53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1353 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1353  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  299  8.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2293  hypothetical protein  54.17 
 
 		 320 aa  165  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0570  hypothetical protein  54.61 
 
 		 161 aa  164  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1113  hypothetical protein  55.38 
 
 		 317 aa  151  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1193  hypothetical protein  55.38 
 
 		 317 aa  149  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5437  hypothetical protein  52.14 
 
 		 150 aa  147  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1169  hypothetical protein  51.43 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.200883 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5302  hypothetical protein  51.43 
 
 		 150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163208  normal  0.0551746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5865  hypothetical protein  53.73 
 
 		 321 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2262  hypothetical protein  47.18 
 
 		 154 aa  140  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal  0.0310926 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1577  hypothetical protein  44.14 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1124  hypothetical protein  48.3 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221098  normal  0.514803 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3135  hypothetical protein  45.71 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36530  hypothetical protein  45.71 
 
 		 150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00120253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0831  hypothetical protein  47.65 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1446  hypothetical protein  56.15 
 
 		 330 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4357  hypothetical protein  51.37 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1001  hypothetical protein  44.59 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026081 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0820  hypothetical protein  46.31 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.169744 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0797  hypothetical protein  46.31 
 
 		 179 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4396  hypothetical protein  46.41 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.479325  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1304  hypothetical protein  46.26 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.448465  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07210  hypothetical protein  36.81 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2163  hypothetical protein  35.86 
 
 		 150 aa  98.6  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.096246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1593  hypothetical protein  38.19 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2897  hypothetical protein  42.14 
 
 		 152 aa  92  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0169773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0169  hypothetical protein  33.57 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3966  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  36.11 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  0.194961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3187  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455411  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1746  hypothetical protein  35.46 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1122  hypothetical protein  35.37 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234261  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1839  hypothetical protein  36.67 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.756028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2659  hypothetical protein  34.48 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.295349  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00225  hypothetical protein  29.05 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1205  hypothetical protein  35.42 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512169 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2621  hypothetical protein  34.78 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.652955 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0627  hypothetical protein  25 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04630  hypothetical protein  29.5 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4091  hypothetical protein  28.28 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0359  hypothetical protein  32.87 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401814  normal  0.430905 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0760  Protein of unknown function DUF2383  30.63 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.462088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6235  Protein of unknown function DUF2383  24.81 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3555  hypothetical protein  27.7 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2261  hypothetical protein  36.56 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0881857  normal  0.0318922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2525  hypothetical protein  29.57 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1687  hypothetical protein  29.46 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0178  hypothetical protein  22.7 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3778  hypothetical protein  27.68 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119444  normal  0.0564298 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0112  hypothetical protein  27.05 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0749559 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4024  hypothetical protein  27.68 
 
 		 150 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0131  hypothetical protein  26.23 
 
 		 145 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0271  hypothetical protein  23.19 
 
 		 175 aa  40.4  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000678514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1244  hypothetical protein  27.68 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0835823  unclonable  0.0000000177159 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>