26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2261 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2261  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0881857  normal  0.0318922 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1124  hypothetical protein  29.57 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221098  normal  0.514803 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1001  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026081 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2262  hypothetical protein  25.74 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal  0.0310926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3135  hypothetical protein  26.95 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36530  hypothetical protein  26.95 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00120253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1353  hypothetical protein  36.56 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1193  hypothetical protein  28.8 
 
 		 317 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4396  hypothetical protein  31.43 
 
 		 158 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.479325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5865  hypothetical protein  27.1 
 
 		 321 aa  50.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1113  hypothetical protein  28.8 
 
 		 317 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1169  hypothetical protein  24.09 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.200883 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0169  hypothetical protein  25 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0831  hypothetical protein  31.07 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5437  hypothetical protein  23.36 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0820  hypothetical protein  31.07 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.169744 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0797  hypothetical protein  31.07 
 
 		 179 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2293  hypothetical protein  24.46 
 
 		 320 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1304  hypothetical protein  23.65 
 
 		 156 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.448465  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2163  hypothetical protein  23.97 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.096246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0570  hypothetical protein  26.32 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0760  Protein of unknown function DUF2383  26.27 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.462088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5302  hypothetical protein  22.63 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163208  normal  0.0551746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4357  hypothetical protein  30 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1446  hypothetical protein  32.5 
 
 		 330 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1122  hypothetical protein  29.69 
 
 		 160 aa  40.8  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234261  normal  0.599602 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>