46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3135 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3135  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  304  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36530  hypothetical protein  98 
 
 		 150 aa  298  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00120253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2262  hypothetical protein  63.5 
 
 		 154 aa  191  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal  0.0310926 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1169  hypothetical protein  55.94 
 
 		 150 aa  164  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.200883 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5437  hypothetical protein  55.24 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0820  hypothetical protein  54.42 
 
 		 158 aa  156  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.169744 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0797  hypothetical protein  54.42 
 
 		 179 aa  156  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0831  hypothetical protein  53.74 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4396  hypothetical protein  53.06 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.479325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4357  hypothetical protein  55.1 
 
 		 155 aa  153  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5302  hypothetical protein  48.57 
 
 		 150 aa  147  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163208  normal  0.0551746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1124  hypothetical protein  50.34 
 
 		 156 aa  147  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221098  normal  0.514803 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1304  hypothetical protein  50.68 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.448465  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2293  hypothetical protein  43.66 
 
 		 320 aa  136  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0570  hypothetical protein  44.08 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1353  hypothetical protein  45.71 
 
 		 148 aa  134  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1577  hypothetical protein  44.6 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1113  hypothetical protein  46.92 
 
 		 317 aa  128  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1193  hypothetical protein  46.92 
 
 		 317 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2163  hypothetical protein  40.28 
 
 		 150 aa  126  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.096246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5865  hypothetical protein  46.92 
 
 		 321 aa  126  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1446  hypothetical protein  47.69 
 
 		 330 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1001  hypothetical protein  39.16 
 
 		 154 aa  106  9.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2897  hypothetical protein  40.56 
 
 		 152 aa  100  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0169773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0169  hypothetical protein  34.78 
 
 		 150 aa  100  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1593  hypothetical protein  38.3 
 
 		 148 aa  97.1  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3966  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  37.41 
 
 		 151 aa  95.5  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  0.194961 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2659  hypothetical protein  36 
 
 		 153 aa  95.5  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.295349  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1839  hypothetical protein  37.41 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.756028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0760  Protein of unknown function DUF2383  37.98 
 
 		 151 aa  90.5  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.462088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07210  hypothetical protein  35.42 
 
 		 158 aa  90.1  9e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3187  hypothetical protein  31.54 
 
 		 155 aa  83.6  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455411  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1122  hypothetical protein  34.72 
 
 		 160 aa  83.6  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234261  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04630  hypothetical protein  33.06 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1205  hypothetical protein  31.29 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512169 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1746  hypothetical protein  32.82 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0627  hypothetical protein  28.37 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6235  Protein of unknown function DUF2383  30.14 
 
 		 151 aa  70.1  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0359  hypothetical protein  31.03 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401814  normal  0.430905 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2621  hypothetical protein  28.35 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.652955 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2261  hypothetical protein  26.95 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0881857  normal  0.0318922 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0112  hypothetical protein  29.29 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0749559 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00225  hypothetical protein  25 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0131  hypothetical protein  27.86 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0178  hypothetical protein  23.13 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0271  hypothetical protein  22.54 
 
 		 175 aa  43.5  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000678514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>