44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1304 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1304  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  316  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.448465  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1124  hypothetical protein  73.72 
 
 		 156 aa  225  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221098  normal  0.514803 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4357  hypothetical protein  57.05 
 
 		 155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4396  hypothetical protein  53.8 
 
 		 158 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.479325  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0797  hypothetical protein  53.16 
 
 		 179 aa  167  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0820  hypothetical protein  53.16 
 
 		 158 aa  166  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.169744 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2262  hypothetical protein  51.28 
 
 		 154 aa  166  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal  0.0310926 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0831  hypothetical protein  51.27 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36530  hypothetical protein  51.37 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00120253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3135  hypothetical protein  50.68 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2293  hypothetical protein  46.15 
 
 		 320 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5437  hypothetical protein  48.65 
 
 		 150 aa  143  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1169  hypothetical protein  47.97 
 
 		 150 aa  140  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.200883 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5865  hypothetical protein  48.57 
 
 		 321 aa  138  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1113  hypothetical protein  47.86 
 
 		 317 aa  135  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1193  hypothetical protein  47.86 
 
 		 317 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1577  hypothetical protein  44.3 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1353  hypothetical protein  46.26 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0570  hypothetical protein  39.35 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1001  hypothetical protein  40.4 
 
 		 154 aa  116  9e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026081 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5302  hypothetical protein  40.97 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163208  normal  0.0551746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1446  hypothetical protein  43.17 
 
 		 330 aa  106  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1593  hypothetical protein  37.09 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1205  hypothetical protein  35.57 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512169 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2163  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  94.7  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.096246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2897  hypothetical protein  36.13 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0169773 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0760  Protein of unknown function DUF2383  35.71 
 
 		 151 aa  90.1  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.462088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1122  hypothetical protein  36.36 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234261  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0169  hypothetical protein  29.53 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1839  hypothetical protein  38.16 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.756028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2659  hypothetical protein  37.24 
 
 		 153 aa  84.3  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.295349  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3966  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  34.01 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  0.194961 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04630  hypothetical protein  29.93 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2621  hypothetical protein  32.17 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.652955 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0359  hypothetical protein  30.92 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401814  normal  0.430905 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07210  hypothetical protein  29.45 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3187  hypothetical protein  27.92 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455411  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1746  hypothetical protein  30.14 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6235  Protein of unknown function DUF2383  28.45 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00225  hypothetical protein  26.67 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0627  hypothetical protein  23.48 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4091  hypothetical protein  27.34 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3555  hypothetical protein  28.47 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2261  hypothetical protein  23.65 
 
 		 156 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0881857  normal  0.0318922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>