53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1446 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1446  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  657    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1193  hypothetical protein  72.64 
 
 
317 aa  374  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1113  hypothetical protein  72.95 
 
 
317 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2293  hypothetical protein  57.45 
 
 
320 aa  319  3.9999999999999996e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5865  hypothetical protein  66.36 
 
 
321 aa  306  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0570  hypothetical protein  55.48 
 
 
161 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1169  hypothetical protein  55.17 
 
 
150 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.200883 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5437  hypothetical protein  54.11 
 
 
150 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1353  hypothetical protein  52.78 
 
 
148 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0831  hypothetical protein  48.68 
 
 
158 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521275  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36530  hypothetical protein  50.35 
 
 
150 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00120253  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0797  hypothetical protein  50 
 
 
179 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0820  hypothetical protein  50 
 
 
158 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.169744 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3135  hypothetical protein  49.65 
 
 
150 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1577  hypothetical protein  47.92 
 
 
153 aa  145  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4396  hypothetical protein  47.97 
 
 
158 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.479325  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2262  hypothetical protein  46.15 
 
 
154 aa  142  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal  0.0310926 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1124  hypothetical protein  46.36 
 
 
156 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221098  normal  0.514803 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5302  hypothetical protein  46.53 
 
 
150 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163208  normal  0.0551746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1304  hypothetical protein  42.38 
 
 
156 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.448465  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1001  hypothetical protein  44.06 
 
 
154 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026081 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4357  hypothetical protein  46 
 
 
155 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1593  hypothetical protein  46.31 
 
 
148 aa  123  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2163  hypothetical protein  37.59 
 
 
150 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.096246  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07210  hypothetical protein  37.06 
 
 
158 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1331  hypothetical protein  52.03 
 
 
225 aa  98.2  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0559942  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0760  Protein of unknown function DUF2383  36.72 
 
 
151 aa  97.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.462088  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3187  hypothetical protein  34.44 
 
 
155 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455411  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0169  hypothetical protein  37.76 
 
 
150 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1042  hypothetical protein  51.7 
 
 
225 aa  90.5  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0558467  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2659  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  90.1  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.295349  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1746  hypothetical protein  35.29 
 
 
151 aa  87  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1122  hypothetical protein  33.11 
 
 
160 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234261  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04630  hypothetical protein  30.82 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00225  hypothetical protein  29.73 
 
 
150 aa  82  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2621  hypothetical protein  36.09 
 
 
151 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.652955 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4998  hypothetical protein  30.29 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3966  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  33.56 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  0.194961 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2897  hypothetical protein  35.21 
 
 
152 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0169773 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1205  hypothetical protein  30.82 
 
 
150 aa  77  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.512169 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0811  17 kDa surface antigen  43.84 
 
 
456 aa  76.6  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0627  hypothetical protein  29.86 
 
 
153 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0359  hypothetical protein  32.39 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401814  normal  0.430905 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0040  hypothetical protein  44.36 
 
 
162 aa  68.9  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000158895 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6235  Protein of unknown function DUF2383  27.82 
 
 
151 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1839  hypothetical protein  32.87 
 
 
150 aa  63.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.756028  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0335  hypothetical protein  33.98 
 
 
109 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.805533 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04113  hypothetical protein  41.33 
 
 
101 aa  53.5  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2261  hypothetical protein  32.61 
 
 
156 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0881857  normal  0.0318922 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0401  17 kDa surface antigen  29.01 
 
 
385 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.693676 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3555  hypothetical protein  26.95 
 
 
150 aa  47  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4091  hypothetical protein  23.48 
 
 
147 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0178  hypothetical protein  24.09 
 
 
144 aa  42.7  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>