 148 aa  41.6  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2261  hypothetical protein  29.69 
 
 		 156 aa  40.8  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0881857  normal  0.0318922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>